微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。

Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。

以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。

🦠 microbiology

Identification of the cellular transcription factor KLF16 as a novel repressive epigenetic repressor of HIV-1 transcription

本研究は、HIV-1 の新たなエピジェネティックな抑制因子である細胞転写因子 KLF16 が、Sp1 と競合し抑制複合体をリクルートすることでウイルス潜伏を維持することを同定し、その阻害が HIV 治療の有望な戦略であることを示唆している。

Santangelo, M., Bendoumou, M., Dutilleul, A., Khalfi, S., PLANT, E., Ngassaki Yoka, C. D., Pilosio, L., Vanhulle, C., Di (…)2026-05-04
🦠 microbiology

Sampling design and inference of the caecal-skin Campylobacter relationship in broilers

本研究はシミュレーションを通じて、ブロイラーの盲腸と carcass 皮膚におけるカンピロバクター濃度の関係を正確に回復する対比サンプリング設計とは対照的に、監視で一般的に用いられる非対比およびプールサンプリング戦略は、この関連性を特定できず、その結果、定量的リスク評価および政策決定に用いられるパラメータの信頼性を損なうことを示している。

Mason, C., Nunney, E., Guitian, J.2026-05-04
🦠 microbiology

Partitioning the roots of interactions between microbes (PRISM): environment-supplied resources versus species-produced mediators

PRISM 研究は、微生物間相互作用を環境資源に起因する寄与と種が産生する代謝物に起因する寄与とに分割するアッセイを開発し、*Staphylococcus* 属の代謝物は一般的に他の鼻内菌株を抑制する一方で、共生性の*Corynebacterium* 属種は*Staphylococcus* 属の増殖を促進し得ることを明らかにし、それによって治療応用に向けた細菌叢のより良い調節のための枠組みを提供する。

Warrier, V., Momeni, B.2026-05-02
🦠 microbiology

An expansive animal gut microbiome dataset elucidates major compositional shifts across bilaterian evolution

本研究は、初期動物におけるプソドモナドータの優位性から四足動物および鳥類におけるバクテロイデータおよびバシロータの優位性へと至る主要な進化的組成変化を明らかにし、祖先の腸内微生物叢を再構築するために、1,553 種にわたる 17,000 以上のサンプルからなる包括的なデータセットである「腸内微生物叢の生命の樹(GMToL)」を導入する。

Degregori, S., Patel, L., Xu, L., Iter, M., Weng, Y., Huang, I., Martel, H. J., Kisselev, D., Zhou, J., Allaband, C., Ac (…)2026-05-01
🦠 microbiology

Clostridioides difficile stimulates CCL20 expression in human colonoid monolayers in a transwell-based co-culture system that supports its anaerobic growth

本研究は、*Clostridioides difficile* の嫌気性増殖を支持するヒト大腸オルガノイド単層を用いた新規トランスウェル共培養系を確立し、この細菌のグルコシル化毒素が上皮細胞における CCL20 発現を誘導するために必要であることを示した。

Zucchi, P., Gladden, A. D., Day, A. W., Dressler, J., Govind, R., Almeqdadi, M., Roper, J., Tai, A., Batorsky, R., Kumam (…)2026-04-29
🦠 microbiology

Reprogrammed peptidoglycan elongation reveals plasticity in bacterial growth modes

本研究は、細菌のペプチドグリカン伸長様式は可塑性を有し、MreB の再局在または PBP2 合成酵素を極へ直接ターゲティングすることによって分散型から極性伸長へと再プログラム可能であることを示しており、これは極性伸長が MreB の喪失を通じて進化してきた可能性を暗示する。

Basurto De Santiago, C., Lin, I. S., Nan, B.2026-04-29
🦠 microbiology

Microbiota-derived indole limits Campylobacter jejuni colonization by inhibiting respiration and metabolism

本研究は、微生物叢由来のインドールが炎症性腸管における主要な呼吸および代謝経路を抑制することにより、*Campylobacter jejuni* の定着を阻害することを示し、これにより共生細菌が自然にこの病原菌の増殖を制限する重要なメカニズムが明らかになった。

Sinha, R., Bhattarai, B., Zimpel, C. K., Ottosen, E., LeVeque, R. M., Singh, P., DiRita, V. J.2026-04-29
🦠 microbiology

Distinct virus-derived circular RNA molecule influences host response during SARS-CoV-2 infection

本研究は、変異株間で保存され、ウイルス感染に依存せずに宿主遺伝子発現を調節し、急性および急性後感染の両方の検出に有望なバイオマーカーとして機能する、新規のSARS-CoV-2由来環状RNA分子circ7b8Nを同定し、その特徴を明らかにした。

Grossi-Soyster, E. N., Gullberg, R. C., Rustagi, A., Lee, J. S., Blish, C. A., Cherry, S., Salzman, J., Sarnow, P.2026-04-28
🦠 microbiology

Omicron evolution drives increased ciliated cell tropism and dysfunction in nasal epithelia.

本研究は、SARS-CoV-2 オミクロン変異株(BA.1、BA.5、XBB)が祖先株と比較して鼻の繊毛細胞に対する親和性が増大しアポトーシスを誘導する一方で、BA.5 や XBB などの後続の変異株は顕著な繊毛消失を引き起こすことなく、組立遺伝子のダウンレギュレーションと運動性タンパク質の喪失を通じて特異的に著しい繊毛機能不全を駆動することを示している。

Mostafavi, H., Parry, R., McCallum, G., Sng, J. D. J., Joensuu, M., Short, K. R., Slonchak, A., Khromykh, A.2026-04-27
🦠 microbiology

A novel adenovirus 19K/IX protein promotes infection by preventing proteasomal degradation of tyrosine-ubiquitinated capsid protein pIX

本研究は、新規の選択的スプライシングを受けたアデノウイルス19K/IXタンパク質が非古典的チロシンユビキチン化を介したプロテアソーム分解を防止するためにカプシドタンパク質pIXに結合してそれを安定化させることにより感染を促進することを明らかにした。

Schubert, E., Evangelopoulos, V. R., Larsson, M., Punga, T.2026-04-27