360 पेपर
यह शोध पत्र एक इंटरलीव्ड मल्टी-मैग्निफिकेशन क्रायो-इलेक्ट्रॉन टोमोग्राफी रणनीति प्रस्तुत करता है जो एक ही टिल्ट सीरीज़ के भीतर बड़े पैमाने पर कोशिकीय संगठन और उच्च-रिज़ॉल्यूशन आणविक संरचनाओं को एक साथ कैप्चर करती है, जो प्रभावी रूप से कोशिकीय और संरचनात्मक जीव विज्ञान के बीच के अंतर को पाटती है।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि यूकेरियोटिक COMMD प्रोटीन परिवार, जो झिल्ली तस्करी (मेम्ब्रेन ट्रैफ़िकिंग) के लिए आवश्यक है, Myxococcota में पाए जाने वाले एक पूर्वज जीवाणु जीन से उत्पन्न हुआ है, जो कई दोहरावों (डुप्लिकेशंस) के माध्यम से एक हेटेरोडेकामेरिक वलय संरचना में विकसित हुआ है जो अपने प्रोकैरियोटिक पूर्ववर्तियों की होममेरिक वलय बनाने की क्षमताओं को बनाए रखता है।
परिसंचारी प्रोटिओमिक डेटा को विविध मशीन लर्निंग एल्गोरिदम के साथ एकीकृत करके, यह अध्ययन विभेदक बायोमार्कर के एक पैनल की पहचान करता है और मोटापे एवं टाइप 2 मधुमेह के भीतर महत्वपूर्ण आणविक विषमता को प्रकट करता है, जो बेहतर रोग स्तरीकरण के लिए एक ढांचा प्रदान करता है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि एक फुल-एटम MPNN-आधारित डिज़ाइन फ्रेमवर्क (FAMPNN) ने प्लांट डिहाइड्रोजनेज SrBDH1 के थर्मोस्टेबल वेरिएंट को सफलतापूर्वक इंजीनियर किया, जिसमें 10°C तक बढ़ी हुई स्थिरता और विस्तारित हाफ-लाइफ के साथ-साथ (+)-बोर्नियोल के लिए इसकी स्टीरियोसेलेक्टिविटी को पूरी तरह से संरक्षित रखा गया है।
यह अध्ययन ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर GRHL2 की अनुक्रम विशिष्टता (sequence specificity), डिमेरिक बाइंडिंग मैकेनिक्स और फ्लैंकिंग अनुक्रम प्रभावों को व्यापक रूप से परिभाषित करने के लिए एक उच्च-घनत्व वाले जीनोमिक SNAP DNA-बाइंडिंग ऐरे का उपयोग करता है, जिससे इसके प्रत्यक्ष DNA अधिभोग (occupancy) को अप्रत्यक्ष को-फैक्टर-मध्यस्थ भर्ती (cofactor-mediated recruitment) से अलग किया जा सके।
बल्क और सिंगल-सेल ट्रांसक्रिप्टोमिक विश्लेषणों को एकीकृत करके, यह अध्ययन एथेरोस्क्लेरोसिस में सात संवहनी उम्र बढ़ने से संबंधित हब जीन (TNF, MMP9 और APOE सहित) को प्रमुख नैदानिक बायोमार्कर और प्रतिरक्षा चालक के रूप में पहचानता है, साथ ही इन जीनों को लक्षित करने वाले एक संभावित चिकित्सीय एजेंट के रूप में करक्यूमिन का प्रस्ताव करता है।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि गोलाकार प्रोटीनों (globular proteins) में नेटिव एंटैंगलमेंट मिसफोल्डिंग (native entanglement misfolding) का संचय, *Saccharomyces cerevisiae* प्रोटिओम में आयु-संबंधित संरचनात्मक परिवर्तनों का एक प्रमुख चालक है, क्योंकि ये उलझे हुए क्षेत्र उम्र बढ़ने के दौरान दीर्घकालिक, निकट-नेटिव मिसफोल्डेड अवस्थाओं को बनाने के लिए काफी अधिक प्रवृत्त होते हैं।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि SIRT1 के अंतर्निहित अव्यवस्थित (intrinsically disordered) N-टर्मिनल मोटिफ A का, विशेष रूप से Ser27 पर, फॉस्फोरिलीकरण एक व्यवस्थित संरचना में संरचनात्मक फोल्डिंग को प्रेरित करता है जो एंजाइम की डीएसेटाइलेज गतिविधि को महत्वपूर्ण रूप से बढ़ाता है।
यह शोध पत्र एक संशोधित सैद्धांतिक ढांचे का प्रस्ताव करता है जो दस प्रजातियों में नव-खोजे गए अनुक्रम विविधता (sequence diversity) को समाहित करने के लिए सेफलोपोड रिफ्लेक्टिन प्रोटीन के वर्गीकरण सीमाओं का विस्तार करता है, जिससे इन गतिशील ऑप्टिकल प्रणालियों की अधिक सटीक पहचान और गहन संरचनात्मक-कार्यात्मक विश्लेषण सक्षम होता है।
यह अध्ययन *माइकोबैक्टीरियम ट्यूबरकुलोसिस* में एक नवीन तनाव-प्रतिक्रिया पथ की पहचान करता है जहाँ एंजाइम Rv1722 हाइपोक्सिक और नाइट्रिक ऑक्साइड तनाव के तहत संचित GABA और ट्रेहलोस से GABA-ट्रेहलोस मेटाबोलाइट का संश्लेषण करता है, जो प्रतिरक्षा-लगाए गए (इम्यून-इम्पोज़्ड) स्थितियों के प्रति एक पूर्व अज्ञात चयापचय अनुकूलन का प्रतिनिधित्व करता है।