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🧬 biology

Benchmarking unsupervised protein mutational effect predictors: practical guidelines for protein engineering and reduced accuracy at beneficial residues

यह शोध पत्र प्रोटीन इंजीनियरिंग के लिए व्यावहारिक दिशा-निर्देश प्रदान करने हेतु बड़े पैमाने के डीप म्यूटेशनल स्कैनिंग डेटा का उपयोग करके तीन मुख्य अनसुपरवाइज्ड प्रोटीन म्यूटेशनल प्रभाव भविष्यवक्ताओं (अनसुपरवाइज्ड प्रोटीन म्यूटेशनल इफेक्ट प्रेडिक्टर्स) का बेंचमार्किंग करता है और साथ ही विशिष्ट संरचनात्मक या भौतिक-रासायनिक संदर्भों के भीतर गेन-ऑफ-फंक्शन उत्परिवर्तनों और अवशेषों (रेसिड्यूज़) की भविष्यवाणी करने में निरंतर सीमाओं को प्रकट करता है।

Teppei Deguchi, Yoichi Kurumida, Kaito Kobayashi, Yutaka Saito2026-08-31
🧬 biology

Detectability of landscape-genetic signal in fragmented landscapes: habitat area, configuration, dispersal, and the dual role of corridors

व्यक्तिगत-आधारित सिमुलेशन का उपयोग करते हुए, यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि परिदृश्य-आनुवंशिक संकेतों (landscape-genetic signals) की पता लगाने की क्षमता आवास क्षेत्र, विन्यास और प्रकीर्णन क्षमता के बीच जटिल अंतःक्रियाओं द्वारा शासित होती है, जो यह प्रकट करती है कि जबकि गलियारे (corridors) निरंतर आनुवंशिक विविधता को बढ़ाते हैं, वे अक्सर आनुवंशिक विभेदन प्रवणता (genetic differentiation gradients) को कम करके परिदृश्य प्रतिरोध की सांख्यिकीय पता लगाने की क्षमता को कम कर देते हैं।

Samuel A. Cushman2026-08-31
🧬 biology

Single-cell Transcriptomic Profiling Reveals Novel Stem Cell Markers for Corneal Limbal Epithelium Homeostasis

यह अध्ययन कॉर्नियल लिम्बस के ट्रांसक्रिप्टोमिक एटलस को निर्मित करने के लिए Sox9-EGFP द्वारा निर्देशित सिंगल-सेल आरएनए सीक्वेंसिंग का उपयोग करता है, जो विशिष्ट सेल क्लस्टर्स की पहचान करता है और कॉर्नियल एपिथेलियल होमियोस्टेसिस बनाए रखने के लिए आवश्यक नवीन स्टेम सेल मार्कर्स (Gabrp, Fmo1, Fmo2, और Alcam) को मान्य करता है।

Qiang Zhou, Victor Guaiquil, Maria Paula Zappia, Jin-Hong Chang, Gongyu Tang, Mauricio Gonzalez Oyarzun, Minsu Cho, Joy (…)2026-08-31
🧬 biology

Genome-centered characterization of the microbial communities in llamas’ forestomach via whole-genome shotgun metagenomics

यह अध्ययन लामा के फोरस्टोमैक (forestomach) माइक्रोबायोम को चरित्रित करने के लिए जीनोम-रिज़ॉल्व्ड मेटाजेनोमिक्स का उपयोग करता है, जिसमें 165 मेटाजीनोम-असेंबल किए गए जीनोमों का पुनर्निर्माण किया गया है जो अनछुए सूक्ष्मजीव विविधता के उच्च स्तर और पादप पॉलीसैकराइड क्षरण के लिए प्रमुख चयापचय पथों को प्रकट करते हैं जो मेजबान पोषण के लिए आवश्यक हैं।

José Matías Irazoqui, Nadia Ramos, Pablo Farace, Abimael Ortiz-Chura, Ariel Amadio, José Gere, Silvio Cravero, María Esp (…)2026-08-31
🧬 biology

Integrating single-cell and bulk transcriptomic perturbation resources reveals complementary therapeutic spaces for drug repurposing

यह अध्ययन CDRPipe को प्रस्तुत करता है, जो एक एकीकृत कम्प्यूटेशनल ढांचा है जो संसाधन विखंडन को दूर करने के लिए माइक्रोअरे और सिंगल-सेल-व्युत्पन्न ट्रांसक्रिप्टोमिक परटर्बेशन डेटा को एकीकृत करता है, यह प्रदर्शित करते हुए कि इन पूरक स्रोतों को संयोजित करना किसी भी एक संसाधन के अकेले उपयोग की तुलना में चिकित्सीय कवरेज का महत्वपूर्ण विस्तार करता है और उच्च-विश्वास वाले ड्रग रिपर्पजिंग उम्मीदवारों की पहचान करता है।

Enock Niyonkuru, Umair Khan, Xinyu Tang, Laura Almonte, Eden Chun, Brenda Ametepe, Carlota Pereda Serras, Boris Oskotsky (…)2026-08-31
🧬 biology

A Carrier Co-Precipitation Method for the Improved Extraction of Algal Exopolymeric Substances

यह शोध पत्र *Coscinodiscus radiatus* से एल्गल एक्सोपॉलीमेरिक सबस्टेंस के निष्कर्षण को महत्वपूर्ण रूप से सुधारने और डाउनस्ट्रीम बायोटेक्नोलॉजिकल अनुप्रयोगों के लिए इसे सुव्यवस्थित करने हेतु कैल्शियम कार्बोनेट और मैग्नीशियम सल्फेट का उपयोग करते हुए एक मजबूत कैरियर को-प्रिसिपिटेशन विधि प्रस्तुत करता है।

Dylan Jones, Thomas Bell, Juan Miguel Bonnin Carreon, Viktoria Kramerova, Zongzhuan Shen, Fengjie Liu, Andriy Shevchuk2026-08-31
🧬 biology

Genetic Landscape of Hereditary Spastic Paraplegia in Iran: Insights from Novel variants and Genotype-Phenotype Correlations

यह अध्ययन एक्सोम अनुक्रमण (exome sequencing) का उपयोग करके वंशानुगत स्पास्टिक पैराप्लेजिया (hereditary spastic paraplegia) वाले 74 ईरानी रोगियों का विश्लेषण करता है, जिसमें 80% आणविक नैदानिक दर प्राप्त की गई है, नए वेरिएंट्स के उच्च अनुपात की पहचान की गई है जिसमें *SPG11* सबसे अधिक उत्परिवर्तित जीन के रूप में है, और इस आबादी में रोग के आनुवंशिक परिदृश्य को बेहतर ढंग से समझने के लिए विविध जीनोटाइप-फेनोटाइप सहसंबंधों को स्थापित किया गया है।

Salimeh Hashempour, Masoome Alerasool, Reza Mousavi Ardehaie, Atieh Eslahi, Mehran Beiraghi Toosi, Shadab Salehpour, Par (…)2026-08-31
🧬 biology

Early AMPA receptor potentiation modifies synaptic maturation and disease progression in Rett models

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि एएमपीए (AMPA) रिसेप्टर पोटेंशिएटर CX1632 के साथ प्रारंभिक नवजात उपचार, न्यूरोनल परिपक्वता को पुनर्जीवित करके, रेट सिंड्रोम माउस मॉडल में उत्तरजीविता, व्यवहार और सिनैप्टिक कार्य में स्थायी सुधार प्रेरित करता है, जबकि बाद के हस्तक्षेप के साथ चिकित्सीय प्रभावकारिता महत्वपूर्ण रूप से घट जाती है, जो प्रभावी उपचार के लिए विकासात्मक समय के महत्वपूर्ण महत्व को रेखांकित करता है।

Nicoletta Landsberger, Giuseppina De Rocco, Andrea de Donato, Marzia Indrigo, Virginia Varotto, Martina Geusa, Stefano T (…)2026-08-31
🧬 biology

Molecular Insights into PKA Activity Modulation by Lysine Acetylation

यह अध्ययन प्रकट करता है कि PKA उत्प्रेरक उपइकाई का लाइसिन एसिटिलीकरण एक cAMP-स्वतंत्र तंत्र के माध्यम से स्तनधारी शुक्राणु कैपसिटेशन के दौरान काइनेज गतिविधि को बनाए रखता है जो ATP बाइंडिंग आत्मीयता को बढ़ाता है और होलोएंजाइम पृथक्करण को बढ़ावा देता है।

Analia G Novero, Iñaki Gentile, Franco A Biglione, Arturo Matamoros Volante, Carla Ritagliati, Tomás Steeman, Mariano G (…)2026-08-31
🧬 biology

A multi-layer computational framework for structural prioritization of transcriptome-derived proteins

यह शोध पत्र एक बहु-स्तरीय कम्प्यूटेशनल ढांचे को प्रस्तुत करता है जो बड़े पैमाने के ट्रांसक्रिप्टोमिक डेटासेट से संरचनात्मक रूप से सुदृढ़ प्रोटीन उम्मीदवारों को प्रभावी ढंग से प्राथमिकता देने और मान्य करने के लिए तुलनात्मक मॉडलिंग, अल्फाफोल्ड 3 रिफाइनमेंट, डॉकिंग और आणविक गतिशीलता सिमुलेशन को एकीकृत करता है।

Ângela Benevides, João A. Teodoro, Tales A. Costa-Silva, Danilo T. Amaral2026-08-31