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Questo studio utilizza l'analisi genomica a lettura lunga e la modellazione strutturale per identificare e caratterizzare 35 adesine RTX in sette specie batteriche, superando le limitazioni delle tecnologie a lettura corta dovute alla natura ripetitiva di queste proteine e fornendo una base fondamentale per lo sviluppo di strategie anti-colonizzazione.
Gli autori hanno ottimizzato l'espressione e la purificazione della proteina STEAP1 umana, dimostrando che l'espressione stabile favorisce l'incorporazione di eme, l'omogeneità e il corretto ripiegamento trimerico funzionale, fornendo strategie chiave per lo sviluppo terapeutico del cancro alla prostata.
Uno studio che combina l'uso di acqua deuterata e lipidomica ad alta risoluzione ha rivelato che il turnover dei lipidi della mielina è estremamente eterogeneo e dipende dalla classe lipidica, dal canale di traffico dell'ApoE e dall'età, mostrando un marcato rallentamento del rinnovamento mielinico durante l'invecchiamento.
Questo studio rivela come il riboswitch batterico alx integri segnali di pH e manganese attraverso un rimodellamento allosterico dell'RNA, in cui l'ambiente alcalino favorisce la conformazione attiva necessaria per il sensing del metallo e l'attivazione della risposta allo stress.
Questo studio dimostra che l'assimilazione microbica di composti organosolfurati come DMS e DMSO può avvenire attraverso meccanismi non enzimatici guidati da fattori geochimici (luce e calore), sfidando la visione tradizionale secondo cui tali processi metabolici richiedono necessariamente enzimi specifici.
Lo studio rivela che i coniugati glicinici di indolo-3-carbossilati, metaboliti derivati dal triptofano e prodotti attraverso interazioni ospite-microbiota, agiscono come ligandi endogeni del recettore degli idrocarburi aromatici (AHR) nell'uomo, evidenziando un inaspettato collegamento fisiologico tra piante, microbi e esseri umani.
Utilizzando l'imaging spettrometrico di massa su calli fratturati di topi giovani e anziani, lo studio dimostra come l'invecchiamento ritardi la guarigione ossea bloccando la transizione dal tessuto cartilagineo a quello osseo, come evidenziato da un profilo proteico che mantiene alti livelli di collagene cartilagineo e riduce quello osseo.
Questo studio dimostra che l'interazione ad alta affinità tra ligandi e fibrille amiloidi avviene attraverso due modalità di legame topologicamente distinte, fornendo nuovi principi di progettazione per migliorare l'efficacia dei ligandi e sviluppare biomarcatori per le malattie neurodegenerative.
Questo studio utilizza analisi multi-omiche su topi per dimostrare che le interazioni tra acidi grassi dietetici e microbiota intestinale modellano in modo unico il metabolismo lipidico dell'ospite, influenzando direttamente l'omeostasi lipidica e i mediatori infiammatori epatici con implicazioni per le malattie cardiometaboliche.
Lo studio decifra il meccanismo d'azione dell'antagonista TGFβ del parassita *Heligmosomoides polygyrus*, rivelando il ruolo cruciale di LRP1 e betaglicano nella sua specificità cellulare e permettendo la progettazione razionale di nuovi modulatori di TGFβ programmabili e specifici per tipo cellulare.
Lo studio dimostra che le modifiche strutturali agli antibiotici ossazolidinoni, come nel caso di tedizolid e delpazolid, alterano in modo significativo la loro preferenza di arresto della sintesi proteica e la conformazione del peptide nascente all'interno del ribosoma.
L'analisi biochimica e computazionale rivela che la criptocromo 4a del pettirosso europeo (ErCRY4a) non lega i cromofori antenna 8-HDF e MTHF, suggerendo che questa proteina funzioni esclusivamente con il cofattore FAD, a differenza della maggior parte delle fotoliasi.
Il paper presenta AlphaFast, un framework che integra la ricerca di sequenze MMseqs2 accelerata da GPU per eliminare il collo di bottiglia nella generazione delle allineamenti di sequenze multiple (MSA) di AlphaFold 3, ottenendo un aumento della velocità fino a 68,5 volte e una riduzione dei costi di esecuzione mantenendo la stessa accuratezza strutturale.
Gli autori dimostrano che l'introduzione di residui di prolina nel dominio prionico di FUS per interrompere la formazione di foglietti β previene l'aggregazione tossica e la transizione liquido-solido senza compromettere le funzioni fisiologiche o la separazione di fase, offrendo una strategia terapeutica per le malattie neurodegenerative associate.
Gli autori hanno ricostituito su membrane supportate la comunicazione e i circuiti di feedback tra la GTPasi Ras e la PI3Kγ, dimostrando come un feedback positivo indotto dalla luce possa superare l'inibizione globale per generare onde di attivazione spazialmente localizzate di Ras e PIP3.
Questo studio presenta la prima struttura a microscopia crioelettronica del canale TRPM1 umano nello stato conduttivo, rivelando una topologia inedita a dominio scambiato che spiega la sua attività costitutiva e fornisce nuove basi per comprendere le disfunzioni legate alla cecità notturna congenita.
Gli autori hanno caratterizzato strutturalmente e ingegnerizzato un sistema enzimatico P450 per ottimizzare la O-demetilazione dei monomeri ligninici derivati dal legno duro, permettendo così la loro efficiente conversione biochimica in un biocatalizzatore batterico.
Gli autori hanno sviluppato la tecnica GATO-seq e utilizzato la criomicroscopia elettronica per identificare una sequenza specifica che induce un "super arresto" della RNA polimerasi II, stabilizzando uno stato di retrocessione reversibile ("sidetracked") che non viene risolto dal fattore TF IIS, dimostrando così come la sequenza nucleotidica codifichi direttamente la propensione all'arresto trascrizionale.
Questo studio decifra e dimostra la possibilità di ingegnerizzare il codice strutturale di specificità assemblativa che governa l'interazione tra le subunità CRA nelle ligasi E3 di tipo GID/CTLH, rivelando come mutazioni mirate possano riprogrammare la loro architettura ad anello.
In questo studio vengono sviluppati sonde chemiluminescenti basate su dioxetani che reagiscono selettivamente con l'enzima ClbP, permettendo una rapida e sensibile identificazione diretta dei batteri produttori di colibactin, inclusi ceppi di *E. coli*, anche in complessi campioni fecali.