A Coma Pattern-Based Autofocusing Method Resolves Bacterial Cold Shock Response at Single-Cell Level
本研究は、温度変化に伴う焦点ズレをナノメートル精度で補正する新たな自動焦点技術「LUNA」を開発し、これにより単一細胞レベルで細菌の寒さショック応答の連続的な成長・分裂動態と適応メカニズムを解明した。
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microbiology
816 件の論文
Occurrence of Carbapenem-resistant Enterobacterales in swine wastewater in Shandong Province, China
山東省の豚廃水から回収されたカルバペネム耐性大腸菌の分子疫学的解析により、多剤耐性性や多様な遺伝子型（特にST10 と ST5299）の存在、および複数の耐性遺伝子の共保有が確認され、豚廃水における監視の重要性が強調されました。
From genomic decay to functional advantage: Traits of a persistent, thermally beneficial coral probiotic
この論文は、宿主依存の進化痕跡に基づいて選抜された珊瑚共生菌（Ruegeria MC10-B4）が、同所的な他菌株よりも優れ、熱ストレス耐性を向上させるメカニズム（鉄獲得、バイオフィルム形成、運動性から付着性への転換など）を明らかにし、従来の機能基準ではなく進化的アプローチによる持続的かつ機能的なプロバイオティクス設計の有効性を示したものである。
Universal rapid RNA-based quantification of toxigenic Alexandrium species (Dinophyceae) using quantitative recombinase polymerase amplification
本研究では、サキシトキシン生合成に関与する sxtA4 転写産物を標的とした等温定量逆転写 RPA 法（qRT-RPA）を開発し、15 分以内で迅速かつ高感度に有毒な Alexandrium 属の藻類を検出・定量できる携帯型の早期警戒システムを確立しました。
The induction of systemic resistance to barley powdery mildew by rhizosphere bacterial communities does not disrupt the structure or function of native microbial communities
本論文は、大麦のうどんこ病に対する誘導全身抵抗性を誘発する合成微生物群（SynComs）が、植物の防御応答を活性化しつつも、根圏の native な微生物群集の構造や機能に大きな乱れをもたらさないことを示している。
Virulence and antimicrobial resistance features among clades of Escherichia coli ST131 strains causing community-acquired urinary tract infection in Rio de Janeiro, Brazil
この研究は、リオデジャネイロの外来性尿路感染症患者から分離された Escherichia coli ST131 株を解析し、特にサブクレード C2 が多剤耐性と高い病原性因子を有し、ブラジルにおけるこの高リスククローンの拡散と持続に主要な役割を果たしていることを明らかにしたものである。
Metabolic specialization structures gut bacterial niches and drives colorectal cancer progression
本論文は、代謝特化が腸内細菌のニッチを形成し、特に腫瘍組織に特異的に存在する「Leptotrichia wadei」がマクロファージの M2 型極性を誘導して大腸がんの進行を促進する新たなドライバーであることを明らかにした。
The CLAMP-Linked Invasion Protein (CLIP) plays an essential role in Plasmodium berghei zoites
本研究は、クリスパー法を用いたマラリア原虫（Plasmodium berghei）の遺伝子改変により、CLAMP-CLIP-SPATR 複合体を構成する CLIP 蛋白が、赤血球への侵入および肝細胞への感染において宿主細胞侵入に不可欠な役割を果たしていることを明らかにしました。
Interferon-β Coordinates Epithelial Immune Networks and Fibrotic Responses During Chlamydia muridarum Infection
本研究は、Chlamydia muridarum 感染においてインターフェロン-βが上皮細胞の免疫ネットワークを統合し、その欠乏が炎症反応の乱れと組織リモデリング（線維化）を促進することを明らかにしました。
Three immunoregulatory signatures define non-productive HIV infection in CD4+ T memory stem cells
本論文は、HIV 非産生的感染を呈する CD4+ 記憶幹細胞が、免疫調節に関与する遺伝子発現シグネチャーを特徴とし、これが免疫回避と HIV 貯蔵庫の持続に寄与していることを明らかにしたものである。
A novel peptide modulator of a two-component system revealed by the specific activation of a small RNA in Enterobacteriaceae
本論文は、大腸菌の酸応答性二成分系 RstB-RstA が OmrB sRNA を特異的に活性化し、その標的である asr-ydgU オペロンが YdgU 小タンパク質による負のフィードバックと Asr による正のフィードバックという二重のメカニズムでこの二成分系を制御することを明らかにし、YdgU を samT と命名したことを報告しています。
Redox distribution of Asgard archaea and co-occurring taxa in microbial mats from an early Proterozoic ecosystem analog
エチオピアのカトリーヌ火山湖の微生物マットを対象とした本研究は、真核生物の起源となるアスガルド古細菌が、初期地球環境を模した低酸素・硫化水素環境において硫酸還元菌と共生し、好気的呼吸ではなく硫酸還元やメタン生成などの代謝を基盤とした共生関係で繁栄していたことを示唆しています。
ApeA cleaves genomic RNA to defend against RNA phage infection
本研究は、細菌の防御システム ApeA が RNA ファージの感染を検知してそのゲノム RNA を切断し、細胞死を伴わずにウイルス複製を直接阻止する新たな抗 RNA ファージ防御機構であることを明らかにしました。
Dispersal, adaptation and persistence of H5N1 in the sub-Antarctic and Antarctica
2023 年に南極圏および亜南極地域に到達した高病原性鳥インフルエンザ H5N1 が、大型の海鳥の長距離移動を介して広範囲に拡散し、アザラシやペンギンなどに甚大な被害を与えながら哺乳類適応変異を蓄積して進化している実態が、8,000 キロメートルにわたる 104 件の新規ゲノム配列解析によって明らかにされました。
Alignment-Free Guided Design of a Pan-Orthoflavivirus RT-qPCR Assay
本研究は、アライメントフリーの k-mer 解析とコンパクト化 De Bruijn グラフを用いて Orthoflavivirus 属（デング、ジカ、日本脳炎ウイルスなど）の高度に変異するゲノムから保存領域を同定し、高感度かつ広域に検出可能な汎用 RT-qPCR 検査法の開発と臨床的有効性を検証したものである。
Determination of GLP-1 Secretion Potential of Dead and Live Akkermansia muciniphila Using Human L-cells
この研究は、ヒト腸内分泌細胞を用いた実験により、Vidya Herbs 社の独自株である生および死菌（パストゥリゼーション処理）の*Akkermansia muciniphila*が GLP-1 分泌を促進し、特に生菌が菌株および生存状態に依存して最も高い効果を発揮することを明らかにしました。
Pharmacological METTL3 inhibition attenuates HIV-1 latency reversal in CD4+ T cells
本研究は、METTL3 阻害剤が HIV-1 の m6A 修飾レベルを低下させることで潜伏感染の再活性化を抑制することを示したが、STM3006 や STC-15 は STM2457 に比べて細胞毒性が高いため、STM2457 が治療戦略として有望であることを明らかにした。
DksA-Dependent Stringent Stress Response Drives Virulence and Gastrointestinal Persistence of Klebsiella pneumoniae
本論文は、Klebsiella pneumoniae において DksA が厳格応答の中心的統合因子として、細胞包膜ストレス耐性、カプセル合成、バイオフィルム形成を制御し、腸内定着、環境生存、および伝播を媒介する重要な因子であることを実証したものである。
Performance of shotgun metagenomic sequencing for detection of fungi and parasites across clinical sample types: a multicenter retrospective study.
この多施設後方視性研究は、臨床サンプルの種類に応じたリード数閾値を設定することで、ショットガンメタゲノムシーケンシングが真菌および寄生虫の検出において標準検査と同等以上の性能を発揮し、その臨床実装を支持する閾値を確立したことを示しています。
Bacterial endosymbionts enhance fungal virulence by disrupting the disease-suppressive rhizobiome
本論文は、トマトのフザリウム萎ちょう病病原菌が内生細菌を介して抗生物質ベアベリシンを産生し、病気を抑制する土壌細菌（ストレプトマイセス属など）の増殖を阻害することで、植物の病害抵抗性を弱め病原性を高めるという、真菌・細菌・土壌微生物叢の三者間の相互作用を解明したものである。