🧬 biologia

Distinct cortical immune-signaling profiles in autism spectrum disorder and severe mental illness

Questo studio rivela che, sebbene sia il disturbo dello spettro autistico che la malattia mentale grave comportino una segnalazione neuroimmunitaria corticale alterata, essi esibiscono profili proteici distinti piuttosto che uno stato infiammatorio condiviso, con l'ASD caratterizzato da un aumento dei marcatori correlati all'IL-1 e la SMI da un aumento dell'eotassina.

Evan Haley, Erin L. Carlson, Kari L. Hanson, Alicja Omanska, Joseph Schauer, Sabrina Ereshefsky, Dana Tzuahzia Lee, Rebe (…)2026-09-25
🧬 biologia

Brain-inspired cascaded EEG speech decoding with conformal calibration and adaptive exit: simulation validation and five-stage real-data assessment

Questo articolo propone e valida un framework di decodifica del parlato EEG a cascata ispirato al cervello che integra la calibrazione conforme con meccanismi di uscita adattiva e l'inferenza conforme adattiva di Gibbs–Candès per ottenere una quantificazione dell'incertezza statisticamente rigorosa e prestazioni in tempo reale robuste, diagnosticando sistematicamente i fallimenti di copertura ed établendo basi metodologiche per un tracciamento neurale del parlato affidabile.

daqian chen2026-09-25
🧬 biologia

External Transportability and Tissue Context of Parsimonious Breast Tumour-Normal Transcriptomic Score

Questo studio dimostra che un punteggio trascrittomico parsimonioso tumore-normale del carcinoma mammario, pur mantenendo un'elevata discriminazione esterna, cattura principalmente la perdita dei programmi adiposi e del metabolismo lipidico piuttosto che una esclusivamente portabile firma delle cellule maligne, evidenziando il ruolo critico del contesto tissutale nella trasportabilità dei classificatori.

Subhajit Ghosh, Abhirup Saha, Vetrivel Baskar2026-09-25
🧬 biologia

An Explainable XGBoost Framework for Anxiety and Depression Risk Prediction with SHAP and Counterfactual Reasoning

Questo studio presenta un framework XGBoost spiegabile per la previsione del rischio di ansia e depressione che affronta lo sbilanciamento delle classi e il rigore della valutazione, integrando al contempo SHAP e il ragionamento controfattuale per fornire approfondimenti trasparenti e interpretabili sulle decisioni del modello senza sostituire la diagnosi clinica.

Anima Dahal, Bibash Basnet2026-09-25
🧬 biologia

A high-quality chromosome-level genome assembly and annotation of the Gansu Red Deer (Cervus elaphus kansuensis)

Questo studio presenta un assemblaggio e un'annotazione del genoma di riferimento ad alta qualità, a livello cromosomico, del cervo rosso del Gansu (Cervus elaphus kansuensis), endemico e protetto a livello nazionale, fornendo una risorsa genomica cruciale per far progredire la ricerca futura sulla sua diversità genetica, la sua storia evolutiva e la sua conservazione.

Hai Liu, Yun Fang, Xiaochan Bai, Zuoqing Yan, Qingling Wa, Nan Sun, Guogang Li2026-09-25
🧬 biologia

HiDAC: A Hierarchical Dictionary-Aided Compression Framework for Genomic Sequences

Il documento propone HiDAC, un framework di compressione gerarchica assistita da dizionario che raggiunge rapporti di compressione del DNA competitivi, consentendo al contempo un'analisi a valle significativamente più veloce, come le query sulla frequenza delle sottostringhe, direttamente sulla rappresentazione tokenizzata compressa senza decompressione completa.

Manthan Shah, Rahul Semwal, Imlimaong Aier, Prabhat Tripathi, Pritish Kumar Vardwaj2026-09-25
🧬 biologia

Carbon-Convergent Co-utilization of Ethanol and CO2 Enables 3-Hydroxypropionate Biosynthesis in Komagataella phaffii

Questo studio dimostra che il ceppo ingegnerizzato *Komagataella phaffii* raggiunge una produzione record de novo di 3-idrossipropionato utilizzando una strategia "2+1" redox-complementare che co-consuma etanolo e CO2, convertendo con successo flussi non purificati di riduzione chimica della CO2 in prodotti multicarbossilici ad alto valore.

Jianming Liu, Tong Liu, Hanbin Lei, Zhiqiang Chen, Yudian Zhu, yongjun mao, Jiacheng Feng, An-ping Zeng2026-09-25
🧬 biologia

LucaCell: a sequence-centric foundation model for cross-species single-cell analysis

LucaCell è un modello di fondazione centrato sulle sequenze che utilizza embedding di sequenze di mRNA pre-addestrati invece di identificatori genici fissi per consentire un'analisi single-cell robusta tra specie, modalità e contesti diversi, inclusi il trasferimento accurato dei tipi cellulari, la differenziazione delle specie microbiche e la predizione dell'interazione ospite-virus.

Yan Sun, Yong He, Minsi Ren, Yanhui Wang, Penghao Xu, Yong Hou, Yu Kang, Tingjun Hou, Jieping Ye, Huanming Yang, Zheng W (…)2026-09-25
🧬 biologia

First de novo Transcriptome Assembly of Litylenchus crenatae, the Causal Agent of Beech Leaf Disease

Questo studio presenta la prima assemblaggio e annotazione del transcriptoma *de novo* di *Litylenchus crenatae*, il nematode responsabile della malattia delle foglie del faggio, fornendo una risorsa genomica fondamentale per facilitare la ricerca futura sui meccanismi molecolari di questo patogeno forestale emergente.

Andrew Miles, Cecilia Chagas de Freitas, Christopher G. Taylor, Pierluigi Bonello2026-09-25