🧬 biology

FUSION: a multimodal graph-based structural AI framework for interpretable somatic cancer driver mutation prediction

Il documento presenta FUSION, un framework di IA multimodale basato su grafi che integra embedding di modelli linguistici proteici, topologia strutturale derivata da AlphaFold2 ed ensemble conformazionali per predire e interpretare accuratamente le mutazioni driver somatiche del cancro, in particolare per varianti missenso rare prive di precedenti evidenze cliniche.

Lucas Moraes dos Santos, Tatiane Senna Bialves, Luana Luiza Bastos, José Gutembergue de Mendonça Silva, Sheila Cruz Arau (…)2026-08-31
🧬 biology

PRS-CARV: A summary statistics framework for integrating annotation-informed rare variants to improve polygenic risk prediction

Il documento presenta PRS-CARV, un framework di statistiche riassuntive che integra punteggi di carico di varianti rare informati dalle annotazioni con punteggi di rischio poligenico per varianti comuni per migliorare significativamente la predizione dei tratti lipidici e far progredire la medicina di precisione.

Yu Zhang, Geyu Zhou, Ming Li, Kelli K. Ryckman, Mitali Ray, Christina Scifres, Nathan R Blue, Alexa Freedman, Jasmina Va (…)2026-08-31
🧬 biology

Biophysically relevant network model of the piriform cortex predicts odor frequency encoding using network mechanisms

Questo studio utilizza un modello di rete biofisicamente rilevante per dimostrare che la corteccia piriforme codifica le informazioni sulla frequenza degli odori (2 Hz rispetto a 20 Hz) attraverso un meccanismo di popolazione altamente distribuito, in cui l'attività mediata sulle prove consente una discriminazione ad alta accuratezza che è modulata bidirezionalmente da specifici motivi di circuito che coinvolgono connessioni di feedback, feedforward e ricorrenti.

Ankit Kumar, Om Chaudhari, Manan Jindal, Ashutosh Modi, Debanjan Dasgupta2026-08-31
🧬 biology

Production, Purification and Characterization of Thermostable Amylase from Thermophilic Bacteria Isolated from Water and Sediments of Wanzaye Hot Spring, Ethiopia

Questo studio identifica e caratterizza le α\alpha-amilasi termostabili prodotte da specie di *Bacillus* isolate dalla sorgente termale di Wanzaye in Etiopia, dimostrando la loro attività ottimale ad alte temperature e in ampi intervalli di pH, nonché la loro elevata efficienza nell'idrolizzare l'amido grezzo di enset per potenziali applicazioni industriali.

Gebrekidan Welegerima Bezabh, Berhanu Andualem Tsehai, Mesfin Angaw Tesfay, Gebretsadkan Berhe Debre2026-08-31
🧬 biology

Inhibitors for a conserved filarial catechol-O-methyltransferase possess in vivo curative potency against Brugia malayi infection

Questo studio identifica una catecol-O-metiltransferasi conservata e specifica del parassita (BmMT) come un nuovo bersaglio farmacologico per la filariasi linfatica e dimostra che i suoi inibitori selettivi eliminano efficacemente le infezioni da *Brugia malayi in vivo* bloccando il metabolismo delle catecolammine.

Md Mukthar Mia, Md Fulbabu Sk, Bhesh Paudel, Abdur Azam, Idrees Allaie, Xuejin Zhang, Emad Tajkhorshid, William Witola2026-08-31
🧬 biology

Evaluation of Estrogen Responsiveness and Sensitivity to Endocrine Therapy in ER-Positive Breast Cancer Organoids Using an Optimized Culture Medium

Questo studio ha sviluppato un terreno di coltura ottimizzato (BH-SAM) riducendo i fattori di crescita specifici per ripristinare la responsività estrogenica negli organoidi di cancro al seno ER-positivi, consentendo saggi funzionali affidabili per lo screening della resistenza alla terapia endocrina e l'identificazione di trattamenti alternativi personalizzati.

Hiroyuki Uematsu, Roberto Coppo, Chieko Saito, Jumpei Kondo, Masahiro Takada, Masahiro Inoue2026-08-31
🧬 biology

Spatiotemporal Dynamics of Planktonic Bacterial Communities and Their Assembly Mechanisms in a Newly Created Riverine Reservoir

Uno studio stagionale del neoformato bacino idrico di Guandaoqiao rivela che, sebbene le abbondanti e le rare subcomunità batteriche planctoniche condividano taxa dominanti, esse esibiscono distinti meccanismi di assemblaggio stagionale — passando da processi deterministici a stocastici per i taxa rari — e che l'immissione del bacino indebolisce significativamente la robustezza della rete, con i taxa rari che fungono da specie chiave.

Yong Li, Jianping Wang, Jiankun Du, Yajie Li, Rui Zhu, Jiarui Liu, Lisiyi Lai, Zhilian Gong2026-08-31
🧬 biology

Lactylation-driven SENP1 promotes colon cancer malignant progression by mediating FRS2 deSUMOylation modification

Questo studio rivela che la lattilazione dell'istone H3K18 guida la progressione del cancro al colon attraverso l'upregulation della trascrizione di SENP1, la quale a sua volta stabilizza FRS2 tramite deSUMoilazione per potenziare la proliferazione tumorale, la metastasi e la glicolisi.

Yichen Li, Chenglong Shen, Yixin Tang, Jiazhe Shao, Haichen Liu, Yuchao Wang, Guoqiang Zhou, Zhi-Liang Shi2026-08-31
🧬 biology

Predicting Lassa Virus Glycoprotein Mutations Affecting Viral Entry and Antibody Escape

Questo studio presenta un framework integrato di machine learning utilizzando XGBoost per prevedere come le mutazioni della glicoproteina del virus Lassa influenzino l'ingresso virale e l'evasione anticorpale, identificando così gli epitopi conservati e guidando la progettazione di vaccini e terapie ampiamente efficaci.

Oluremi Israel Ajayi, Blessing Oluwatobi Olorunfemi, Jolly Amoche Adole, Amoge Chidinma Ogu, Ifeoluwa O. Bejide, Blossom (…)2026-08-31
🧬 biology

Integrated analysis of single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing reveals T-cell-associated prognostic risk models and the regulation of the tumour immune microenvironment in colorectal cancer

Integrando i dati di sequenziamento dell'RNA a singola cella e bulk, questo studio identifica un modello prognostico relativo alle cellule T composto da sei geni per il cancro del colon-retto che stratifica accuratamente il rischio di sopravvivenza dei pazienti e caratterizza il relativo microambiente tumorale immunosoppressivo.

Xiangli Yin, Yiyan Zhai, Xiaodong Chen, Jiangying Liu, Haojia Wang, Peiying Lu, Junyi Li, Muyassar Mamattohti, Tianzhu Z (…)2026-08-31