In silico design and validation of high-affinity RNA aptamers for SARS-CoV-2 comparable to neutralizing antibodies
本研究は、中和抗体と同等の結合親和性を達成するようにSARS-CoV-2 RNAアプタマーを成功裡に最適化した統合的な計算および実験フレームワークであるCAAMOを導入し、高親和性アプタマーベースの治療法および診断法の開発に向けた堅牢な道筋を実証するものである。
418 件の論文
生命の謎を物理の法則で解き明かすのが生物物理学です。細胞の動きからタンパク質の形まで、目に見えない微观の世界を数式や実験で可視化し、生きている現象そのものを理解しようとする分野です。
Gist.Science は、この分野の最新研究成果を bioRxiv から収集し、すべてを網羅的に処理しています。専門用語の壁を越えるため、各論文の平易な要約と、技術的な詳細なまとめの両方を提供し、誰でも最新の知見に触れられるようにしています。
以下に、bioRxiv から新たに公開された生物物理学の論文一覧を掲載します。最新の発見をぜひご確認ください。
本研究は、中和抗体と同等の結合親和性を達成するようにSARS-CoV-2 RNAアプタマーを成功裡に最適化した統合的な計算および実験フレームワークであるCAAMOを導入し、高親和性アプタマーベースの治療法および診断法の開発に向けた堅牢な道筋を実証するものである。
本研究は、ゼキシンとVASPの液-液相分離凝集体が、自己親和性の中間範囲における重合とコフィリン駆動の分解とのバランスによって、アクチン束の持続的かつトレッドミリング様運動を可能にすることを示しており、この機構はin vitro再構成とエージェントベースシミュレーションの両方によって検証された。
本研究は、カチオン性およびアニオン性ポリエлектроリート被膜が、細胞外マトリックス内のクリリアミロイド繊維の量と構造的品質の間のトレードオフを誘発することによって、大腸菌バイオフィルムの巨視的性質を調節することを示している。
本研究は、TFAM がより長い DNA 断片上でオリゴマー化してミトコンドリアゲノムを均質かつ動的に柔軟な高次ヌクレオイド構造に凝縮させることを生化学的および構造的証拠から示し、従来の短い DNA 断片から得られた知見を超えたものである。
本研究は、ミトコンドリアの形態や機械的性質、分裂・融合ダイナミクスが軸索内の輸送渋滞を誘発し、その結果として軸索膜に機械的ストレスが生じて膨潤を引き起こすという物理的メカニズムを、エージェントベースモデルを用いて解明したものである。
本研究は、DIB-Pipette 法を用いて Bordetella pertussis 由来の毒素 CyaA の断片を解析した結果、膜電位を必要とする P233 と不要な P454 が共有結合することで、膜電位がなくても効率的に膜を通過する協働メカニズムを明らかにしたことを報告しています。
本研究は、パルスエネルギー 150 nJ の 50-fs 近赤外パルスを 1〜20 MHz の可変繰り返し周波数で出力するコンパクトなゲイン管理非線形ファイバー増幅器を開発し、これを用いて生体試料における超短パルス多光子イメージングを実現するとともに、低繰り返し周波数条件下での光損傷低減効果を実証した。
本研究では、ゼブラフィシの脊髄再生における軸索の伸長パターンを、病変部の硬さ変化を要因としたエージェントベースモデルでシミュレーションし、実験データとの一致から機械的シグナルが再生を支配する可能性を示しました。
本研究は、28.2 テスラの超高磁場 MRI と 3D ライトシート顕微鏡を組み合わせることで、生きた皮質オルガノイドの微細構造を非侵襲的かつ時系列に可視化・検証できる新たなプラットフォームを確立し、臨床 MRI バイオマーカーの開発とオルガノイド研究の進展に貢献しました。
本論文は、ATR-FTIR 分光法と分子動力学シミュレーションを組み合わせることで、ToHydA 酵素におけるアザジチオラート配位子の窒素原子と C212 システイン残基間の水素結合が、酸素耐性に関与する H-inact 状態の形成に不可欠であり、その配位子をプロパンジチオラートに置換することでこの相互作用が失われ酸素耐性メカニズムが変容することを明らかにした。