Superabundant microRNAs are transcribed from human rDNA spacer promoters insulated by CTCF
この論文は、ヒトの核糖体遺伝子反復配列（rDNA）のスペーサープロモーターから転写され、CTCF によって隔離された miR-1275/miR-6724 が、従来の RNA 処理機構に依存せず核外へ迅速に輸送され、エクソソームや循環がんバイオマーカーとして機能する超豊富マイクロRNA であることを示しています。
🧬 Category
genomics
510 件の論文
ゲノミクスは、生命を構成する設計図である遺伝情報を解読し、その働きや多様性を理解するための重要な分野です。この領域では、DNA の配列から病気の原因を突き止める研究から、進化の歴史をたどる調査まで、多岐にわたる発見が生まれています。Gist.Science では、これらの最先端の知見を、専門用語に頼らず誰でも理解できる形でお届けします。
当サイトのゲノミクスカテゴリに掲載される論文はすべて、プレプリントサーバー bioRxiv から提供された最新のものであり、承認前の研究結果も含んでいます。Gist.Science は bioRxiv から届くすべての新規プレプリントを自動的に処理し、専門家が読める詳細な技術的要約と、一般の方も読める平易な解説の両方を生成して公開しています。
以下に、ゲノミクス分野における最新の論文リストを掲載します。
A chromosome-level genome assembly of a vernal pool specialist amphibian, the Western Spadefoot, Spea hammondii
カリフォルニアの保全ゲノムプロジェクトの一環として、パシフィック・バイオサイエンスのHiFi長リードとOmni-C近接結合技術を用いて、絶滅危惧の西側スパドフット（Spea hammondii）の染色体レベルの参照ゲノムが構築・注釈され、これが同種の保全単位や適応変異の評価に不可欠な基盤となることを報告しています。
WITHDRAWN: Genome Report: Long read, high-coverage reference genomes of the Nymphalid butterflies Catonephele acontius and C. numilia (Nymphalidae: Biblidinae)
この論文は、2026 年 2 月に*C. numilia*の標本が誤って同定され実際には*C. acontius*であったことが判明したため、*C. numilia*に関するデータが無効となり、すべての著者が合意して撤回されたことを示しています。
Haplotype-resolved genome assembly advances genetic understanding of trait diversity in Phalaenopsis orchids
本論文は、ハプロタイプ解像度の染色体レベルのゲノムを構築することで、Phalaenopsis 属ランの多様な形質（唇弁の形態、脈紋、背景色など）の遺伝的基盤を解明し、品種改良への応用可能性を示したものである。
Comparative Performance of Portable DNA Extraction Protocols and Bioinformatics Workflows for Rapid Detection of Pathogens and Antimicrobial Resistance Using Oxford Nanopore Sequencing.
本論文は、オックスフォード・ナノポア技術を用いた迅速な病原体検出において、シリカカラム法が最も高いゲノム解像度と解析成功率を示す一方、パラ磁気ビーズ法は携帯性と現場での実用性の面で優れており、低資源環境における AMR 監視には用途に応じた抽出法の選択が重要であることを示しています。
Regions of genome plasticity are systematically organized into recurrent integration spots that shape accessory-genome functional architecture: insights from a complete genome of strain F1C1 and pangenomic analysis of the Ralstonia solanacearum species complex
本論文は、完全ゲノム配列と大規模パンゲノム解析を用いて、Ralstonia solanacearum 種複合体のゲノム可塑性領域が系統的に組織化された統合スポットとして機能し、宿主適応や防御システムなどのアクセサリ遺伝子の多様化を駆動していることを明らかにした。
Temporal chromatin and transcriptome dynamics driven by JUND and progesterone receptor binding in the pregnant mouse myometrium
本研究は、妊娠中のマウス子宮筋層において、JUND とプロゲステロン受容体（特に PRA）の結合がクロマチンアクセシビリティと転写を動的に制御し、分娩開始と産後の遺伝子発現プログラムを調節するメカニズムを解明したものである。
Historical plant embryos as alternative sources of ancient DNA for whole genome sequencing
本論文は、植物の種子胚から古代 DNA を抽出することで、葉組織に比べて DNA の保存状態が優れており、特に熱帯地域で収集された標本において、歴史的植物コレクションからの全ゲノムシーケンシングを可能にする新たな手法を提案しています。
Comparative pan-genomics reveals extensive variation in secondary metabolism and the non-coding repertoire of clinically-relevant Fusarium solani species complex members
本論文は、臨床的に重要なフザリウム・ソラニ種複合体のパンゲノム解析を通じて、二次代謝や非コード RNA の多様性、水平伝達による遺伝子獲得、および多宿主病原性の進化動態を解明し、気候変動下での真菌感染症リスク増大への示唆を与えたものである。
PolyGenie: a reproducible Nextflow pipeline for phenome-wide association studies using polygenic risk scores
PolyGenie は、事前計算された多遺伝子リスクスコアとコホート表現型データを入力として受け取り、スケーラブルな PheWAS 分析、SQLite データベースへの結果保存、および対話型 Web アプリケーションによる可視化を実現する、オープンソースの Nextflow パイプラインである。