Engineered OAA lectins as selective and sensitive high mannose glycan targeting tools
OAA リガンのファージディスプレイによるスクリーニングと構造解析を通じて、高マンノース型 N-グリカンの特定の構造（Man5GlcNAc2）を高精度に識別・結合するよう設計された変異体を開発し、これらを高感度な糖鎖プロファイリングツールや調整可能な抗ウイルス剤として実証しました。
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biophysics
613 件の論文
生命の謎を物理の法則で解き明かすのが生物物理学です。細胞の動きからタンパク質の形まで、目に見えない微观の世界を数式や実験で可視化し、生きている現象そのものを理解しようとする分野です。
Gist.Science は、この分野の最新研究成果を bioRxiv から収集し、すべてを網羅的に処理しています。専門用語の壁を越えるため、各論文の平易な要約と、技術的な詳細なまとめの両方を提供し、誰でも最新の知見に触れられるようにしています。
以下に、bioRxiv から新たに公開された生物物理学の論文一覧を掲載します。最新の発見をぜひご確認ください。
Constructing a single-objective oblique plane microscope (OPM) for fast, multi-colour, high-resolution volumetric fluorescence imaging
この論文は、生体試料の高速・高解像度・多色3D 蛍光イメージングを可能にする単一対物レンズ型斜平面顕微鏡（OPM）の構築手順と性能評価に関する詳細なプロトコルを提供し、複雑な光学系の実装を研究者が容易に行えるようにすることを目的としています。
An Investigation of the Conformational Dynamics of ABC Exporter PCAT1 using Microsecond-Level MD Simulations
本論文では、マイクロ秒規模の分子動力学シミュレーションと自由エネルギー摂動法を組み合わせることで、PCAT1 輸送体において Mg2+ と基質が共役して内向き状態を安定化し、特に Walker A 配列の Lys525 残基が ATP 結合の主要な安定化要因として機能することを明らかにしました。
Predicting Binding Affinities for the Binding Domain of Hyperpolarization-Activated Cyclic Nucleotide-Gated Channel Isoforms Using Free-Energy Perturbation
本研究では、全原子分子動力学シミュレーションと自由エネルギー摂動法を用いて、心臓や脳における自発的リズム電気活動に関与する HCN チャネルのアイソフォーム 1〜4 に対する cAMP の絶対結合自由エネルギーを算出し、アイソフォーム間の cAMP 感受性の違いを説明する結合相互作用のメカニズムを解明しました。
Characterizing the Conformational Dynamics of an Intrinsically Disordered Localization Sequence
本研究は、ミトコンドリア局在ペプチドのコンフォメーションダイナミクスを解析し、単一アミノ酸置換が全体の縮小度にはほとんど影響を与えないものの、局所的な構造選好性を変化させ、その結果として機能するターゲティング効率を調節する可能性のある動的構造アンサンブルの偏りを引き起こすことを明らかにした。
Dissecting Gap Junctional and Ephaptic Contributions to Electrical Conduction in a Novel Cardiomyocyte Pair Model
本研究は、心筋細胞ペアの新たな実験モデルと計算モデルを用いて、低ナトリウム条件下ではギャップ結合が、生理学的なナトリウム濃度ではペリネクサス中心のエプティック結合が細胞間伝導に主要な役割を果たすことを実証し、心臓におけるナノスケールの細胞間隙幾何学とチャネル配置が電気的活性化をどのように調節するかを解明しました。
Clathrin is an Intrinsic Driver of Membrane Fission
本研究は、合成再構成系、メソスケールシミュレーション、および生細胞実験を通じて、クラトリンがアダプタータンパク質に依存せず膜の細分化を直接駆動し、その能力はタンパク質密度ではなくクラトリン格子の機械的性質（剛性や組立状態）によって決定されることを明らかにしました。
Molecular Characterization of SARS-CoV-2 N Protein Interfaces: Implications for Oligomerization, RNA Binding, and Phase Separation
本論文は、SARS-CoV-2 のヌクレオカプシド（N）タンパク質の C 末端ドメインとその周囲の内在性無秩序領域が、特異的なオリゴマー化界面や RNA 結合界面を介して相分離やリボヌクレオタンパク質の集合をどのように制御するかを解明し、新たな治療標的の特定に貢献したことを示しています。
Arginine versus Lysine: Molecular Determinants of Cation-π Interactions in Biomolecular Condensates
分子動力学シミュレーションと量子化学計算を用いた本研究は、凝縮体の安定化においてアルギニンがリシンよりも優位に働く主因が、リシンの高い脱水エネルギーペナルティにあることを明らかにし、カチオン-π相互作用の強さの階層性を分子レベルで解明しました。
Conformational Variability of HIV-1 Env Trimer and Viral Vulnerability
本研究では、全長 HIV-1 Env トリマーの原子レベル分子動力学シミュレーションを行い、 ectodomain が安定な一方、MPER や TMD の柔軟性が膜環境と相互作用して融合を促進し、抗体エピトープの可及性を評価する新たな知見を提供したことを報告しています。