Computational Synthetic Inner Membrane Reveals Cardiolipin-Leak Control of ATP Output
本研究は、計算機上で構築された合成ミトコンドリア内膜モデルを用いて、心筋脂質と膜漏れが ATP 産生に及ぼす制御メカニズムを解明し、プログラム可能な生体エネルギー膜の設計指針を提示した。
⚛️ Category
biophysics
613 件の論文
生命の謎を物理の法則で解き明かすのが生物物理学です。細胞の動きからタンパク質の形まで、目に見えない微观の世界を数式や実験で可視化し、生きている現象そのものを理解しようとする分野です。
Gist.Science は、この分野の最新研究成果を bioRxiv から収集し、すべてを網羅的に処理しています。専門用語の壁を越えるため、各論文の平易な要約と、技術的な詳細なまとめの両方を提供し、誰でも最新の知見に触れられるようにしています。
以下に、bioRxiv から新たに公開された生物物理学の論文一覧を掲載します。最新の発見をぜひご確認ください。
Critical Assessment of ML models for ADMET Prediction in TDC leaderboards
本論文は、TDC の ADMET リーダーボードにおけるベンチマーク手法を批判的に評価し、コードの欠如やデータ漏洩、テストセットへの過剰適合など多くの問題が指摘された結果、隠しテストセットや厳格なデータ管理など、より信頼性の高いベンチマークの必要性を強調している。
Impact of Image Representation on Deep Learning-Based Single-Cell Classification by Holographic Imaging Flow Cytometry
本論文は、ホログラフィックイメージングフローサイトメトリーにおける細胞分類において、画像表現の選択が分類精度と計算コストのトレードオフに与える影響を体系的に評価し、深層学習を用いた最適な処理パイプラインの選択指針を提示するものである。
Enhanced 2D structured illumination microscopy: super-resolution with optical sectioning and reduced reconstruction artifacts
この論文は、粗いパターンと細かいパターンの組み合わせにより、厚い試料における再構成アーチファクトを大幅に低減し、高いコントラストと空間分解能を両立させた改良型 2D 構造照明顕微鏡（2D-SIM）の理論的枠組みと、肝臓洞内皮細胞を用いた実証結果を提示しています。
Local GPCR density tips the balance of μ-opioid receptor trafficking
単一粒子追跡法を用いた研究により、μオピオイド受容体（MOR）の局所表面密度が、G タンパク質シグナル伝達とクラス B GPCR による阻害を乗り越えたクラス A GPCR 密度依存性のトラフィッキング経路の選択を決定づけることが示されました。
Stretching drives Membrane Homogenization of Phase-Separated Supported Lipid Bilayers
本研究は、支持脂質二重層の伸張実験を通じて、膜張力が相分離した脂質ドメインの均質化を誘導し、二次相転移を伴う物理的調節因子として機能することを明らかにしました。
Large-scale simulations reveal evolutionary constraints on intrinsically disordered regions imposed by full-length protein architecture
大規模シミュレーションにより、長鎖の内在性無秩序領域（IDR）が孤立状態ではなく、タンパク質全体のアーキテクチャに埋め込まれた文脈において、構造的・機能的な制約を受けながら秩序領域と共進化していることが明らかになりました。
A universal scaling law for mitotic spindles across eukaryotes driven by chromosome crowding
この論文は、染色体の混雑によって生じる圧縮力が、真核生物の多様性にわたって有糸分裂紡錘体のサイズを決定する普遍的なスケーリング則（ゲノムサイズの 1/3 乗に比例）を支配し、より大きなゲノムの進化やがんの進行を可能にするメカニズムを明らかにしたものである。
Radiation dose effects in correlative X-ray / cryo-electron microscopy of frozen hydrated biological samples
本研究は、シンクロトロン施設で X 線トモグラフィに典型的な高線量（最大 100 MGy）の放射線を浴びても、アポフェリチン試料が凍結保持されたまま cryo-EM による 4 Å 程度の解像度で構造解析が可能であることを実証し、厚い生体試料の多スケール解析に向けた X 線と cryo-EM の統合ワークフローの確立に寄与するものである。
QuantiTrack: A unified software to study protein dynamics in living cells
生細胞内のタンパク質動態を包括的に解析するための直感的な GUI 搭載 MATLAB ソフトウェア「QuantiTrack」を開発し、グルココルチコイド受容体のホルモン応答メカニズムの解明を通じてその有用性を実証しました。