🧬 biology

A Novel Hybrid Pyramid ViT-ConvFormer Architecture with Dynamic Early Stopping Analysis for Enhanced Diagnostic Efficiency in Diffuse Large B-Cell Lymphoma

Il documento introduce PyConv, una nuova architettura ibrida Pyramid ViT-ConvFormer con early stopping dinamico che raggiunge un'accuratezza diagnostica allo stato dell'arte e una convergenza significativamente più rapida per la sottotipizzazione del linfoma a grandi cellule B diffuso, mantenendo al contempo l'interpretabilità clinica.

Gei Ki Tang, Chee Chin Lim, Faezahtul Arbaeyah Hussain, Qi Wei Oung, Aidy Irman Yajid, Sumayyah Mohammad Azmi2026-09-04
🧬 biology

TDEP: Predicting Target Perturbation Response from Drug-Induced Transcriptomes

TDEP è una rete neurale profonda che sfrutta gli embedding di modelli linguistici proteici e le reti di attenzione a grafo per prevedere accuratamente le risposte alle perturbazioni dei target a livello di trascrittoma a partire dai profili indotti da farmaci, eguagliando l'accuratezza dei metodi basati sulla struttura pur fornendo approfonditi spunti meccanicistici a livello genico per la prioritizzazione dei target e il riposizionamento dei farmaci.

Jieun Sung, Sookyung Kim, Wankyu Kim2026-09-04
🧬 biology

A conserved lipid–lysosome remodeling axis characterizes plaque- associated microglial responses in Alzheimer’s disease

Questo studio identifica un asse di rimodellamento lipidico-lisosomiale conservato e continuo nella microglia che correla con la gravità della malattia di Alzheimer ed è localizzato spazialmente nelle nicchie associate alle placche, stabilendo un quadro riproducibile tra le specie per comprendere le risposte metaboliche microgliali nella malattia di Alzheimer.

Sandila Arif, Qi Luo, Xuanrui Hao, Rui Zheng, Nan Sun, Zhenzhen Quan, Junjun Ni, Yunjie Qiu, Hong Qing2026-09-04
🧬 biology

Single-Cell Transcriptomic Profiling Reveals a Conserved Acinar-to-Ductal Metaplasia Trajectory in Mouse and Human Pancreatic Tumorigenesis

Questo studio utilizza il sequenziamento dell'RNA a singola cellula integrativo per stabilire una traiettoria trascrizionale conservata della metaplasia acino-dotto in entrambi la tumorigenesi pancreatica di topo e umana, identificando Foxq1 e Onecut2 come regolatori chiave di questa precoce transizione maligna.

Seoyeon Ahn, Hyeonji Lee, Tae-Young Roh2026-09-04
🧬 biology

Integrated Bulk and Single-Nucleus Transcriptomic Profiling Identifies CD53 as a Microglia-Enriched Inflammation-Associated Marker in Experimental Spinal Cord Injury

Questo studio integra analisi multi-omiche e validazione sperimentale per identificare CD53 come un marcatore arricchito nelle microglia nell'infiammazione subacuta nel lesione del midollo spinale, il quale è associato alla segnalazione di NF-κB ma richiede ulteriori indagini funzionali per stabilire la causalità.

Guanyin Wu, Kaifeng Lin, Xiaopin Cui, Shunbao Lan, Haibo Hu, Hui Wang, Xiu Yang, Chang Liu, Wenjie Fu, Jinshui Chen, Jia (…)2026-09-04
🧬 biology

Three-Dimensional Morphological and Hemodynamic Analysis of Wavy Arterioles in Human Brain

Questo studio utilizza l'imaging 3D e la modellazione computazionale per rivelare che le arteriole ondulate fisiologiche, presenti unicamente in specifiche regioni corticali umane, inducono cambiamenti emodinamici distinti che probabilmente fungono da regolatori adattivi per la perfusione cerebrale locale e le funzioni cognitive superiori.

Yuan Yuan, Su Wang, Yue Zhao, Qian Li, Xiaoxin Yan, Xiang Wang, Xiaosheng Wang2026-09-04
🧬 biology

Integrated transcriptomic and experimental analyses identify MAFF as a protective regulator of chondrocyte stress in osteoarthritis

Questo studio identifica MAFF come un regolatore protettivo nell'osteoartrite che risulta sottoregolato nella malattia e mitiga funzionalmente l'apoptosi dei condrociti e la disfunzione mitocondriale attraverso la modulazione delle vie di risposta allo stress e dell'infiammazione.

Jiesi Hu, Sen Wang, Longfei Zou, Jimei Yang, Liang Ma, Bo Guo, Weibo Zheng, Jie Zou, Xiaoai Zhou, Xing Guo, Meiyun Tan2026-09-04
🧬 biology

Heterospecific predation by the predatory soil mite Blattisocius mali (Acari: Blattisociidae) and its predation preference towards conspecific and heterospecific prey

Questo studio dimostra che l'acaro predatore del suolo *Blattisocius mali* pratica la predazione eterospecifica su *Stratiolaelaps scimitus* consumando le loro uova e larve (con preferenze che variano in base allo stadio vitale e alla durata della denutrizione), un comportamento che potrebbe impattare significativamente le strategie di controllo biologico dei parassiti.

Manoj Kumar Jena, Marcin Studnicki, Katarzyna Michalska2026-09-04
🧬 biology

Bisecting GlcNAc modification of LAMP1 promotes autophagosome–lysosome fusion in colorectal cancer

Questo studio rivela che la modifica del bisecting GlcNAc di LAMP1 mediata da MGAT3 ne aumenta la stabilità e recluta ANXA2 per fare da impalcatura all'assemblaggio di VAMP8 e STX17, promuovendo così la fusione autofagosoma-lisosoma e sopprimendo la tumorigenesi del cancro del colon-retto.

Feng Guan, Lei Lei, Shuangshuang Sheng, Ying Guan, Keying Li, Zhiwen Shi, Bingyi Jia, Yan Li, Xiaoyan Zhao, Zekong Ma, Z (…)2026-09-04
🧬 biology

Extracellular Ion Fluctuations Coordinate Cardiac Pacemaker Cell Activation

Questo studio rivela che le cellule del pacemaker cardiaco raggiungono un battito ritmico sincronizzato non attraverso il tradizionale accoppiamento elettrico, ma tramite un meccanismo non canonico in cui le fluttuazioni cicliche degli ioni potassio extracellulari in stretti microdomini coordinano e sincronizzano la fase delle cinetiche di attivazione delle cellule adiacenti.

Michael Bressan, Trevor Henley, Alec Beck, Kathryn Scherrer, James Engel, Bhavana Shewals, Nicole Dubois, Vasanth Vedant (…)2026-09-04