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💻 जैव सूचना विज्ञान

DPCGS: a computational framework for linking GWAS to single-cell transcriptomics in complex traits and diseases

DPCGS एक नवीन कम्प्यूटेशनल फ्रेमवर्क है जो विशिष्ट सेल उप-जनसंख्याओं (cell subpopulations) और नियामक कार्यक्रमों (regulatory programs) में आनुवंशिक जोखिम के उच्च-रिज़ॉल्यूशन मैपिंग को प्राप्त करने के लिए GWAS सारांश सांख्यिकी को सिंगल-सेल आरएनए-अनुक्रमण (single-cell RNA-sequencing) डेटा के साथ एकीकृत करता है, जो मौजूदा विधियों की तुलना में बेहतर सटीकता प्रदर्शित करता है और अल्जाइमर एवं अस्थमा जैसी जटिल बीमारियों के सेलुलर तंत्रों में नई अंतर्दृष्टि प्रदान करता है।

Liu, C., Yuan, B., Shen, B., Li, J., Zhu, R., Yang, P., Wu, B., Xuan, Y., Yang, S., Yang, N., Ma, L., Liu, Q., Dai, S. (…)2026-07-31
💻 जैव सूचना विज्ञान

AI4Life Open Calls and Public Challenges: why, how, and what we have learned.

2023 और 2025 के बीच तीन ओपन कॉल्स और तीन पब्लिक चैलेंजेस के निष्पादन के माध्यम से, AI4Life पहल ने 22 बायोइमेज विश्लेषण परियोजनाओं को सहायता प्रदान की और यह उजागर किया कि जबकि FAIR डीप लर्निंग को अपनाने में महत्वपूर्ण कार्यान्वयन बाधाएं हैं, जीव विज्ञान में वैज्ञानिक AI के लिए प्राथमिक बाधा पद्धति विकास में नहीं बल्कि डेटा, एनोटेशन और साझा बुनियादी ढांचे की उपलब्धता में निहित है।

Galinova, V., Seifi, M., Serrano Solano, B., Lidayova, K., Dalle Nogare, D., Corbat, A. A., Talks, J., Giacomello, E., G (…)2026-07-30
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Spectronaut-nf: A Nextflow Pipeline for Parallel Processing of DIA Data with Spectronaut

स्पेक्ट्रोनॉट-एनएफ (Spectronaut-nf) एक स्केलेबल नेक्स्टफ्लो (Nextflow) पाइपलाइन है जो उच्च-प्रदर्शन वाले कंप्यूटिंग वातावरणों पर बड़े पैमाने के डीआईए (DIA) प्रोटिओमिक्स डेटासेट के कुशल, समानांतर प्रसंस्करण को सक्षम बनाती है, जो सिंगल-वर्कस्टेशन या सिंगल-नोड सेटअप की तुलना में पहचान परिणामों में निरंतरता बनाए रखते हुए विश्लेषण समय को काफी कम कर देती है।

Kotimoole, C. N., Arefian, M., McKay, E. C., Kasaragod, S., Skoraczynski, G., Collins, B. C.2026-07-30
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A geometric-to-neural cascade for cerebral microbleed detection in susceptibility-weighted MRI

यह शोध पत्र एक पूर्णतः स्वचालित, तीन-चरणीय ज्यामितीय-से-तंत्रिका (geometric-to-neural) कैस्केड पाइपलाइन प्रस्तुत करता है जो संवेदनशीलता-भारित एमआरआई (susceptibility-weighted MRI) में सेरेब्रल माइक्रोब्लीड्स के उच्च-सटीकता वाले पता लगाने के लिए न्यूनतम मानव-इन-द-लूप लेबल पर प्रशिक्षित दो हल्के 3D ResNet क्लासिफायर के साथ विषय-अनुकूलित अनसुपरवाइज्ड कैंडिडेट जनरेशन को जोड़ता है, जबकि संवहनी और गैर-संवहनी मिमिक्स (vascular and non-vascular mimics) से होने वाले फॉल्स पॉजिटिव्स को महत्वपूर्ण रूप से कम करता है।

Bogdanov, S., Rudravaram, G., Saunders, A. M., Kim, M. E., LeFevre, J., Charles, J., Jain, S., Schrag, M. S., Landman, B (…)2026-07-28
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WITHDRAWN: Deviation Error: assessing machine learning predictions for replicate measurements in genomics and beyond

इस पांडुलिपि को इसलिए वापस ले लिया गया है क्योंकि मौलिक "डेविएशन एरर" (Deviation Error) मीट्रिक को मशीन लर्निंग भविष्यवाणियों का आकलन करने के लिए एक उचित स्कोरिंग नियम के रूप में स्थापित करने से पहले पर्याप्त गणितीय औपचारिकता और सैद्धांतिक सत्यापन की आवश्यकता है।

Abdulnabi, H., Westwood, J. T.2026-07-27
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Spaceland: Histology-Guided Reconstruction of High-Resolution Whole-Organ 3D Molecular Atlases from Sparse Spatial Transcriptomics

स्पेसलैंड (Spaceland) एक आकृति विज्ञान-निर्देशित (morphology-guided) कम्प्यूटेशनल ढांचा है जो विरल स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स (sparse spatial transcriptomics) को क्रमिक H&E हिस्टोलॉजी के साथ एकीकृत करके संपूर्ण अंगों के निरंतर, उच्च-रिज़ॉल्यूशन वाले 3D आणविक एटलस का पुनर्निर्माण करता है, जिससे व्यापक प्रयोगात्मक नमूनाकरण की आवश्यकता के बिना स्केलेबल वर्चुअल टिश्यू मॉडलिंग सक्षम होता है।

Xu, F., Zhuang, Z., Zhu, Y., Ying, B., Hou, N., Lin, W., Wang, L., Yang, C., song, j.2026-07-27
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Estimation of biological age using HRV data: comparison of the Klemera-Dubal method with the multiple linear regression method

यह अध्ययन 343 विषयों के हृदय गति परिवर्तनशीलता (हार्ट रेट वेरिएबिलिटी) डेटा से जैविक आयु का अनुमान लगाने के लिए मल्टीपल लीनियर रिग्रेशन (MLR), बायस-करेक्टेड MLR और क्लेमेरा-डौबल मेथड (KDM) की तुलना करता है, जिसमें यह पाया गया कि KDM न्यूनतम अनुमान त्रुटि प्रदान करता है जबकि बायस-करेक्टेड MLR, अनकरेक्टेड MLR की तुलना में बेहतर सटीकता प्रदान करता है लेकिन यह क्रोनोलॉजिकल आयु पर अपनी निर्भरता के कारण सीमित है।

Pysaruk, A.2026-07-27
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Discrete Inverse Rendering: Biological Data Analysis with Integer Programming

यह शोध पत्र एक विविक्त व्युत्क्रम रेंडरिंग (डिस्क्रीट इनवर्स रेंडरिंग) ढांचे को प्रस्तुत करता है जो जैविक छवि विश्लेषण को एक वैश्विक रूप से इष्टतम पूर्णांक प्रोग्रामिंग समस्या के रूप में सूत्रबद्ध करता है, जो डिटेक्शन, ट्रैकिंग और इवेंट इन्फरेंस को एकीकृत करके मानक स्थानीय-निर्णय पाइपलाइनों की तुलना में विशेष रूप से कम-सिग्नल इमेजिंग परिदृश्यों में काफी बेहतर प्रदर्शन करता है।

Kirkegaard, J. B., Zdyb, F. O.2026-07-27
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GPSNorm: Gaussian Process Spatial Normalization for Spatial Transcriptomics

GPSNorm एक नवीन बेयसियन स्थानिक सामान्यीकरण ढांचा (Bayesian spatial normalization framework) है जो तकनीकी भिन्नता, स्थानिक संरचना और जैविक संकेत को एक पदानुक्रमित गाऊसी प्रक्रिया दृष्टिकोण का उपयोग करके संयुक्त रूप से मॉडल करता है ताकि सामान्यीकरण अनिश्चितता को डाउनस्ट्रीम विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण में प्रसारित किया जा सके, जिससे स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स डेटा की मजबूती और व्याख्यात्मकता में सुधार होता है।

Taychameekiatchai, A., Zhan, X., Xiao, G., Ruan, P.2026-07-27
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SyntenyPair Explorer: an installation-free, browser-based tool for interactive pairwise genome synteny visualization

यह शोध पत्र सिंटेनीपेयर एक्सप्लोरर (SyntenyPair Explorer) को प्रस्तुत करता है, जो एक हल्का, बिना इंस्टॉलेशन वाला, ब्राउज़र-आधारित टूल है जो स्थानीय सॉफ़्टवेयर या सर्वर इंफ्रास्ट्रक्चर की आवश्यकता के बिना मानक तुलनात्मक जीनोमिक्स फ़ाइल स्वरूपों का उपयोग करके युग्मवार जीनोम सिंटेनी के इंटरैक्टिव विज़ुअलाइज़ेशन और अन्वेषण को सक्षम बनाता है।

Gibbons, J. G.2026-07-27