微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。

Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。

以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。

Distinct virus-specific regulation of RNA synthesis across genome segments by thogotovirus polymerases: insights from Oz virus and Dhori virus

オズウイルスとドホリウイルスのミニゲノム系を用いた研究により、チゴトウイルス属内でもゲノムセグメント間の RNA 合成調節がウイルス種によって異なり、特にオズウイルスでは遠位二重鎖の特定の塩基対(5'12/3'11)がプロモーター活性を決定するが、ドホリウイルスでは影響を受けないことが明らかになった。

Rakib, T. M., Mashimo, R., Akter, L., Shimoda, H., Kuroda, Y., Matsugo, H., Matsumoto, Y.2026-04-01🦠 microbiology

Antibiotic Exposure Through Human Milk Influences the Infant Gut Microbiome

本研究は、授乳中の母親の抗生物質投与が母乳を介して乳児の腸内細菌叢や代謝物に影響を与え、特に人工乳の併用によりその影響が増幅され、結果として乳児の肥満リスク上昇につながる可能性を示唆しています。

Kvitne, K., Zuffa, S., Charron-Lamoureux, V., Patan, A., Agongo, J., Cai, J., Deleray, V., El Abiead, Y., Xing, S., Zemlin, J., Thomas, S., Nelson, M., Gant, A., Ghadishah, A., Lam, A., Ho, B., Momper (…)2026-04-01🦠 microbiology

Antimicrobial Combination Effects at Sub-inhibitory Doses do not Reliably Predict Effects at Inhibitory Concentrations

本論文は、抗菌薬の相乗効果や拮抗作用を評価する際、臨床的に重要な阻害濃度における効果を予測するために、非阻害濃度での単一測定に依存するのではなく、広範な濃度範囲と混合比率における時間分解されたデータを包括的に評価する必要があることを示している。

Muetter, M., Angst, D. C., Regoes, R. R., Bonhoeffer, S.2026-03-31🦠 microbiology

Body-wrapping anterior flagella drive ultrafast swimming in bacterial zoospores

本論文は、Actinoplanes missouriensis の遊走子が、従来の後部鞭毛束とは異なり、体幹を巻き付くように配置された多数の鞭毛が同期して回転することで、微生物史上最高レベルの相対速度(約 500 体長/秒)を実現する新たな遊泳メカニズムを解明したことを報告しています。

Uemura, N. A., Ishida, T., Sowa, Y., Jang, M.-S., Tezuka, T., Nakane, D., Ohnishi, Y.2026-03-31🦠 microbiology

Lethal Sudan virus infection in IFNAR-/- mice reveals hallmarks of a cytokine storm

IFNAR 欠損マウスを用いたスーダンウイルス感染研究により、同モデルが全身性のウイルス拡散とサイトカインストーム様反応を誘導し、フィロウイルスの病態解明や免疫調節異常の調査に有用なことが示されました。

Gellhorn Serra, M., Rohde, C., Sauerhering, L., Meier, L., Kämper, L., Neubecker, P., Eickmann, M., Kupke, A., Becker, S., Werner, A.-D.2026-03-31🦠 microbiology

SCCmecExtractor: A tool for extracting Staphylococcal Cassette Chromosome elements from Whole Genome Sequences

本研究は、メチシリン耐性遺伝子(mec)の有無にかかわらず、全ゲノム配列からブドウ球菌カセット染色体(SCC)要素の境界を特定し、その配列を抽出して遺伝子構成を解析する新しい軽量ツール「SCCmecExtractor」を開発し、多様なブドウ球菌属において非耐性型 SCC 要素が広く存在することを明らかにした。

MacFadyen, A. C.2026-03-31🦠 microbiology

A replication-centered phylogeny illuminates the evolutionary landscape of bacterial plasmids

本研究は、PInc と呼ばれる実験的に裏付けられた複製開始タンパク質(RIP)に基づく分類枠組みを確立し、その保存されたウィングドヘリックス領域を用いて大規模な系統解析を行うことで、従来の宿主偏りを超えた細菌プラスミドの進化史と多様性を包括的に解明しました。

Nishimura, Y., Kaneko, K., Kamijo, T., Isogai, N., Tokuda, M., Xie, H., Tsuda, Y., Hirabayashi, A., Moriuchi, R., Dohra, H., Kimbara, K., Suzuki-Minakuchi, C., Nojiri, H., Suzuki, H., Suzuki, M., Shin (…)2026-03-30🦠 microbiology

A set of constitutive promoters with graded strengths for gene expression in diverse cyanobacterial strains

この論文は、モデルおよび非モデルの多様なシアノバクテリア株において、合成 PconII プロモーターの変異体から選抜された強度が段階的に異なる 25 個の直列構成プロモーターのセットを特徴づけ、バイオテクノロジー応用に向けた遺伝子発現制御の重要なリソースを提供したことを報告しています。

Trieu, K., Bishe, B., Taton, A., Tieu, B. P., Golden, J. W.2026-03-30🦠 microbiology

A soluble host signal drives rapid, brain-predominant capsular thickening in Streptococcus pneumoniae via a putative sodium-dependent transporter (SPD_0642) and capsular prepromoter sequence

本論文は、肺炎球菌が宿主組織(特に脳)から分泌される可溶性シグナルを感知し、SPD_0642 遺伝子とプロモーター配列を介して数時間以内に莢膜を急速に厚く変化させることで、髄膜炎の重症化や免疫回避を可能にする新たな適応メカニズムを解明したことを報告しています。

Iliev, A. I., Tomov, N., Müller, A., Lekhuleni, C., von Gottberg, A., Hathaway, L. J., Rosconi, F., Baronti, D., Trillo, I., Hupp, S., van Opijnen, T., Lux, J.2026-03-30🦠 microbiology

Personalized microbiotas (counter-)select for antibiotic resistant strains

この研究は、個人の腸内細菌叢が特定の環境下で抗生物質耐性菌に競争優位性を与え、そのメカニズムがグリセロール含有化合物をめぐる栄養競合と遺伝子変異にあることを明らかにし、耐性菌の動態を微生物叢の文脈で理解する新たな道筋を示したものである。

Knopp, M., Garcia-Santamarina, S., Michel, L., Papagiannidis, D., David, S., Selegato, D. M., Wong, J. L. C., Karcher, N., Frankel, G., Zimmermann, M., Savitski, M., Typas, A.2026-03-30🦠 microbiology