🧬 biologia

Ultrahigh-Throughput Evolution of a Photoenzyme for Efficient Bioproduction of Toluene and p-Cresol

Questo studio stabilisce una piattaforma di screening ultra-ad alta velocità utilizzando il sorting cellulare accoppiato a biosensori per evolvere la fotoenzima CvFAP, ottenendo miglioramenti della produttività superiori a 200 volte che consentono la bioproduzione efficiente e sostenibile di toluene e p-cresolo direttamente da amminoacidi derivati dal glucosio.

Shuke Wu, Zhaoyang Qin, Yi Zhou, Shenghao Peng, Wen Zheng, Zherui Xu, Yunpeng Bai, Matthias Höhne, Thomas Ward, Uwe Born (…)2026-10-20
🧬 biologia

The Role and Challenges of Academia in the Marine Natural Products Pipeline

Questo studio identifica le barriere persistenti che ostacolano la commercializzazione dei prodotti naturali marini in ambito accademico — quali i vincoli di finanziamento, la complessità normativa e la perdita di competenze — attraverso un'analisi qualitativa di sei progetti interrotti, proponendo infine interventi mirati per migliorare l'efficienza della pipeline e la prontezza per il mercato.

Amelia Westmoreland, Janos Meszaros, Thomas Vanagt, Marcel Jaspars, Isabelle Huys2026-10-20
🧬 biologia

RARRES2 promotes glycolytic reprogramming and malignant phenotypes in clear cell renal cell carcinoma

Questo studio identifica RARRES2 come un biomarcatore critico associato alla glicolisi nel carcinoma a cellule chiare del rene che guida la progressione maligna e la riprogrammazione metabolica, come validato attraverso l'analisi multi-omica, l'apprendimento automatico e gli esperimenti funzionali in vitro.

Linli Chen, Yinhao Chen, Yuhan Li, Yutao Li, Ji Gao, Xiangyu Liu, Xiang Ruan, Shuo Ma, Amit Sharma, Ingo G.H. Schmidt-Wo (…)2026-10-20
🧬 biologia

RESIRE-Net enables accurate 3D atomic structure determination from limited-angle electron tomography

Il documento introduce RESIRE-Net, un framework di apprendimento auto-supervisionato che combina una 3D U-Net con la ricostruzione iterativa nello spazio reale per migliorare significativamente la precisione posizionale atomica 3D e l'identificazione chimica nella tomografia elettronica, superando i limiti degli artefatti del cuneo mancante senza richiedere dati di addestramento esterni.

Minh Pham, Ada Morral, Jianwei Miao2026-10-20
🧬 biologia

A General Computational Framework for Sequence-Level Thermodynamic Analysis of Modeled RNA–DNA and DNA–DNA Duplex States: A Proof-of-Concept Study in HIV-1

Questo studio di prova di concetto presenta un quadro computazionale che dimostra come 15 delle 16 regioni genomiche di HIV-1 esibiscano una stabilità termodinamica significativamente più favorevole per la formazione di duplex RNA–DNA rispetto ai duplex DNA–DNA, sebbene l'autore avverta che tali previsioni a livello di sequenza non confermano l'effettiva formazione di R-loop cellulari o la causalità biologica.

SAADAT SAMADI DINANI2026-10-20
🧬 biologia

Structured Metabolic Genetic Axes Reveal Distinct Lipid and Ketone-Body Programs in Alzheimer’s and Parkinson’s Disease

Applicando il modello Genomic SEM per modellare assi genetici metabolici strutturati, questo studio rivela legami distinti e biologicamente tracciabili tra specifici programmi di lipidi e corpi chetonici e la patogenesi delle malattie di Alzheimer e Parkinson, identificando nuovi bersagli terapeutici che vadano oltre le associazioni con singoli metaboliti.

Jing Shen, Yuxuan Shen, Gang Yu, Lijun Pang, Chenxu Xiao2026-10-19
🧬 biologia

Machine learning and single-cell transcriptomics identify key lncRNAs associated with malignant transformation and immune infiltration in colorectal cancer

Questo studio utilizza il machine learning e la trascrittomica a singola cellula per identificare una firma di sette lncRNA che distingue efficacemente i tessuti normali, l'adenoma e il tumore nel cancro del colon-retto e correla con l'infiltrazione immunitaria, sebbene tali marcatori fungano da biomarcatori di stadiazione piuttosto che da indicatori prognostici indipendenti per la sopravvivenza.

Han Gong, LiBo Liu, Chao Mi, BoLun Yan, FuYang Gao, HuaYu Zhang2026-10-19
🧬 biologia

Differential abundance and self-organizing tree algorithm clustering nominate PDGFC and TIMP3 as candidate resection-responsive plasma extracellular vesicle proteins in head and neck cancer

Questo studio dimostra che la resezione del tumore della testa e del collo esaurisce significativamente le vescicole extracellulari del plasma circolante di proteine che promuovono la crescita, identificando specificamente PDGFC e TIMP3 come biomarcatori candidati la cui alta espressione correla con una minore sopravvivenza dei pazienti.

Dapi Menglin Chiang, Christina Ludwig, Amirhossein Sakhteman, Marlene Reithmair, Michael W. Pfaffl, Laurent Muller2026-10-19
🧬 biologia

In which cases does it make sense to classify a trace into one population, and what are the alternatives?

Questo studio valuta i metodi di classificazione per l'analisi dell'ascendenza biogeografica utilizzando 104 AIM, dimostrando che un classificatore Naive Bayes recente (RNB) distingue efficacemente tra individui in-reference, ammessi e fuori-reference, affrontando così i limiti dell'assegnazione degli ignoti a una singola popolazione di riferimento.

Julika Schmitz, Jana Naue, Lukas Hoffmann, Zoe Lange, Suchanek Ferdinand, Sabine Lutz-Bonengel, Holger Dette, Peter Pfaf (…)2026-10-19