🧬 biology

Position-resolved k-mer analysis of mature microRNAs reveal widespread CG and UA depletion across taxa

Questo studio analizza quasi 49.000 sequenze mature di microRNA attraverso 271 organismi per rivelare un'organizzazione posizionale diffusa e associata al lignaggio, caratterizzata da una significativa deplezione di dinucleotidi CG e UA e un arricchimento di UG, suggerendo vincoli strutturali o evolutivi che vanno oltre il semplice bias mutazionale.

Chandhru Srinivasan, Mano Chitra Karthikeyan, Abirami Jayaprakash, Indhirakumar Murugesan, Vignesh Packiyaraj, Antony Jo (…)2026-09-04
🧬 biology

Effects of phytoplankton blooms on aquatic macroinvertebrate assemblages in a tropical karst lake

Questo studio sulla Lagoa Misteriosa rivela che, sebbene le fioriture di fitoplancton (WAB) e la loro assenza (AAB) influenzino significativamente l'associazione di specifici taxa di macroinvertebrati e gruppi funzali alimentari con distinti parametri della qualità dell'acqua, esse non alterano la struttura complessiva della comunità o gli indici ecologici.

Éverton Gustavo Miguel Neves, Anderson Ferreira2026-09-04
🧬 biology

Genome-wide identification of the PSK family and the association between SlPSK7 and auxin signaling in tomato

Questo studio identifica otto geni della famiglia PSK nel pomodoro e dimostra che SlPSK7 agisce come un regolatore positivo della segnalazione dell'auxina durante l'allegagione, esibendo modelli di espressione ed effetti regolatori sui geni ARF che sono paralleli alle risposte dell'auxina.

Shaoli Zhang, Lu Xie, Yuanyuan Song, Haidong Li, Guiyun Wang, Pengcheng Yi, Shude Yang, Luying Zhu, Kai Pan2026-09-04
🧬 biology

Astrocyte reactivity impairs lymphopoiesis through cholesterol-dependent mTOR suppression in common lymphoid progenitors

Questo studio rivela che la reattività degli astrociti compromette la linfopoiesi del midollo osseo inducendo l'accumulo di colesterolo nei progenitori linfoidi comuni, il che sopprime la segnalazione di mTOR e ostacola lo sviluppo delle cellule B.

Fang Ni, Rui Zhao, Xian Song, Yakun Liu, Jing Du, Tingting Liang, Zhi Yang, Lili Qian, Mingming Zhu, Jiani Zheng, Xinru (…)2026-09-04
🧬 biology

Energy Availability, Not Stress Tolerance, Determines Archaeal Persistence in Extraterrestrial Habitats

Contrariamente alla supposizione prevalente che la tolleranza allo stress determini la sopravvivenza in ambienti extraterrestri, un'analisi genomica su larga scala di 3.531 genomi archeali rivela che la disponibilità di energia, in particolare la densità energetica sfruttabile della metanogenesi, è il determinante primario della persistenza archeale attraverso gli habitat del sistema solare.

Ajay Vellanki2026-09-04
🧬 biology

Thousands of pathogenic variants in ClinVar show signs of incomplete loss-of-function

Questo studio dimostra che, sebbene metriche specifiche come LOFTEE, i punteggi pext e l'analisi NMD possano aiutare a distinguere le varianti patogene da quelle benigne, migliaia di varianti patogene note in ClinVar mostrano segni di perdita di funzione incompleta, rivelando significativi limiti nell'affidarsi esclusivamente a regole di filtraggio automatizzate per escludere tali varianti.

Tatyana E. Lazareva, Yury A. Barbitoff, Yulia A. Smirnova, Andrey S. Glotov2026-09-04
🧬 biology

Interferons and STAT1 dynamically modulate integrated stress response outcomes in CD8 T cells

Questo studio dimostra che l'attivazione delle mutazioni di STAT1 guida la disfunzione delle cellule T CD8 attraverso meccani estrinseci e intrinseci distinti, in cui una segnalazione esagerata dell'interferone di tipo I innesca una risposta allo stress integrata pro-apoptotica che sovrasta l'esaurimento classico e altera il differenziamento.

Rachael Philips, Kang Yu, Yi-Chu Liao, SeolKyoung Jung, Kan Jiang, Yuka Kanno, Davide Randazzo, Scott Oakes, John O'Shea2026-09-04
🧬 biology

Integrative Transcriptomic Analysis Reveals Multicellular Dysregulation and Spatial Heterogeneity in the Colorectal Cancer Microenvironment

Questo studio integra l'RNA-seq bulk, l'RNA-seq a singola cellula e la trascrittomica spaziale per caratterizzare la disregolazione multicellulare e l'eterogeneità spaziale nel microambiente del tumore del colon-retto, identificando una nuova firma prognostica di otto geni e chiarendo il ruolo dei fibroblasti associati al cancro e delle cellule epiteliali maligne nel plasmare una nicchia tumorale immunosoppressiva.

Yan Lin, Wenfeng Luo, Xiaoqing Li, Jingting Su, Yanying Pan, Guohai Yang, Shanshan Luo, Yubin Huang2026-09-04
🧬 biology

Rapid nasal metabolism organizes the neural representation of odors

Questo studio dimostra che il rapido metabolismo nasale degli odoranti da parte degli enzimi xenobiotici modella fondamentalmente le rappresentazioni neurali degli odori generando metaboliti che alterano i modelli di risposta, con la temporizzazione legata all'inalazione che funge da elemento per distinguere i segnali chimici esterni da quelli generati internamente per sostenere percetti distinti.

Matt Wachowiak, Elvis Acquah, Madison Herrboldt, Joel Hallkaj, Mona Marie, Zhenxing Wu, Jeanne Chaloyard, Isabelle Andri (…)2026-09-04