1188 पेपर
यह शोध पत्र हाइपर स्क्रीनिंग एक्स (Hyper Screening X) को प्रस्तुत करता है, जो एक जनरेटिव एआई फ्रेमवर्क है जो ट्रिलियन-स्केल रासायनिक स्थानों को कुशलतापूर्वक नेविगेट करने के लिए संरचना-आधारित डिज़ाइन को स्वचालित संश्लेषण हार्डवेयर के साथ एकीकृत करता है, और उच्च संश्लेषण एवं कार्यात्मक हिट दरों के साथ प्रथम-इन-क्लास लीड यौगिकों की सफलतापूर्वक पहचान करता है।
यह अध्ययन उम्र बढ़ने वाले नर चूहे के कोलन से उच्च-अस्थायी-रिज़ॉल्यूशन (high-temporal-resolution) RNA-Seq डेटा का उपयोग करके यह प्रकट करता है कि ट्रांसक्रिप्टोमिक परिवर्तन जटिल, गैर-एकदिष्ट (non-monotonic) प्रक्षेपवक्रों और जीवन के मध्य-से-उत्तरार्ध में अनफोल्डेड प्रोटीन रिस्पॉन्स (unfolded protein response) के पतन द्वारा प्रधान होते हैं, जबकि साथ ही कालानुक्रमिक आयु को सटीक रूप से ट्रैक करने के लिए एक संक्षिप्त, तीन-जीन ट्रांसक्रिप्टोमिक क्लॉक के निर्माण को भी सक्षम बनाता है।
MOSAIC एक अनसुपरवाइज्ड फ्रेमवर्क है जो क्रायलोव सबस्पेस विश्लेषण (Krylov subspace analysis) के माध्यम से संचित डिफ्यूजन ऑपरेटर्स के अभिसरण व्यवहार (convergence behavior) का विश्लेषण करके ग्राफ नोड एम्बेडिंग्स सीखता है, जो एक बड़े पैमाने के बायोमेडिकल नॉलेज ग्राफ पर प्रदर्शित होने के अनुसार, Node2Vec और GraphSAGE जैसे मौजूदा तरीकों की तुलना में नोड क्लासिफिकेशन और लिंक प्रेडिक्शन कार्यों में बेहतर प्रदर्शन प्राप्त करता है।
यह शोध पत्र "digestome" को प्रस्तुत करता है, जो अवायवीय पाचन सूक्ष्मजीवों (anaerobic digestion microbiomes) के कार्यात्मक प्रोफाइलिंग के लिए एक व्यावसायिक रूप से लाइसेंस-मुक्त मार्कर-जीन पैनल और स्कोरिंग ढांचा है, जो मेथेनोजेनेसिस और हाइड्रोलिसिस मार्गों की पहचान करने में उच्च विशिष्टता प्रदर्शित करता है और बायोगैस ऑपरेटरों के लिए शुल्क-आधारित विश्लेषण को सक्षम करने हेतु माप संबंधी पूर्वाग्रहों को स्पष्ट रूप से ध्यान में रखता है।
Enrich.AI एक एजेंटिक AI प्लेटफॉर्म है जो सांख्यिकीय संवर्धन विश्लेषण (statistical enrichment analysis) को स्वचालित साहित्य खोज और LLM-आधारित तर्क के साथ एकीकृत करता है ताकि एक संवादात्मक इंटरफ़ेस के माध्यम से जीन सूचियों के लिए संवादात्मक, साक्ष्य-आधारित जैविक व्याख्याएं प्रदान की जा सकें।
यह शोध पत्र एक भारित पाथवे सह-सदस्यता स्कोरिंग पद्धति प्रस्तुत करता है जो जैविक रूप से सूचित प्रोटीन नेटवर्क उत्पन्न करने के लिए रिएक्टोम (Reactome) की पदानुक्रमित और अनुक्रमिक पाथवे संरचनाओं को समाहित करती है, जो कैंसर जीन प्राथमिकता निर्धारण में अत्याधुनिक दृष्टिकोणों की तुलना में बेहतर प्रदर्शन प्रदर्शित करती है।
यह शोध पत्र pre-miRBench का परिचय देता है, जो एक मानकीकृत बहु-प्रजाति बेंचमार्क और संदर्भ मॉडल है जिसे विभिन्न प्रजातियों और miRNA परिवारों में पशु पूर्ववर्ती माइक्रोआरएनए (microRNA) भविष्यवक्ताओं की निष्पक्ष तुलना सक्षम करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, जो यह प्रदर्शित करता है कि इसका एन्सेम्बल मॉडल समग्र रूप से बेहतर प्रदर्शन प्राप्त करता है और भविष्य के अनुसंधान के लिए पुनरुत्पादक संसाधन प्रदान करता है।
113 स्तनधारी प्रजातियों में NOTCH3 अनुक्रमों का विश्लेषण करके, यह अध्ययन दुर्लभ विकासवादी विचलन प्रकट करता है जो सख्त संरक्षण पैटर्न को चुनौती देते हैं और केवल सिस्टीन गणना से परे संरचनात्मक, डाइसल्फाइड और प्रोटियोलिटिक कारकों के आधार पर CADASIL रोगजनकता की व्याख्या करने के लिए एक संदर्भ-निर्भर रूपरेखा स्थापित करते हैं।
यह शोध पत्र प्रदर्शित करता है कि जीनोमिक फाउंडेशन मॉडल फाइन-ट्यूनिंग के दौरान छोटे डीएनए मोटिफ्स (DNA motifs) के माध्यम से लघु-स्तरीय डेटा पॉइजनिंग द्वारा व्यापक बैकडोर हमलों के प्रति अत्यधिक संवेदनशील हैं, जबकि वे स्वच्छ कार्यों (clean tasks) में सुदृढ़ बने रहते हैं, और यह ट्रिगर्स के पूर्व ज्ञान के बिना ऐसे खतरों का पता लगाने के लिए एक नवीन दो-चरणीय ऑडिटिंग ढांचे का प्रस्ताव करता है।
यह अध्ययन Biomni एजेंटिक प्लेटफॉर्म का उपयोग करके स्वचालित जैविक अनुसंधान वर्कफ़्लो में निहित "सत्यापन ऋण" (verification debt) को अनुभवजन्य रूप से अभिलक्षित करता है, जो एक नए VERIFY ढांचे और विविध जैविक डोमेन में AI-संचालित वैज्ञानिक निर्णयों की ट्रैसेबिलिटी और वैधता का मूल्यांकन करने के लिए मेट्रिक्स के एक सेट का प्रस्ताव करता है।