genomics पेपर | Gist.Science

A subgenome-resolved and chromosome-scale reference genome assembly of allotetraploid wheat wild relative Aegilops peregrina

यह अध्ययन गेहूं के सुधार के लिए एक मजबूत जीनोमिक ढांचा प्रदान करने हेतु, पैकबायओ हाईफाई (PacBio HiFi) और हाई-सी (Hi-C) अनुक्रमण का उपयोग करके निर्मित, सूखा-सहनशील और स्टेम रस्ट-प्रतिरोधी एलोटेट्राप्लोइड गेहूं के जंगली संबंधी *एजिलोप्स पेरेग्रिना* (Aegilops peregrina) (PI 604178) का एक उच्च-गुणवत्ता वाला, सबजीनोम-रिज़ॉल्व्ड, क्रोमोसोम-स्केल संदर्भ जीनोम असेंबली प्रस्तुत करता है।

Singh, J., Gudi, S., Maughan, P. J., Gill, U., Gupta, R.2026-08-30

🧬 genomics

An Epigenetic Signature of Vulnerable Neurons is Under Selective Pressure Associated with Longevity Across Placental Mammals.

240 प्लेसेंटल स्तनधारियों में एपिजेनोमिक्स और एआई को एकीकृत करते हुए, यह अध्ययन प्रकट करता है कि न्यूरोडीजेनेरेटिव भेद्यता को चलाने वाले कोशिका-प्रकार-विशिष्ट उम्र बढ़ने के कार्यक्रम दीर्घायु प्रजातियों में विशिष्ट चयनात्मक दबावों के अधीन हैं, जो उम्र बढ़ने के एक एकल मास्टर रेगुलेटर की धारणा को चुनौती देते हैं।

Abdelhady, G., Su, Q., Wang, A. Z., Ganesan, R., Phan, B. N., Sestili, H. H., Cherupally, V., The Vertebrate Genomes Pro (…)2026-08-25

🧬 genomics

Haplotype-resolved chromosome-level genome assembly of four European white oak species

यह अध्ययन चार यूरोपीय व्हाइट ओक प्रजातियों (*Quercus robur*, *Q. petraea*, *Q. pubescens*, और *Q. frainetto*) के लिए उच्च-गुणवत्ता वाले, हैप्लोटाइप-रिज़ॉल्व्ड क्रोमोसोम-स्तरीय जीनोम असेंबली और एनोटेशन प्रस्तुत करता है, जो इस पारिस्थितिक और आर्थिक रूप से महत्वपूर्ण समूह के भीतर तुलनात्मक विश्लेषणों, पैनजीनोम निर्माण और विकासवादी अध्ययनों को आगे बढ़ाने के लिए एक मानकीकृत जीनोमिक ढांचा प्रदान करता है।

Magris, G., Avanzi, C., Bagnoli, F., Duvaux, L., Belmonte, E., Vendramin, G. G., Piotti, A., Pinosio, S.2026-08-24

🧬 genomics

Improved genome assemblies of plant-associated Streptomyces spp. as a resource for understanding plant pathogenicity in the genus

यह अध्ययन 18 स्ट्रेप्टोमाइसेस (Streptomyces) टाइप स्ट्रेन के लिए उच्च-गुणवत्ता वाले जीनोम असेंबली प्रस्तुत करता है, जो यह प्रकट करता है कि फाइटोपैथोजेनिक (पादप रोगजनक) प्रजातियों के पास बड़े जीनोम होते हैं जो चयापचय जीन से समृद्ध होते हैं, महत्वपूर्ण क्रोमोसोमल पुनर्व्यवस्था प्रदर्शित करते हैं, और रोगजनकता के लिए संरक्षित प्लास्मिड पर निर्भर नहीं होते हैं, जिससे पादप रोग तंत्र को समझने के लिए एक महत्वपूर्ण संसाधन प्राप्त होता है।

Shelley, B. A., Fabian, M. L., Nguyen, H. P., Weisberg, A. J., Chang, J. H. H., Clarke, C. R.2026-08-22

🧬 genomics

Complete mitochondrial genomes of Arizona West Nile virus vectors, Culex quinquefasciatus and Culex tarsalis

यह अध्ययन एक नवीन लॉन्ग-रेंज पीसीआर और पैसिफिक बायोसाइंसेज हाईफाई सीक्वेंसिंग पद्धति का उपयोग करते हुए, एरिज़ोना से वेस्ट नाइल वायरस के वाहकों *क्यूलेक्स क्विनक्वेफैसिएटस* और *क्यूलेक्स टारसालिस* के पहले पूर्ण माइटोकॉन्ड्रियल जीनोम की रिपोर्ट करता है, जो अद्वितीय जीनोमिक विशेषताओं को प्रकट करता है और वैश्विक वेक्टर जनसंख्या निगरानी के लिए एक नया दृष्टिकोण स्थापित करता है।

Barrand, Z. A., Ridenour, C. L., Erickson, D. E., Rivas, A. N., Schmidt, B. K., Will, J., Young, S. J., Busser, N., Town (…)2026-08-21

🧬 genomics

AlphaVaR: an R framework for the statistical interpretation of AlphaGenome variant-effect predictions

AlphaVaR एक R फ्रेमवर्क है जो AlphaGenome द्वारा उत्पन्न उच्च-मात्रा वाले, मल्टी-ट्रैक वेरिएंट-इफेक्ट भविष्यवाणियों की व्याख्या करने के लिए सांख्यिकीय विधियाँ, विज़ुअलाइज़ेशन और एक शाइनी (Shiny) एप्लिकेशन प्रदान करता है, जो DNA वेरिएंट के स्थानीयकरण, प्राथमिकता निर्धारण और जैविक सत्यापन को सक्षम बनाता है।

Marhaba, K., Maj, C., Schumacher, J., Dasmeh, P.2026-08-21

🧬 genomics

Low-heteroplasmy mitochondrial DNA mutations improve clonal reconstruction of human cells

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि कड़े त्रुटि फ़िल्टरिंग को लागू करके, कम-विषमयुग्मजी (low-heteroplasmy) माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए उत्परिवर्तनों का प्रभावी ढंग से प्रचुर, वास्तविक वंशावली बारकोड के रूप में उपयोग किया जा सकता है ताकि आनुवंशिक इंजीनियरिंग की आवश्यकता के बिना मानव कोशिकाओं में क्लोनल पुनर्निर्माण के रिज़ॉल्यूशन को महत्वपूर्ण रूप से बढ़ाया जा सके।

weng, c., Gao, T., Colgan, W., Johnson, I., Gudera, J., Poeschla, M., Weissman, J. S., Sankaran, V. G.2026-08-21

🧬 genomics

Spatial mapping of cellular and molecular plasticity in the maternal and postpartum mouse brain

मातृ चूहों के मस्तिष्क में 1.5 मिलियन कोशिकाओं का प्रोफाइल करने के लिए तीन सिंगल-सेल स्थानिक प्रौद्योगिकियों को एकीकृत करके, यह अध्ययन न्यूरॉन्स और ग्लिया में विशिष्ट गर्भावस्था-संबद्ध आणविक कार्यक्रमों को प्रकट करता है और विशिष्ट रीमॉडलिंग सर्किट में अवसाद जोखिम जीन की एक गतिशील सांद्रता की पहचान करता है, जो प्रसवोत्तर भेद्यता के लिए एक कोशिकीय आधार प्रदान करता है।

Arbabi, K., Ghazisaeidi, S., Kim, M., Kukreja, B., Feng, M. Y., Pogue, S., Hudson, H., Fafouti, M. E., Crouch, E., Galea (…)2026-08-19

🧬 genomics

Unpacking Chromatin Accessibility with Fiber-seq

यह शोध पत्र Fiber-seq के प्रयोगात्मक डिज़ाइन और डेटा विश्लेषण के लिए आवश्यक दिशा-निर्देश प्रदान करता है और संभावित त्रुटियों को रेखांकित करता है, जो कि एक उच्च-रिज़ॉल्यूशन तकनीक है जो नियामक क्षेत्रों के विस्तृत गुणात्मक विवरणों को सक्षम करने के लिए व्यक्तिगत डीएनए तंतुओं पर क्रोमैटिन पहुंच का पता लगाती है।

Bubb, K. L., Perchlik, M., Cuperus, J., Queitsch, C.2026-08-19

🧬 genomics

Chromosomal instability shapes spatial and temporal phenotypic diversity in a malignant peripheral nerve sheath tumour

नेविट बारकोडिंग के साथ सिंगल-सेल और स्पेशियल मल्टी-ओमिक्स को एकीकृत करके, यह अध्ययन यह स्पष्ट करता है कि कैसे गुणसूत्र अस्थिरता (क्रोमोसोमल इनस्टेबिलिटी) जीन डोज़ेज प्रभावों को विकासवादी शाखाओं (इवोल्यूशनरी ब्रांचिंग) और सूक्ष्म वातावरण की अंतःक्रियाओं से जोड़कर एक मैलिग्नेंट पेरिफेरल नर्व शीथ ट्यूमर की स्थानिक और कालिक फेनोटाइपिक विविधता को संचालित करती है।

Yan, H., Demeulemeester, J., Verfaillie, A., Cheng, Y., Pan, Y., Cotobal Martin, C., Ward, S., Stein, A., Lesluyes, T. (…)2026-08-18

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