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🧬 biologia

Constructed negatives determine the population a benchmark can rank over

Questo articolo sostiene che le classifiche dei benchmark siano fondamentalmente limitate dall'esclusione di entità scarsamente annotate durante la costruzione dei negativi, dimostrando che alti tassi di omissione (W > 0,5) impediscono un ordinamento rigoroso dei modelli e sollecitando la comunità a riportare in modo trasparente le definizioni dei target, il supporto al campionamento e le evidenze per i confronti.

Justin Li2026-10-06
🧬 biologia

Allosteric Targeting of the KEAP1 BTB Homodimerisation Interface: Structure-Based Virtual Screening Identifies Indazole and Benzimidazole Scaffolds

Questo studio impiega lo screening virtuale basato sulla struttura per identificare scaffold di indazolo e benzimidazolo come nuovi inibitori allosterici farmacologicamente simili che prendono di mira l'interfaccia di omodimerizzazione BTB di KEAP1 precedentemente inesplorata, offrendo un potenziale meccanismo di prima classe per attivare NRF2 e modulare la ferroptosi indipendentemente dalle esistenti strategie di alchilazione dei residui di cisteina o di competizione con il dominio Kelch.

Cumhur Gokhan Ekmekci2026-10-06
🧬 biologia

Can Leukocyte Glucose Consumption Explain the HbA1c Reduction After BCG Vaccination in Long-Standing Type 1 Diabetes? A Quantitative Plausibility Analysis

Questa analisi di plausibilità quantitativa conclude che l'aumento del consumo di glucosio da parte dei leucociti in seguito alla vaccinazione con BCG difficilmente può spiegare le riduzioni di HbA1c osservate nel diabete di tipo 1 di lunga data, a meno che l'intero sistema immunitario non subisca una riprogrammazione diffusa sotto ipotesi altamente permissive.

Luis Jesuino de Oliveira Andrade, Gabriela Correia Matos de Oliveira, Osmário Jorge de Mattos Salles, Alcina Maria Vinha (…)2026-10-06
🧬 biologia

Bark Functional Traits and Phytochemical Diversity in Forest Trees: A Systematic Review and Meta-Analysis of Ecological Functions and Sustainable Utilization

Questa revisione sistematica e meta-analisi sintetizza le evidenze globali sulla diversità anatomica, chimica e funzionale della corteccia degli alberi, dimostrando il suo significativo potenziale come risorsa sottoutilizzata per bioeconomie sostenibili attraverso applicazioni medicinali e industriali ad alto valore.

Brian Mulenga Nsofu, Mutinta Muleya, Adams Kazoni, Kasamba Hatimbula, Kapaya Hope2026-10-06
🧬 biologia

Virtual Screening of the p62/SQSTM1–KEAP1 Interaction Interface in KRAS-Mutant Colorectal Cancer: Pan-Kelch Binding and a p62-Selective Aminobenzothiazole Scaffold

Questo studio dimostra che lo screening virtuale di target del cancro del colon-retto con mutazione KRAS rivela un dominio Kelch di KEAP1 che lega i composti in modo prevalentemente pan-selettivo piuttosto che distinguere tra i siti p62 KIR e NRF2 ETGE, identificando lo scaffold aminobenzotiazolico Arg_Anchor_004 come un punto di partenza unico e moderatamente preferenziale per p62 per una potenziale soppressione della doppia via di NRF2.

Cumhur Gokhan Ekmekci2026-10-06
🧬 biologia

Ketone Body Scaffolds and SIRT1 Activators as PPAR-δ Ligands: A Structure-Based Virtual Screening Study in the Context of Intestinal Stem Cell Biology

Questo studio di screening virtuale basato sulla struttura caratterizza l'interazione di PPAR-δ con scaffold di corpi chetonici e attivatori di SIRT1, suggerendo un modello di sensibilizzazione allosterica per i chetoni endogeni, un ruolo di legame diretto per gli attivatori di SIRT1, e identificando lo scaffold progettato AcAc_biphenyl_001 come un promettente lead di tipo farmacologico per ulteriore validazione nella biologia delle cellule staminali intestinali.

Cumhur Gokhan Ekmekci2026-10-06
🧬 biologia

In-molecule machine learning with microfluidic integrated DNA neural computing

Questo articolo introduce il chip DMIC (DNA-encoded microfluidic integrated computing), un'architettura bioelettronica ibrida che utilizza goccioline controllabili e una matrice di elettrodi 2D per scalare le reti neurali a DNA per l'apprendimento automatico in-molecola, consentendo il riconoscimento di pattern complessi e la diagnosi oncologica multiclasse attraverso l'addestramento e l'esecuzione in chip di algoritmi quali SVM, CNN e FCNN.

Chunhai Fan, Mengyao Cao, Xiewei Xiong, Jianing Wang, Na Li, Bowen Li, Yun Zhu, Tong Zhu, Fei Wang, Longqian Xu, Jiajian (…)2026-10-06
🧬 biologia

Chromatin-associated intronic RNAs from long genes form introsomes that shape nuclear architecture in neuronal cells

Questo studio rivela che durante la differenziazione neuronale, i geni eccezionalmente lunghi producono RNA intronici persistenti chiamati TIR che formano scaffold nucleari di tipo "introsoma" per organizzare l'architettura del genoma 3D e co-regolare l'espressione genica neuronale, collegando potenzialmente questo meccanismo unico alla patogenesi dei disturbi dello sviluppo neurologico.

Magda Bienko, Wenjing Kang, Wing Yip, Xiaoze Li-Wang, Quentin Verron, Britta Bouwman, Simona Pedrotti, Andrea Abou Yaghi (…)2026-10-06
🧬 biologia

Evidence of demographic buffering in aging rates but not in juvenile mortality across mammals

Questo studio su 372 specie di mammiferi fornisce un supporto qualificato all'ipotesi del buffering demografico, confermando che le specie a vita lenta esibiscono una ridotta variazione nei tassi di mortalità adulta e di invecchiamento, ma non riscontrando alcuna prova sistematica che le specie a vita veloce tamponino similmente la mortalità giovanile contro la variabilità ambientale.

Fernando Colchero, Jad Daou, Johanna Staerk, Susan Alberts, Jenny Tung2026-10-05
🧬 biologia

Genome-wide association analysis of body size and growth traits in Guanling cattle and mining of key candidate genes

Questo studio ha utilizzato il risequenziamento dell'intero genoma e l'analisi GWAS su 69 capi di bovini Guanling per identificare 15 SNP significativi e 19 geni candidati, inclusi INSC e LPL, che sottendono la complessa architettura genetica della conformazione corporea e dei tratti di crescita, offrendo preziosi target per la futura selezione assistita da marcatori.

Xin Wang, Bo Yu, Di Zhou, Rong Yang, Yanli Lv, Yuanfeng Zhao, Junda Wu, Kaikai Zhang, Wenzhang Zhou, Jing Liu, Longxin X (…)2026-10-05