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लेखक GIFT पेश करते हैं, जो एक स्केलेबल सिंगल-सेल परख (assay) है जो फिक्स्ड ऊतकों (fixed tissues) में संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम और लक्षित दैहिक उत्परिवर्तनों (targeted somatic mutations) को एक साथ प्रोफाइल करता है, जिससे मायलोप्रोलिफेरेटिव नियोप्लाज्म (myeloproliferative neoplasms) में क्लोनल विषमता (clonal heterogeneity) और जीनोटाइप-से-फेनोटाइप संबंधों के समाधान को सक्षम बनाया जा सके।
यह अध्ययन दो ऐतिहासिक रूप से महत्वपूर्ण ट्यूनीशियाई ड्यूरम गेहूं की लैंडरेस, चिली और महमूदी के पहले गुणसूत्र-स्तर के जीनोम असेंबली और व्यापक संरचनात्मक लक्षण वर्णन को प्रस्तुत करता है, जिसमें उच्च गुणवत्ता वाले, पुनरुत्पादक जीनोमिक संसाधनों को उत्पन्न करने के लिए पैकबायो हाईफाई (PacBio HiFi) और हाई-सी (Hi-C) डेटा का उपयोग किया गया है जो मौजूदा संदर्भों से बेहतर हैं और सार्वजनिक प्लेटफार्मों के माध्यम से सुलभ हैं।
बहु-प्रजाति ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर बाइंडिंग मानचित्रों को क्रोमैटिन सुलभता और जीन अभिव्यक्ति डेटा के साथ एकीकृत करके, यह अध्ययन प्रकट करता है कि ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर बाइंडिंग साइट्स की विशिष्ट जीनोमिक स्थिति और क्रोमैटिन संदर्भ एक "पोजीशनल ग्रामर" (स्थानिक व्याकरण) स्थापित करते हैं जो पौधों में जीन विनियमन को विशिष्ट विकासात्मक, तनाव-प्रतिक्रियाशील और दमनकारी कार्यों में विभाजित करता है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि सूअरों में नाइट्रोजन उपयोग दक्षता यकृत और कंकाल की मांसपेशियों में समन्वित, ऊतक-विशिष्ट ट्रांसक्रिप्टोमिक अनुकूलन द्वारा संचालित होती है, जहाँ उच्च-दक्षता वाले पशु प्रोटीन संश्लेषण, लिपिड प्रसंस्करण और लीन विकास के लिए उन्नत मार्गों के साथ-साथ कम अमीनो एसिड अपचय और सूजन प्रदर्शित करते हैं।
यह अध्ययन एक पोर्सिन मॉडल में बल्क आरएनए सीक्वेंसिंग का उपयोग करके यह प्रकट करता है कि जबकि जीवित और उपचार-पश्चात दोनों न्यूरोसिस्टिकर्सकोसिस में प्रतिरक्षा सक्रियण शामिल है, वे विशिष्ट ट्रांसक्रिप्शनल हस्ताक्षरों को प्रदर्शित करते हैं, जिसमें जीवित संक्रमण रक्त-मस्तिष्क अवरोध (बीबीबी) पुनर्निर्माण को दबा देता है और उपचार-पश्चात व्यवधान सूजन संबंधी सिग्नलिंग और सक्रिय न्यूरोवैस्कुलर पुनर्निर्माण को प्रेरित करता है।
यह शोध पत्र simSOMA का परिचय देता है, जो एक मॉड्यूलर सिम्युलेटर है जो विविध विकासात्मक परिदृश्यों और नमूनाकरण विधियों में जटिल दैहिक वेरिएंट एलील-फ्रीक्वेंसी (VAF) स्पेक्ट्रा को मॉडल और व्याख्या करने के लिए पादप विकास टोपोलॉजी को स्पष्ट कोशिका-वंश गतिशीलता (cell-lineage dynamics) से जोड़ता है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि स्तनधारी प्लेसेंटा फेनोटाइप (placental phenotypes) माइक्रोआरएनए (microRNA) repertoires से अत्यधिक पूर्वानुमेय हैं, जो यह प्रकट करता है कि जटिल प्लेसेंटा संरचनाओं का अभिसारी विकास (convergent evolution) संरक्षित miRNA नियामक नेटवर्क द्वारा मध्यस्थ विशिष्ट, प्रतिलिपि योग्य आनुवंशिक पथों तक सीमित है।
यह अध्ययन ऑक्सफोर्ड नैनोपोर सीक्वेंसिंग के माध्यम से निर्मित, गंभीर रूप से लुप्तप्राय गैलापागोस स्थानिक *स्केलेसिया गोर्डिलोई* (*Scalesia gordilloi*) के लिए पहले उच्च-गुणवत्ता वाले, अत्यधिक निरंतर संदर्भ जीनोम को प्रस्तुत करता है, ताकि *स्केलेसिया* रेडिएशन के भीतर संरक्षण जीनोमिक्स और तुलनात्मक विकासवादी अध्ययनों के लिए एक आधारभूत संसाधन स्थापित किया जा सके।
यह शोध पत्र ग्राफ-सैद्धांतिक मेट्रिक्स, विशेष रूप से उत्कृष्ट C4 डिस्क्रिप्टर का उपयोग करने वाले एक नेटवर्क-आधारित ढांचे को प्रस्तुत करता है, जो Hi-C डेटा से सब-मेगाबेस इंटरक्रोमोसोमल इंटरैक्शन को विज़ुअलाइज़ और विश्लेषित करता है, जिससे साझा इंटरैक्शन हॉटस्पॉट और विशिष्ट नियामक पैच का पता चलता है जो क्रोमोसोमों को परमाणु आवरण (न्यूक्लियर एनवेलप) के सापेक्ष व्यवस्थित करते हैं।
यह शोध पत्र *Drosophila eugracilis* में डेंसिटी रेगुलेटेड प्रोटीन (DENR) ऑर्थोलॉग के लिए एक जीन मॉडल प्रस्तुत करता है, जिसे *Drosophila* वंश में इंसुलिन/इंसुलिन जैसा ग्रोथ फैक्टर सिग्नलिंग पाथवे के विकास का अध्ययन करने के लिए जीनोमिक्स एजुकेशन पार्टनरशिप प्रोजेक्ट के हिस्से के रूप में अभिलक्षित किया गया था।