338 件の論文
生命の仕組みを分子レベルで解き明かすのが生化学です。DNA やタンパク質といった目に見えない小さな分子が、どのように互いに働き合い、私たちが呼吸したり考えたりする生命活動を支えているのか。この分野は、そのような生命の根源的なメカニズムを研究する領域です。
Gist.Science では、生化学に関連する最新の論文を bioRxiv から収集し、専門家の目を通じて整理しています。掲載されている全てのプレプリントに対し、専門用語を噛み砕いた平易な要約と、技術的な詳細を網羅した解説の両方を提供し、誰でも最新の知見にアクセスできるようにしています。
以下に、生化学の分野で bioRxiv から公開された最新の論文リストを掲載します。
分子動力学シミュレーションにより、陽イオン性タンパク質（Trp-cage）の展開が、疎水性相互作用の強さや電気的相互作用の違いにより、陰イオン性界面活性剤（SDS）では濃度依存的に不均一なアンサンブルを形成して変性を促進する一方、陽イオン性界面活性剤（CTAB）では高濃度で折りたたみ状態を安定化し熱変性を抑制することが明らかになった。
この論文は、高スループットスクリーニングにより、グラム陽性菌の病原性に関与する ClpC/ClpP プロテアーゼの活性を強力に促進する新規小分子化合物を同定し、それらが ClpC の N 末端ドメインにある特定の調節部位に結合して作用することを明らかにしたものである。
本論文は、天然物生合成遺伝子クラスター内の型 I ポリケチド合成酵素（PKS）の酵素ドメインの触媒順序と基質特異性を、ゲノム情報と化学構造の整合性を基に自動的に推論するツール「NPannotator」を開発し、既存の専門レビューデータセットにおいて高い精度で遺伝子順序と基質注釈を復元できることを示したものである。
本研究は、定量結合測定、バイオインフォマティクス、構造モデリングを統合することで、シスロニック鉄硫黄クラスター組立（CIA）ターゲティング複合体が、芳香族残基の側鎖と C 末端カルボキシレートを主要なエネルギー源とし、上流残基が文脈依存的に親和性を調節する階層的な結合決定因子によって、多様な配列を持つターゲティングトリペプチドモチーフをどのように認識・解読するかを分子レベルで解明しました。
この論文は、タウリン、スペルミジン、エタノールアミンなどの内生性求核代謝物が反応性アシル種と直接反応して「炭素ストレス」を中和し、タンパク質の異常なアシル化を防ぐことで老化や代謝疾患の抑制や寿命延伸に寄与することを明らかにしたものである。
本研究では、高親和性の蛍光偏光トレーサー KP-SC-1 を設計・合成し、SIRT1-3 阻害剤のスクリーニングに適用可能な、酵素使用量が少なく安定性にも優れた高スループット蛍光偏光アッセイ法を開発した。
本研究は、心臓型セロセストリン（CASQ2）が生理的条件下で Ca2+ 非依存的な二量体として存在し、Ca2+ による協同的なスイッチ機構を介して高次重合体を形成することを明らかにし、このメカニズムの破綻が心筋症性多形性心室頻拍症（CPVT2）の発症経路を説明することを示しました。
本研究は、硫化物：キノン酸化還元酵素（SQR）が硫化物をスーパー硫化物へ酸化する過程を通じてミトコンドリアのエネルギー代謝と生物の寿命を調節する重要な役割を果たしていることを、酵母とマウスのモデルを用いて実証したものである。
本研究は、細菌マイクロコンパートメントのトリマーにスパイタグを融合させることで、溶液中および乾燥状態でも機能性を保持し、化学的に頑丈なマクロな繊維や層状シートを自発的に形成する新たなタンパク質材料の構築法を実証したものである。
この論文は、細胞ストレーナーを用いた温和な機械的破砕法により、心筋細胞から他の細胞の混入を最小限に抑えつつ、構造的・機能的完全性を保った高収率のミトコンドリアを迅速に単離する新規プロトコルを確立し、その有効性を電子顕微鏡や高解像度呼吸測定、パッチクランプ法、移植実験など多様な下流応用を通じて実証したものである。