309 पेपर
यह अध्ययन लगभग 4,700 यूकेरियोटिक जीनोमों का विश्लेषण करता है ताकि यह प्रकट किया जा सके कि स्रावित प्रोटीन (secreted proteins) को कूटबद्ध करने वाले जीन लगातार उन जीनोमिक क्षेत्रों में समृद्ध हैं जो लंबे पार्श्व इंटरजेनिक अनुक्रमों और खंडित, विखंडित दोहरावों के उच्च घनत्व द्वारा अभिलक्षित हैं, जो एक प्राचीन, संरक्षित जीनोमिक संरचना का सुझाव देते हैं जो स्रावित प्रोटीन कार्य में विकासवादी नवाचार को संचालित करती है।
यह अध्ययन सुअर के संपूर्ण रक्त की जीन अभिव्यक्ति पर आनुवंशिकी और ऊष्मा-संबंधी पर्यावरणीय कारकों के सापेक्ष प्रभावों की जांच करता है, जो हजारों विभेदित रूप से अभिव्यक्त जीनों और eQTLs की पहचान करते हुए थर्मोरेगुलेशन (ताप-नियमन) और उत्पादन लक्षणों में शामिल विशिष्ट आनुवंशिक तंत्रों और संभावित जीनों पर प्रकाश डालता है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि मैसिवली पैरेलल रिपोर्टर एसेज़ में जेनेटिक वेरिएंट्स का नियामक प्रभाव डीएनए अनुक्रम के भीतर उनकी स्थिति पर अत्यधिक निर्भर है, जो मुख्य रूप से संदर्भ-विशिष्ट ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर बाइंडिंग और एल्यू (Alu) तत्व प्रमोटर आवश्यकताओं जैसे संरचनात्मक बाधाओं के कारण है, जो सिस-नियामक व्याकरण की जटिलता को रेखांकित करता है।
लेखकों ने इन विवो मल्टीओमिक पर्टर्ब-सीक (in vivo multiomic Perturb-seq) विकसित किया है, जो एक नवीन प्लेटफॉर्म है जो अक्षम न्यूक्लियर gRNA रिकवरी की समस्या को दूर कर उच्च-सटीकता वाले, सिंगल-न्यूक्लियस मल्टीओमिक प्रोफाइलिंग को सक्षम बनाता है, जिसका उपयोग उन्होंने विकसित होते कॉर्टेक्स में न्यूरोडेवलपमेंटल डिसऑर्डर रिस्क जीन के सेल-टाइप-विशिष्ट ट्रांसक्रिप्टोमिक और एपिजेनोमिक फेनोटाइप्स को उजागर करने के लिए किया है।
यह शोधपत्र प्रयोगात्मक और अल्फाफोल्ड2 (AlphaFold2) से प्राप्त प्रोटीन संरचनाओं को नैदानिक डेटा के साथ एकीकृत करके, संरचनात्मक ज्ञान अंतराल को उजागर करने, मल्टीमेरिक इंटरफेस के महत्व पर जोर देने और रोगजनक एवं अनिश्चित वेरिएंट्स की यांत्रिक व्याख्या सक्षम करने के माध्यम से, आनुवंशिक कंकाल विकारों में जीनोमिक वेरिएंट्स की व्याख्या करने के लिए एक व्यापक, संरचना-जागरूक ढांचे को प्रस्तुत करता है।
यह अध्ययन शहरी चमगादड़ों में एक नए फाइलोवायरस सहित विविध ज़ूनोटिक वायरस का पता लगाने के लिए ब्राजील के मौजूदा रेबीज निगरानी कार्यक्रम का लाभ उठाते हुए एक स्केलेबल, लागत प्रभावी मेटाजीनोमिक निगरानी ढांचे को प्रस्तुत करता है, जिससे निम्न और मध्यम आय वाले देशों में महामारी की तैयारी के लिए एक व्यावहारिक वन हेल्थ मॉडल को प्रमाणित किया जा सके।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि किसी लक्षण की आनुवंशिक संरचना के बारे में अनुमान, विशेष रूप से SNP वंशानुक्रमिकता (heritability) और एलीलिक प्रभावों की अनुमानित दिशा के संबंध में, अध्ययन के डिज़ाइन और कोहॉर्ट प्रतिनिधित्व से महत्वपूर्ण रूप से प्रभावित होते हैं, जिसमें बाद वाला अक्सर विशिष्ट बायोबैंक के भीतर लक्षण के वितरण के विषमता (skewness) द्वारा संचालित होता है।
GWAS डेटा को मानव ट्रैबेकुलर मेशवर्क कोशिकाओं में डेक्सामेथासोन-प्रेरित क्रोमैटिन गतिशीलता के एक उच्च-रिज़ॉल्यूशन मानचित्र के साथ एकीकृत करके, यह अध्ययन 78 संभावित कारण जीन की पहचान करता है और बढ़े हुए इंट्राओकुलर दबाव और प्राइमरी ओपन-एंगल ग्लूकोमा रोगजनन के अंतर्निहित नियामक तंत्रों को स्पष्ट करता है।
यह अध्ययन 20,000 से अधिक कैंसर रोगियों के उत्परिवर्तन (म्यूटेशन) डेटा का विश्लेषण करता है जिससे यह पता चलता है कि स्टॉप-लॉस उत्परिवर्तन, जो C-टर्मिनल प्रोटीन विस्तार उत्पन्न करते हैं, ऑन्कोजीन और ट्यूमर सप्रेसर जीन में महत्वपूर्ण रूप से समृद्ध हैं और प्रोटीन प्रसंस्करण को कार्यात्मक रूप से बदल सकते हैं, जैसा कि PTMA में इम्यूनोस्टिम्युलेटरी पेप्टाइड थाइमोसिन अल्फा 1 के बाधित क्लीवेज द्वारा प्रदर्शित किया गया है।
यह अध्ययन मधुमक्खी श्रमिक रूपांतरण (metamorphosis) के दौरान सक्रिय ट्रांसक्रिप्शनल स्टार्ट साइट्स और एनहांसर्स को मैप करने के लिए CAGE तकनीक का उपयोग करता है, जो एक वंश-विशिष्ट नियामक नेटवर्क को प्रकट करता है जहाँ ट्रांसक्रिप्शन कारक ट्रैकमार्क (ttk) संभवतः ब्रॉड कॉम्प्लेक्स (Br-c) जैसे प्रमुख विकासात्मक जीनों को उन एनहांसर्स के माध्यम से नियंत्रित करता है जो विशेष रूप से एपिस (Apis) वंश के भीतर संरक्षित हैं।