Genomic basis of rapid urban evolution revealed by the subgenome-resolved genome of octoploid Oxalis corniculata
本研究は、8倍体植物*Oxalis corniculata*において、高度なゲノム解析技術と市民科学を活用することで、都市のヒートアイランド現象への適応（葉の色変化）を制御する遺伝的メカニズムを解明したものです。
🧬 Category
genomics
502 件の論文
ゲノミクスは、生命を構成する設計図である遺伝情報を解読し、その働きや多様性を理解するための重要な分野です。この領域では、DNA の配列から病気の原因を突き止める研究から、進化の歴史をたどる調査まで、多岐にわたる発見が生まれています。Gist.Science では、これらの最先端の知見を、専門用語に頼らず誰でも理解できる形でお届けします。
当サイトのゲノミクスカテゴリに掲載される論文はすべて、プレプリントサーバー bioRxiv から提供された最新のものであり、承認前の研究結果も含んでいます。Gist.Science は bioRxiv から届くすべての新規プレプリントを自動的に処理し、専門家が読める詳細な技術的要約と、一般の方も読める平易な解説の両方を生成して公開しています。
以下に、ゲノミクス分野における最新の論文リストを掲載します。
TET2-driven activation of AGO2 links epigenetic remodeling to myeloid commitment and leukemia
本論文は、TET2 が AGO2 のマイエロイド特異的エンハンサーを脱メチル化して活性化し、3 次元ゲノム再編成を介して骨髄系分化を制御するとともに、TET2 変異 AML における AGO2 の低発現が患者予後や白血病の定着に重要な役割を果たすことを明らかにしました。
Genome-targeted enrichment and sequencing of human-infecting Cryptosporidium spp.
本研究では、ヒト感染性クリプトスポリジウム属の多様な種を対象とした 10 万個の RNA 捕獲プローブ（CryptoCap_100k）を開発・検証し、臨床および環境サンプルからの標的 DNA 濃縮効率、ゲノムカバレッジ、変異解析の精度を向上させつつコストを削減できることを示しました。
Skeletal muscle enhancer programming of cardiorespiratory fitness
この研究は、遺伝的に異なるラットを用いた多オミクス解析により、心肺機能（CRF）に関連する遺伝的変異が骨格筋のエンハンサーネットワークを再編成し、脂質代謝や血管新生を介したエネルギー代謝と酸素供給の基盤を形成することを明らかにした。
A comprehensive DNA methylation atlas for the Chinese population through nanopore long-read sequencing of 106 individuals
ナノポア長鎖シーケンシング技術を用いて中国の 19 省にわたる 106 名の個人から全ゲノムハプロタイプ分解メチル化アトラスを構築し、ゲノム構造変異や生息地の標高が DNA メチル化に与える影響を解明しました。
A transcriptomic analysis reveals shared and inducer-specific expression patterns of cellular senescence
この研究は、ヒト肺線維芽細胞において、老化を誘導する刺激が遺伝子発現レベルでは特異的であるものの、増殖抑制や炎症関連経路などの上流の分子経路レベルでは共通のシグネチャーを示すことを明らかにし、細胞老化の転写プロファイルの階層的な組織構造を解明しました。
CAD variants act through ox-LDL-induced enhancer remodelling to alter VSMC gene programmes
本研究は、酸化 LDL が血管平滑筋細胞のエンハンサーを再構築し、冠状動脈疾患の遺伝的リスク変異を介して遺伝子発現プログラムを変化させることで動脈硬化を促進する分子メカニズムを、マルチオミクス解析と機能検証によって解明したものである。
A new phased assembly of the Antarctic spiny plunderfish provides novel insights into the evolution of the notothenioid radiation.
南極トゲトゲウオ（Harpagifer antarcticus）の新たなハプロタイプ解読アセンブリと系統全体にわたる比較ゲノム解析により、寒冷適応に関わる antifreeze glycoprotein 遺伝子群の拡大メカニズム、トランスポゾン活性を伴うゲノム獲得の動的変化、および抗酸化やタンパク質恒常性維持に関連する遺伝子の多様化選択が、南極 notothenioid 類の進化と適放散を駆動した主要因であることが明らかになりました。
Concordia: Spatial Domain Detection via Augmented Graphs for Population-Level Spatial Proteomics
本論文は、がん組織の複雑な空間ドメインを捉えるために拡張グラフを用いたグラフニューラルネットワーク「Concordia」を提案し、数千の組織を同時に解析することでタンパク質発現だけでは特定できない臨床予後に関連する空間的定義された線維芽細胞サブセットを同定することを示しています。
Functional characterisation of an essential neo-chromosome III in Sc2.0 strain reveals opportunities and challenges for genome minimisation in Sc3.0
この論文は、Sc2.0 酵母菌株において必須遺伝子を新たなネオ染色体 III へ移転・リファクタリングすることで SCRaMbLE によるゲノム最小化の制約を克服し、さらに ERICA などの新規スクリーニング手法を開発して複雑なゲノム再編成を可能にした研究を報告し、将来の哺乳類やヒト細胞を含むより複雑な真核生物のゲノム設計への転用可能性を示唆しています。