🧬 जीनोमिक्स

Improved deconvolution of circulating tumor DNA from ultra-low-pass whole-genome methylation sequencing using CelFiE-ISH

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि जब CelFiE-ISH फ्रेमवर्क को ऑक्सफोर्ड नैनोपोर डेटा से अल्ट्रा-लो-पास होल-जीनोम मिथाइलेशन सीक्वेंसिंग पर लागू किया जाता है, तो यह उपकला-विशिष्ट (epithelial-specific) मिथाइलेशन मार्कर्स के एक परिष्कृत सेट का उपयोग करके 1.7–3.1% जैसे कम अंशों पर भी उपकला कैंसर (epithelial cancers) में सर्कुलेटिंग ट्यूमर डीएनए का पता लगा सकता है।

Katsman, E., Isaac, S., Darwish, A., Maoz, M., Inbar, M., Marouani, M., Unterman, I., Gugenheim, A., Salaymeh, N., Abu K (…)2026-04-18
🧬 जीनोमिक्स

Dynamic regulation of long non-coding RNAs across asexual andgametocyte development in Plasmodium falciparum

लॉन्ग-रीड डायरेक्ट आरएनए सीक्वेंसिंग, राइबोसोम प्रोफाइलिंग और सिंगल-सेल ट्रांसक्रिप्टोमिक्स को एकीकृत करके, यह अध्ययन *प्लाज्मोडियम फाल्सीपेरम* के लॉन्ग नॉन-कोडिंग आरएनए का एक सुदृढ़, चरण-विशिष्ट लक्षण वर्णन प्रदान करता है, जो परिपक्व गैमेटोसाइट्स में उनकी प्रचुरता को प्रकट करता है और यौन विकास एवं संचरण के दौरान जीन अभिव्यक्ति को विनियमित करने में महत्वपूर्ण भूमिकाओं का सुझाव देता है।

Gruenebast, J., Singhal, R., Olson, S., Bromley, R., Kanatani, S., Ko, K., Dunning Hotopp, J. C., Sinnis, P., Llinas, M. (…)2026-04-18
🧬 जीनोमिक्स

Detection of a sequence feature for recursive splicing

यह अध्ययन पहले इंट्रॉन (intron) के आसपास स्थित विशिष्ट CG-समृद्ध अनुक्रम रूपांकनों (sequence motifs) की पहचान करता है जो रिकर्सिव स्प्लिसिंग (recursive splicing) के लिए एक भविष्य कहनेवाला लक्षण के रूप में कार्य करते हैं, जो यह सुझाव देता है कि प्रारंभिक आरएनए (RNA) संश्लेषण की घटनाएं पूरे ट्रांसक्रिप्ट में इन स्थलों के उपयोग को स्थापित करती हैं।

Wang, B., Yang, K., Barash, Y., Choi, P., Mount, S. M., Larson, D. R.2026-04-17
🧬 जीनोमिक्स

Genome sequencing and multi-stage, blood-feeding, and tissue-specific transcriptome atlas of the Rocky Mountain wood tick provide a critical resource for this vector

यह अध्ययन रॉकी माउंटेन वुड टिक (*डेर्मेसेंटर एंडरसोनी*) का एक उच्च-गुणवत्ता वाला संदर्भ जीनोम और एक व्यापक बहु-चरणीय, ऊतक-विशिष्ट ट्रांसक्रिप्टोम एटलस प्रस्तुत करता है, जो इसके रक्त-चूसने वाले जीव विज्ञान को स्पष्ट करने और इसके द्वारा प्रसारित रोगों को नियंत्रित करने की रणनीतियों को आगे बढ़ाने के लिए महत्वपूर्ण संसाधन प्रदान करता है।

Tompkin, J. E., Saelao, P., Kruczalak, J., Yeo, H., Olafson, P. U., Sim, S. B., Oyen, K., Kelley, M., Corpuz, R. L., Sch (…)2026-04-17
🧬 जीनोमिक्स

Whole-genome 3D architectural screen reveals modulators of brain DNA structure

यह अध्ययन "Plate-C" को प्रस्तुत करता है, जो एक उच्च-थ्रूपुट प्लेटफॉर्म है जिसने हजारों नमूनों में संपूर्ण-जीनोम 3D संरचना के पहले बड़े पैमाने के रासायनिक स्क्रीन को सक्षम बनाया, जिससे डीएनए संरचना के विविध, मार्ग-विशिष्ट मॉड्युलेटर का अनावरण हुआ और इन विवो (in vivo) में उनके तीव्र, मस्तिष्क-व्यापी प्रभाव को प्रमाणित किया गया।

Parasar, B., Raja Venkatesh, A., Perera, J., Sosnick, L., Moghadami, S., Seo, Y., Shi, J., Chan, L., Takenawa, S., Akiya (…)2026-04-17
🧬 जीनोमिक्स

Comparing DNA extraction methods for successful PacBio HiFi sequencing: a case study of the freshwater mussel Anodonta anatina (Bivalvia: Unionidae)

यह अध्ययन मीठे पानी के मसल *Anodonta anatina* के लिए विभिन्न डीएनए निष्कर्षण विधियों का मूल्यांकन करता है, जिससे यह पता चलता है कि जबकि नैनोबाइंड (Nanobind) और सीटीएबी (CTAB) प्रोटोकॉल ताजे ऊतकों के लिए इष्टतम हैं, ओमेगा मोलस्क किट (Omega Mollusc Kit) फ्लैश-फ्रोजन नमूनों पर अप्रत्याशित रूप से उनसे बेहतर प्रदर्शन करती है, जो पैकबाय हाईफाई (PacBio HiFi) अनुक्रमण के लिए उपयुक्त डीएनए उत्पन्न करने हेतु एक व्यावहारिक और लागत प्रभावी समाधान प्रदान करती है।

Giulio, M., Lergster, U., Feulner, P. G. D., Weber, A. A.-T.2026-04-16
🧬 जीनोमिक्स

Complete Telomere-to-Telomere Assembly of the Y Chromosome in the Chinese Quartet

यह अध्ययन चाइनीज क्वार्टेट के पिता के लिए Y गुणसूत्र (CQ-chrY) का पहला पूर्ण, गैपलेस टेलोमेयर-टू-टेलोमेयर असेंबली प्रस्तुत करता है, जो जटिल पुनरावृत्ति वाले क्षेत्रों को हल करने और पूर्वी एशियाई जीनोमिक मानकों को आगे बढ़ाने के लिए एक उच्च-गुणवत्ता वाला पितृ हैप्लोटाइप संसाधन प्रदान करने हेतु मल्टी-प्लेटफॉर्म अनुक्रमण डेटा को एकीकृत करता है।

Wang, B., Wan, S., Zhang, P., Zhang, Y., Wang, X., Dong, L., Ye, K., Yang, X.2026-04-16
🧬 जीनोमिक्स

Efficient Grammar Compression via RLZ-based RePair

यह शोध पत्र RLZ-RePair का परिचय देता है, जो एक स्केलेबल एल्गोरिदम है जो मानक RePair के संपीड़न गुणवत्ता और सैद्धांतिक गुणों को बनाए रखते हुए 80% से अधिक मेमोरी कमी प्राप्त करने के लिए रिलेटिव लेम्पल-ज़िव पार्स से सटीक RePair ग्रामर का निर्माण करता है।

Varki, R., Gagie, T., Boucher, C.2026-04-15
🧬 जीनोमिक्स

CSI-SSU: Phylogenetic contamination screening of genomic datasets, demonstrated on the Protist 10,000 Genomes (P10K) database

लेखक CSI-SSU प्रस्तुत करते हैं, जो एक स्केलेबल कमांड-लाइन टूल है जो प्रोटिस्ट 10,000 जीनोम्स (P10K) पहल के 2,960 असेंबलीज़ पर इसके अनुप्रयोग द्वारा प्रदर्शित किया गया है, और यह संदूषण की जांच करने तथा टैक्सोनोमिक पहचान को मान्य करने के लिए SSU फाइलोगैनेटिक प्लेसमेंट और बैक्टीरियल BUSCO खोजों का उपयोग करता है।

Porfirio-Sousa, A. L., Jones, R. E., Brown, M. W., Lahr, D. J. G., Tice, A. K.2026-04-15
🧬 जीनोमिक्स

Lineage-specific CK2α deletion reshapes the transcriptome of hematopoietic stem cells toward an immune-primed state

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि हेमेटोपोएटिक स्टेम सेल्स में कैटेलिटिक सबयूनिट CK2α का वंश-विशिष्ट विलोपन (lineage-specific deletion), एक ऊतक-संदर्भ-निर्भर ट्रांसक्रिप्शनल रीप्रोग्रामिंग को ट्रिगर करता है जो विशिष्ट प्रतिरक्षा-संबद्ध ट्रांसक्रिप्शन कारकों द्वारा मध्यस्थ, सूजन संबंधी सिग्नलिंग और परिवर्तित कोशिका-कोशिका संचार द्वारा अभिलक्षित एक इम्यून-प्राइम्ड अवस्था की ओर ले जाता है।

Valensi, H., Rajaiah, R., Shanmugam, M., Muhammad, D., Golla, U., Mercer, K., Karampuri, A., Dovat, S., Behura, C. G., U (…)2026-04-15