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INPP5E interactome reveals novel connections to growth factor signaling
本研究は、ジューバー症候群の原因遺伝子産物である INPP5E が、成長因子シグナル伝達経路の調節因子や 14-3-3 タンパク質と相互作用し、リン酸化を介して PDGF 経路を抑制しつつ TGFβ経路を促進するという、繊毛依存性の成長因子シグナル制御の新たな分子メカニズムを解明したことを示しています。
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biochemistry
338 件の論文
生命の仕組みを分子レベルで解き明かすのが生化学です。DNA やタンパク質といった目に見えない小さな分子が、どのように互いに働き合い、私たちが呼吸したり考えたりする生命活動を支えているのか。この分野は、そのような生命の根源的なメカニズムを研究する領域です。
Gist.Science では、生化学に関連する最新の論文を bioRxiv から収集し、専門家の目を通じて整理しています。掲載されている全てのプレプリントに対し、専門用語を噛み砕いた平易な要約と、技術的な詳細を網羅した解説の両方を提供し、誰でも最新の知見にアクセスできるようにしています。
以下に、生化学の分野で bioRxiv から公開された最新の論文リストを掲載します。
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dsRBD Redesign: A Targeted Strategy for Inhibition of RNA Helicase DHX9
本研究は、がん治療ターゲットである RNA ヘリカーゼ DHX9 の特異的阻害を可能にするため、その自己調節インターフェースを標的とした計算機設計による新規 dsRBD タンパク質結合体の開発と、その阻害メカニズムの確立を報告しています。
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Reconciling Cooperativity Definition in PROTACs and Molecular Glues: Thermodynamic Dissection into PPI and Ligand Entropic Contributions
本論文は、「部分埋没型」モデルにおいて観察される見かけ上の負の協同性は、実際には巨大なリガンドの露出質量を制限することによるエントロピー的ペナルティであることを示すことで、PROTACおよび分子グルーにおける協同性の定義を巡る論争を解決し、それによって、このリガンドのエントロピーコストを差し引いたときには真の正のタンパク質間相互作用（PPI）協同性が存在することを明らかにする。
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Quantal PCR: A Calibrator-Free Method for Determining the Unit for Nucleic Acid Quantification
本論文は、系の熱力学的および速度論的特性から固有の量子単位を導出することにより、単一分子レベルでの核酸絶対コピー数を決定する、新たな較正フリーの手法であるクンタルPCR（quPCR）を導入するものである。
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Influenza A virus infection perturbs host cell glycosylation
本研究は、包括的なプロテオミクスおよびグライコミクス解析を用いて、A型インフルエンザウイルス感染が、ウイルス由来のノイラミニダーゼによる広範な脱シアル化やゴルジ体における糖タンパク質フラックスの崩壊を介して宿主の糖タンパク質プロテオームを著しく再構築すると同時に、長期的な小胞体ストレス応答を引き起こし、オリゴマンノース型糖鎖付加を増加させることを明らかにしている。
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The glycan shield of alphaherpesvirus glycoprotein B modulates host co-receptor binding
本研究は、糖鎖プロテオミクス、クライオ電子顕微鏡、および表面プラズモン共鳴を用いて、アルファヘルペスウイルスgBタンパク質のN結合型およびO結合型糖鎖シールド、特にそのシアル酸含有量が、ホスト共受容体であるMAG、PILR、およびNMHC-IIAへの結合をどのように異なる様式で調節しているかを明らかにし、それによってHSV-1、HSV-2、およびVZVの間における明確な向性と感染性のパターンを説明するものである。
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Uncovering distinct protein conformations using coevolutionary information and AlphaFold
本論文は、共進化情報と残基特異的な頻度を活用することで、構造転移タンパク質の構造景観を特徴付ける上で既存の手法を大幅に上回る、多様で高品質な異なるタンパク質コンフォメーションのアンサンブルを効率的に生成する反復サンプリングフレームワークを導入するものである。
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Dietary cholesterol reduces blood pressure and alters lipid profiles in stroke-prone spontaneously hypertensive rats
本研究は、食事性コレステロールが脂質プロファイルを変化させ、アラキドン酸-プロスタグランジンE2軸を抑制することによって、脳卒中を起こしやすい自然発症高血圧ラットにおける収縮期血圧を低下させ、腎炎症を軽減することを示しており、それにより、このモデルにおいて以前に観察された寿命延長効果に対する潜在的なメカニズム的説明を提供している。
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TipA, a Bdellovibrio bacteriovorus BPI-like double-TULIP is opened by its adapter protein, TipB
本研究は、捕食性細菌である*Bdellovibrio bacteriovorus*が、脂質を隔離するホモ二量体を形成する独自のダブルTULIPタンパク質TipAを利用しており、それがアダプタータンパク質TipBによって構造的に開かれることを明らかにしており、これはTULIPにおけるアダプター介在性の構造変化の最初の例である。
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Ulacamten: A Novel, RLC-Targeting Cardiac Myosin Inhibitor for Potential Treatment of Cardiac Hypercontractility, Including HFpEF
本研究は、ウラカムテンが、保存された射出率を伴う心不全（HFpEF）の前臨床モデルにおいて、拡張機能を効果的に改善し心肥大を軽減する、明確な心筋軽鎖依存性メカニズムを持つ新規の心筋ミオシン阻害薬であることを特徴付けている。