🧬 biology

CAPRA predicts single-cell transcriptional responses to genetic perturbations with response anchoring and residual correction

Il documento introduce CAPRA, un nuovo modello ancorato alla risposta che predice le risposte trascrizionali a singole cellule alle perturbazioni genetiche combinando stati di controllo, embedding genici e correzioni apprese, raggiungendo così un'accuratezza e un'interpretabilità superiori sia nei compiti a singolo gene che in quelli a doppio gene rispetto ai metodi esistenti.

Dong-Qing Wei, Zhongcheng Fang, Qi Gao, Yajing Yuan, Han Wang, Hong Tan, Jiayi Li, Zhennan Peng, Lan Yang, Mengyuan Jin (…)2026-07-21
🧬 biology

Assembly and Comparative Analysis of the Complete Mitogenome of Nephelium lappaceum: insights into structure, phylogenetic implications, and RNA editing

Questo studio presenta la prima assemblaggio completo e l'analisi comparativa esaustiva del genoma mitocondriale di *Nephelium lappaceum* (rambutan), rivelandone le caratteristiche strutturali, i modelli di editing dell'RNA e le relazioni evolutive all'interno delle Sapindaceae per fornire una risorsa fondamentale per la futura ricerca funzionale e filogenetica.

Dan Feng, Dong Yu, Hailin Qiu, Wuqiang Ma, Jun Wang2026-07-21
🧬 biology

Carbon partitioning through the pentose phosphate pathway regulates behavioral maturation in honeybees via a redox–endocrine axis

Questo studio rivela che l'infezione da Deformed Wing Virus nelle api mellifere reindirizza il carbonio del glucosio verso la via ossidativa del pentoso fosfato per generare NADPH, il quale alimenta la biosintesi dell'ormone giovanile e guida la maturazione comportamentale precoce, stabilendo così un asse metabolico–redox–endocrino conservato che collega la riprogrammazione metabolica indotta dallo stress agli esiti comportamentali.

YUEHLUNG WU, Yun-Heng Lu, Yao-Kuang Tseng, Wei-Chan Chang2026-07-21
🧬 biology

Large-scale in-silico bacterial cryptochrome/photolyase screening identifies an extremophile radical-pair candidate with expanded flavin–tryptophan wiring

Attraverso uno screening in-silico su larga scala di oltre 22.000 proteine batteriche criptocromo/fotoliasi, i ricercatori hanno identificato un candidato termofilo, A0A6M1RS91, che possiede una rete di trasferimento elettronico flavina-triptofano espansa, rendendolo un nuovo promettente bersaglio per investigare la fotochimica delle coppie radicaliche e la sensibilità al campo magnetico.

Georgios Miliotis2026-07-21
🧬 biology

The Fas–FADD–caspase-8 axis is a cancer cell-intrinsic determinant of cytotoxic lymphocyte–mediated killing

Questo studio rivela che l'asse Fas–FADD–caspasi-8 agisce come un determinante critico, intrinseco alla cellula tumorale, della suscettibilità all'uccisione mediata dai linfociti citotossici attraverso meccanismi che si estendono oltre il percorso apoptotico canonico dipendente dalle caspasi esecutrici.

Youxian Li, Elise Solli, Shixiong Wang, Qian Wei, Nathaniel Saidu, Kjetil Taskén2026-07-21
🧬 biology

FAM155B driven by BPTF promotes breast cancer progression and paclitaxel resistance via SREBP1-mediated fatty acid metabolic reprogramming

Questo studio rivela che il rimodellatore della cromatina BPTF attiva trascrizionalmente FAM155B, il quale a sua volta guida la progressione del cancro al seno e la resistenza al paclitaxel attraverso l'upregulation della riprogrammazione metabolica degli acidi grassi mediata da SREBP1.

Yihong Luo, Sijia Zhang, Weifeng Qu, Xuhui Zhao, Yuan Fang, Jun Gao, Jingyi Wang, Shiguang Yang, Wei Zhu, Zhilong Ai, We (…)2026-07-21
🧬 biology

Standing HA phenotypic breadth shapes H5N1 cross-host potential

Questo studio ricostruisce l'evoluzione dei tratti fenotipici dell'emoagglutinina (HA) attraverso migliaia di virus H5N1 per dimostrare che la larghezza fenotipica preesistente, piuttosto che semplici mutazioni a tappe, consente al virus di diversificarsi e adattarsi rapidamente a nuovi ospiti come i bovini da latte, offrendo un quadro scalabile per dare priorità alle varianti cross-host.

Justin Bahl, M H M Mubassir, Sachin Subedi, Tanin Rajamand, Mohamed Bakheet, Ludy Carmola, Sihua Peng, Rajan Kandel, Gup (…)2026-07-21
🧬 biology

CIRBP long isoform suppresses breast cancer metastasis via the translational activation of DCLK1-L and microtubule stabilization

Questo studio rivela che l'isoforma lunga della proteina legante l'RNA inducibile dal freddo (CIRBP-L) sopprime la metastasi del cancro al seno legandosi direttamente e potenziando la traduzione dell'mRNA di DCLK1-L, il quale successivamente stabilizza i microtubuli attraverso l'inibizione dell'asse GSK3β–HDAC6.

Suntaek Hong, Hye-Youn Kim, Young-Mi Kim, Ye-Jin Park, Soyeon Ryu2026-07-21
🧬 biology

Unstable Species Trees Reveal Fundamental Limits to Phylogenomic Inference

Questo studio dimostra che l'estrema instabilità degli alberi di specie attraverso il genoma delle lucertole della salvia, guidata da una diffusa introgressione e barriere geografiche, mette in discussione la fattibilità di inferire un singolo percorso evolutivo e supporta il riconoscimento di molteplici specie distinte all'interno del complesso *Sceloporus graciosus*.

Christopher Blair, Tomas Flouri, Felipe DE MEDEIROS MAGALHÃES, Lauren Chan, Daniel Mulcahy, Sungsik Kong, Adam Leache2026-07-21
🧬 biology

DRP lyase deficient DNA polymerase beta impairs mitochondrial electron transport chain and compromise mitochondrial DNA integrity

Questo studio dimostra che la perdita dell'attività della dRP liasi nella DNA polimerasi beta compromette l'integrità del DNA mitocondriale e la funzione della catena di trasporto degli elettroni interrompendo l'asse ROS-antiossidante, portando a una disregolazione metabolica e a un aumento dello stress ossidativo.

Dawit Kidane, Aashirwad Shahi, Nyima Kinteh, Shengyuan Zhao2026-07-21