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🧬 biologia

Integrating Genomic and Fragmentomic Features for Tissue-of-Origin Prediction from Routine Targeted ctDNA Sequencing

Questo studio introduce SHAPE, un metodo innovativo che sfrutta il sequenziamento routinario del ctDNA mirato per integrare caratteristiche genomiche e frammentomiche per una previsione altamente accurata e biologicamente interpretabile dell'origine tissutale del cancro, estendendo potenzialmente l'utilità clinica dei saggi esistenti senza richiedere ulteriori sequenziamenti.

Jaeryuk Kim, You-Keun Ko, Seo Yoon Jang, Ji Eun Shin, Junkyu Kim, Junghoon Shin, Sehhoon Park, Minsuk Kwon, Sung Hee Lim (…)2026-10-23
🧬 biologia

Evidence that the perinatal maternal microbiome mediates metabolite signaling programs that drive sex-specific microglial metabolic alterations and Alzheimer’s disease susceptibility

Questo studio dimostra che la perturbazione perinatale del microbioma materno riduce selettivamente la patologia della malattia di Alzheimer nella progenie femminile riprogrammando il metabolismo microgliale e le vie di segnalazione dei GPCR, invertendo così i modelli di suscettibilità specifici per sesso tipicamente osservati con le manipolazioni del microbioma postnatali.

Piyali Saha, Nicholas Slimmon, Ananya Nadgauda, Priyam Patel, Diya Mishra, Pedro Blauth Poli, Ana Inukai, Ahtziri Fernan (…)2026-10-23✓ Author reviewed ⓘ
🧬 biologia

Comparative plastome genomics of Lobeliain the Mexican Transition Zone reveals conserved genome structure (Campanulaceae: Lobelioideae)

Questo studio rivela che, nonostante la reputazione della famiglia Campanulaceae per i vasti riarrangiamenti del plastoma, le specie di Lobelia e Diastatea nella Zona di Transizione Messicana esibiscono strutture genomiche altamente conservate con solo minori variazioni specifiche per specie, mentre le analisi filogenetiche confermano la non monofilia della sezione Stenotium.

Miguel A. Pérez-Pérez, Kyle G. Keepers, Nolan C. Kane, Arturo Castro-Castro, Richard G. J. Hodel, Laura P. Lagomarsino (…)2026-10-23
🧬 biologia

MALAT1 is required for estradiol to act as a mitogen in hormone receptor-positive breast cancer

Questo studio identifica l'RNA lungo non codificante MALAT1 come un critico regolatore permissivo della proliferazione guidata dagli estrogeni nel carcinoma mammario positivo ai recettori ormonali, dimostrando che la sua deplezione sopprime la crescita e induce la morte cellulare interrompendo l'asse ME3-COX-2.

Sara De Martino, Aurora Aiello, Veronica Barbi, Luca Cis, Valeria Pecci, Antonio Franco, Marcello Pompa, Melissa Borsa (…)2026-10-23
🧬 biologia

Distinguishing insulators from enhancers by their ability to block long-range contacts using HiCAggR

Lo studio introduce HiCAggR, un pacchetto Bioconductor che sfrutta l'aggregazione ad alta risoluzione dei dati Hi-C per distinguere gli isolatori dagli enhancer quantificando la loro capacità di bloccare i contatti promiscui a lungo raggio tra enhancer e promotori, rivelando che la deplezione degli isolatori porta a contatti aberranti e a una diffusa deregolazione genica.

Naomi Schickele, Olivier Fosseprez, Robel Tesfaye, Charlène Perrois, Nicolas Chanard, Anne-Laure Finoux, Eldon Emberly (…)2026-10-23
🧬 biologia

Mammalian Hemopexin Protects Blood-Feeding Dipterans from Heme Toxicity and Promotes Parasite Transmission

Questo studio rivela che l'emipexina di mammifero assunta dai ditteri ematofagi mantiene la sua attività di scavenging dell'eme per proteggere i vettori dalla tossicità dell'eme e mantenere l'omeostasi intestinale, promuovendo così involontariamente lo sviluppo e la trasmissione di parassiti come *Plasmodium* e *Leishmania*.

Joel Vega-Rodríguez, Francis de Souza Saraiva, Thiago Alves e Silva, Octavio Talyuli da Cunha, Eva Iniguez, Patricia Alv (…)2026-10-23
🧬 biologia

Conserved biological response states organize nanoparticle biosafety across neurological systems

Questo studio introduce un framework di apprendimento automatico incentrato sulla risposta che integra il contesto biologico e i programmi di risposta cellulare in un Asse di Risposta Conservato (CRA), migliorando significativamente la previsione della biosicurezza e del recupero delle nanoparticelle attraverso diversi sistemi neurologici oltre quanto sia possibile ottenere solo con le proprietà dei materiali.

sumit kumar, Renukadevi Balusamy, Davoodbasha Mubarak Ali, Irfan Ullah, Girish Birappa, Samad Abdus, Priyanka Singh, Sha (…)2026-10-23
🧬 biologia

Scaffold Geometry Governs Mechanobiological Responses to Combined Biophysical Stimulation in Human Bone Tissue-Like Models

Questo studio dimostra che la geometria dello scaffold determina la sensibilità delle cellule staminali mesenchimali derivate dal midollo osseo umano a specifici stimoli biofisici, ma che la combinazione della pressione idrostatica intermittente e della stimolazione del campo elettromagnetico pulsato supera tali limitazioni geometriche per promuovere sinergicamente l'osteogenesi precoce attraverso vie molecolari complementari.

Lia Rimondini, Farah Daou, Stefano Gabetti, Shahd Alahmad, Beatrice Masante, Elisa Scatena, Carlotta Achille, Cristina B (…)2026-10-23