609 件の論文
生命の謎を物理の法則で解き明かすのが生物物理学です。細胞の動きからタンパク質の形まで、目に見えない微观の世界を数式や実験で可視化し、生きている現象そのものを理解しようとする分野です。
Gist.Science は、この分野の最新研究成果を bioRxiv から収集し、すべてを網羅的に処理しています。専門用語の壁を越えるため、各論文の平易な要約と、技術的な詳細なまとめの両方を提供し、誰でも最新の知見に触れられるようにしています。
以下に、bioRxiv から新たに公開された生物物理学の論文一覧を掲載します。最新の発見をぜひご確認ください。
本研究は、出血熱ウイルスのタンパク質を網羅的に解析し、黄熱ウイルスの NS3 プロテアーゼドメインが G-4 重構造（G4）と高い特異性および親和性で結合することを実証し、G4 を標的とした新たな抗ウイルス戦略の可能性を示唆しています。
本論文は、結び目理論に基づく絡み合い指標（巻き数と第二ヴァシリエフ不変量）を用いて、無秩序タンパク質の配列・構造・機能の関係を解明し、これらの指標が生物学的に有意な次元であり、進化上保存されていることを示した。
本研究は、生細胞の動的な過程をリアルタイムで超解像度可視化するため、8 フレームの低解像度画像から 30ms 未満の推論時間で高解像度画像を生成する軽量再帰型ニューラルネットワーク「RESURF」を提案し、従来の手法が抱える計算コストと遅延の問題を解決した。
本研究は、再構成した脂質膜を用いた実験により、膜の曲率が脂質組成に依存して酸化を促進し、特に高い曲率（小さなベシクル）では酸化が顕著に増加し、コレステロール濃度によってその感受性が調節されることを明らかにしました。
本研究は、ThermoMPNN を用いて算出した変異耐性指標が、進化的な保存性を介さずに自然由来および人工設計タンパク質の局所的な動的挙動を予測し、AlphaFold2 の信頼度スコアを補完する物理的に解釈可能な指標であることを示しています。
本研究は、クライオ電子顕微鏡を用いてリポソーム内での KdpFABC 複合体の構造を解析し、リポソームが複合体の構造安定性と機能に不可欠な役割を果たしていることを明らかにしました。
この論文は、DNA 上のタンパク質による標的探索において、1 次元スライディング時間の広範な分布が、リセット過程の枠組みを用いた解析により、平均探索時間の短縮と変動の制御を通じて探索効率を最適化する普遍的な特徴であることを明らかにした。
本研究は、説明可能な AI とタンパク質言語モデルをエネルギー風景解析と統合することで、キナーゼのオルステリック部位が「中立的フラストレーション」というエネルギー的性質によってコードされており、これが調節の可塑性を可能にする一方でアルゴリズム的な検出を困難にしているという新たな原理を解明した。
この論文は、生成深層学習と分子動力学シミュレーションを統合した「amyAMP」というフレームワークを開発し、抗菌活性とアミロイド様自己集合という二重の機能を兼ね備えたペプチドの設計原理を解明し、次世代の抗生物質耐性対策に向けた多機能ペプチドの創出を可能にしたことを報告しています。
この論文は、確率的な戻り則と排除体積幾何学に基づく最小モデル「SR-EV」を用いて、個々の細胞における高度に不均一なクロマチン立体構造のアンサンブルを生成し、Hi-C などの実験データに見られる TAD などの特徴が個々の構造の決定論的性質ではなく、統計的な富化として現れることを示す統合的な解釈枠組みを確立したものである。