🧬 biology

MitoSeqGen: a constrained generative transformer for mammalian mitochondrial mRNA codon optimization

MitoSeqGen è un nuovo trasformatore generativo vincolato addestrato su un ampio dataset mitocondriale di vertebrati che supera i modelli di ottimizzazione dei codoni esistenti garantendo il 100% di correttezza proteica sotto il distinto codice genetico mitocondriale e ottenendo al contempo una superiorità di somiglianza con le sequenze di codoni naturali.

Sravan Kumar Bonthada2026-09-03
🧬 biology

Machine learning implementation for host-based infectious disease diagnostics

Questa revisione sistematica di 21 studi (2020–2025) valuta 54 modelli di apprendimento automatico per la diagnostica delle malattie infettive basata sull'ospite, riscontrando che, sebbene Random Forest e le reti neurali siano gli algoritmi più comuni, nessun singolo modello è universalmente ottimale e la futura traslazione clinica richiede una reportistica standardizzata, una validazione esterna e una selezione degli algoritmi consapevole del contesto.

Samuel Harrington2026-09-03
🧬 biology

DeepCNet: A multimodal deep learning model for predicting cell type-specific gene expression and promoter-enhancer interactions from single-cell multiome data

DeepCNet è un nuovo framework di deep learning multimodale che sfrutta dati multiomici a singola cellula per prevedere accuratamente l'espressione genica specifica per tipo cellulare e inferire le interazioni promotore-enhancer regolatorie, consentendo così la costruzione di reti di regolazione genica dei fattori di trascrizione e l'identificazione di alterazioni regolatorie specifiche per condizione in malattie come l'Alzheimer.

Li Chen, Weijia Jin, Fengdi Zhao, Xin Ma, Qing Lu, Karyn Esser, Ramon Sun2026-09-03
🧬 biology

Language development and pro-inflammatory IL-6/IL-10 imbalance in SARS-CoV-2-exposed pregnancies

Questo studio sui bambini nati durante la pandemia in Spagna riscontra che, sebbene l'esposizione prenatale al SARS-CoV-2 di per sé non predica uniformemente ritardi del linguaggio a 18 mesi, uno squilibrio pro-infiammatorio IL-6/IL-10 all'interno delle gravidanze esposte è associato a una performance inferiore in specifici domini del linguaggio come i verbi difficili e le vocalizzazioni, particolarmente tra le bambine.

Alexandre Díaz-Pons, Sergio Castaño-Castaño, Carlos Martínez Asensi, Víctor Ortiz-García de la Foz, Claudia Parás, Ángel (…)2026-09-03
🧬 biology

Phenotype-informed trio analysis reveals a multi-layered fetal genomic architecture in preterm birth

Questo studio rivela che il parto pretermine coinvolge un'architettura genomica fetale eterogenea e multistrato, caratterizzata da profili distinti di varianti rare e mutazioni de novo non codificanti, che sono meglio compresi integrando la variabilità clinica in un fenotipo continuo piuttosto che facendo affidamento sul carico mutazionale complessivo.

Svetlana Dauengauer-Kirlienė, Laura Pranckėnienė, Austėja Letukienė, Faustas Puzeras, Ingrida Domarkienė, Alina Urnikytė2026-09-03
🧬 biology

From Movement to Meaning: Spatial Statistics Uncover Hidden Patterns in Avian Tracking Data

Questo articolo introduce un nuovo framework riproducibile che applica l'analisi dei pattern spaziali puntiformi di tipo euleriano, basata sul luogo, ai dati di tracciamento aviario, consentendo l'identificazione precisa degli stati comportamentali e degli habitat critici attraverso molteplici scale, integrando al contempo gli approcci tradizionali basati sulle traiettorie.

Hengjun Xiao, Hebo Peng, Zhengwang Zhang, Weipan Lei, Yang Wu, Bingrun Zhu, Yoshiaki Miyamoto, Donglai Li, De Chen, Tomo (…)2026-09-02
🧬 biology

Tirzepatide engages a brain-brown adipose tissue axis to promote body weight loss independent of appetite suppression

Questo studio rivela che la tirzepatide promuove la perdita di peso nei topi attivando un circuito distinto del tronco encefalico (AP→DMV→RPa) che stimola la termogenesi del tessuto adiposo bruno indipendentemente dalla soppressione dell'appetito, un meccanismo che spiega circa il 40% della sua efficacia e che non viene attivato efficacemente dal semaglutide.

Jia Sun, Xiao Xiao, Kaibin Wu, Deyi Kong, Fangcai Mai, Hanbo Liu, Danyingzhu Xie, Jiarun Xie, Xiwen Yang, Peiwen Tang, X (…)2026-09-02
🧬 biology

Wildfire ash exposure reveals a disconnect between herbivore feeding behavior and fitness outcomes

Questo studio rivela che, sebbene la deposizione di cenere da incendio non scoraggi il comportamento alimentare dell'erbivoro specialista *Manduca sexta*, essa compromette significativamente il fitness rallentando la crescita, aumentando la mortalità e esaurendo le riserve lipidiche, minacciando così il funzionamento dell'ecosistema attraverso la perturbazione delle interazioni pianta-erbivoro.

Grace Genevieve Melone, Jamie Lynn Resis, Angela Smilanich, James Crall, Amy Trowbridge2026-09-02
🧬 biology

Association Analysis Between Gut Microbiota Characteristics and Body Weight of Maritime Workers

Questo studio rivela che i lavoratori marittimi in sovrappeso esibiscono una distinta disbiosi del microbiota intestinale e un metabolismo lipidico alterato rispetto ai loro omologhi di peso normale, suggerendo che interventi dietetici e del microbiota mirati potrebbero aiutare a gestire il peso in questa popolazione.

chunhong zhang, dan li, qi shen, ziqi liu, siyu xing, dong liang, dawei hu, fengzhong wang2026-09-02
🧬 biology

Novel Genetic Insights into Early-Onset High Myopia Through Trio-Based Exome Sequencing

Questo studio di sequenziamento dell'intero esoma basato su trii di 36 famiglie con alta miopia a esordio precoce identifica una resa diagnostica del 61,1% guidata ampiamente da mutazioni de novo, rivela che il carico genetico correla significativamente con la gravità delle lesioni del fondo oculare piuttosto che con l'errore refrattivo, e suggerisce un modello di ereditarietà additiva oligogenica che coinvolge geni correlati alla percezione visiva, all'assemblaggio del ciglio dei fotorecettori e al rimodellamento della matrice extracellulare.

Wenjing Li, zhenglai Wang, Bingtao Li, Keyan Liu, Zichun Lin, Rui Li, Yanan Ma, Meiling Su, Haixuan Wang, Jinjin Zhang (…)2026-09-02