RfxCas13d Mediates Broad-Spectrum Suppression of Highly Pathogenic Avian Influenza
この論文は、RfxCas13d を用いたプログラム可能な RNA ターゲティング抗ウイルスプラットフォームを開発し、保存されたインフルエンザ RNA 領域を標的とすることで、高病原性鳥インフルエンザウイルスを含む広範なインフルエンザウイルスの抑制を可能にしたことを報告しています。
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microbiology
816 件の論文
Azelaic Acid Exhibits Dual Antimicrobial and Quorum Sensing Inhibitory Activities Against Pathogens: In Vitro Evaluation and Molecular Docking Insights
本論文は、アゼライン酸がグラム陰性菌の病原性因子を直接殺菌せずに阻害するクオラムセンシング阻害剤として機能し、抗菌薬耐性対策における有望な抗病原性戦略であることを初めて実証したものである。
BertMS-enabled molecular networking for unknown compounds dereplication
本論文は、大規模な MS/MS データからフラグメントイオンの文脈表現を学習するトランスフォーマーベースのフレームワーク「BertMS」を提案し、既存手法よりも優れたスペクトル類似度評価を実現することで、代謝物網の構築や未知化合物の同定を高度化することを示しています。
Interspecies transfer of giant virulence-factor-like proteins in a bacterial symbiosis
この論文は、光合成細菌コンソーシアム「Chlorochromatium aggregatum」において、緑硫黄細菌の巨大な病原性因子様タンパク質が共生パートナーへ輸送され、そのカプセル分解や細胞間接触の促進を通じて相利共生を維持するメカニズムを解明し、細菌の病原性因子の進化に新たな視点を提供したことを報告しています。
The Chromobacterium Volatilome is Strongly Influenced by Growth on Liquid versus Solid Media
本論文は、クロモバクテリウム属の揮発性代謝物プロファイル（ボルatilome）が、菌種やクオラムセンシング能力よりも、液体培地と固体培地という生育条件の違いによって最も顕著に影響を受けることを明らかにし、揮発性代謝物解析における培養条件の重要性を強調しています。
Identification of bacterial candidates that promote the growth of the seagrass Zostera marina
本論文は、海草*Zostera marina*の根圏から単離された細菌をゲノムおよび表現型解析し、窒素・硫黄・リンの循環や植物成長促進物質の産生など相補的な機能を持つ 6 菌株からなる最小微生物群を同定することで、海草の回復を支援する新たな戦略を提示したものである。
Inorganic polyphosphate and pyoverdine synthesis are essential for the virulence of Pseudomonas aeruginosa PAO1 in zebrafish larvae
ゼブラフィッシュ幼虫を用いた感染モデルにより、緑膿菌のポリリン酸合成がピオロデリン産生を介して病原性を調節し、ppk1 遺伝子欠損は病原性を減弱させ ppk2 遺伝子欠損は増強させることが示された。
HAC1 contributes to stress adaptation and virulence in the emerging fungal pathogen Candida auris
本論文は、Candida auris における小胞体ストレス応答調節因子 HAC1 が、非定型スプライシングを介してストレス適応性を獲得し、宿主環境での生存と病原性に不可欠な役割を果たしていることを明らかにしたものである。
Carbon and nitrogen availability affect biofilm growth and morphology of the extremotolerant fungus Knufia petricola
極限環境に生息する真菌 Knufia petricola は、栄養制限下でバイオマス形成を抑制しつつ基盤への浸透を促進する探索的成長へシフトし、炭素と窒素の利用可能性がその成長や形態を決定づけることが示されました。
Characterization of mycobiota in faba beans infected with Alternaria spp.
この研究は、ラトビアのソラマメ栽培地において、ITS 領域メタバコディングを用いて分析した結果、開花から成熟期にかけてのサンプリング時期や葉斑病の発生有無が、Alternaria 属を含むソラマメの真菌群集の構造と多様性に重要な影響を与えることを明らかにしたものです。
Impact of WaSH and dietary practices on age-driven gut microbiome in stunted young children
タンザニアのイリンガ地域で行われた本研究は、栄養状態が良好な環境下でも、水・衛生・衛生（WaSH）環境や食習慣が腸内細菌叢の構成と発育遅滞（スタント）に深く関与しており、特に年齢が微生物多様性の最も重要な予測因子であることを明らかにしました。
Cost and benefits of gene amplification-mediated antibiotic resistance
この論文は、Enterobacter cloacae における遺伝子増幅（GDA）が抗生物質濃度や曝露時間に応じて耐性レベルと生理的コストのトレードオフを形成し、特に高濃度環境では逆説的に殺菌感受性を高めるという、文脈依存的な適応メカニズムを明らかにしたものである。
Biodegradation of components from an oxidized polyethylene by a Rhodococcus strain isolated from the gut of Atlantic Salmon
大西洋サーモンの腸から単離された Rhodococcus 株 ASF-10 が、酸化ポリエチレンの低分子量モデル基質を分解する能力を持ち、そのメカニズムにモノオキシゲナーゼやバイオフィルム形成タンパク質などが関与していることが示されました。
Coordinated topoisomerase function shapes the fluoroquinolone response of Chlamydia trachomatis
本論文は、クラミジア・トラコマティスにおける DNA 超らせんレベルの段階的変化がフルオロキノロン系抗菌薬の感受性を決定し、トポイソメラーゼの協調的な機能調節が持続感染の形成と耐性に関与していることを示しています。
Efficient plasmid-based rescue of T7 RNA polymerase-driven calicivirus reverse genetics systems in mammalian cells using vaccinia virus RNA capping enzymes
本研究は、ワクシニアウイルスのRNA キャッピング酵素（D1R および D12L）と T7 RNA ポリメラーゼを発現するプラスミドを併用することで、マウスノロウイルスの逆遺伝学システムにおけるウイルス titres を大幅に向上させ、高スループットな変異体評価を可能にする新規手法を確立したものである。
High specificity meets genomic flexibility in the Siphamia-Photobacterium symbiosis
本論文は、熱帯から温帯にかけてのシフナギ属魚類が特定の発光細菌（Photobacterium mandapamensis）と厳密な共生関係を維持しつつ、その共生細菌が宿主特異的な系統分化や可動遺伝子要素の拡大など、ゲノムおよび表現型の高い柔軟性を示していることを明らかにした。
A Thousand Meters Deep: Vertical Profiling of the Subterranean Microbiome of Gourgouthakas Cave
ギリシャの深部洞窟「ゴルゴウサカス」から採取された微生物群集を解析した本研究は、未知の二次代謝産物産生能や植物病原菌に対する強力な生物防除活性（特に Pseudomonas 属 SRL917 株によるトマトの灰かび病抑制など）を有する新規菌株を発見し、深部地下生態系が持続可能な農業への応用可能性を秘めた微生物の宝庫であることを示しました。
The broad-spectrum RumC1 bacteriocin targets a transient peptidoglycan intermediate of the nascent cell wall
本論文は、多剤耐性菌を含む広範な細菌に対して作用するバクテリオシン RumC1 が、細胞壁合成の中間体であるペプチドグリカンの特定の段階を標的として細胞増殖を停止させる新たなメカニズムを解明したものである。
Phageome transfer from gut to circulation and its regulation by human immunity
この研究は、腸管から血流へのバクテリオファージの移行が、腸粘膜での通過制限、リンパ系での段階的減少、そしてヒトの免疫系による IgG 介在の中和という連続的なフィルターによって厳密に制御されていることを明らかにしました。
Synergistic latency reversal by the IAP antagonist AZD5582 and BET inhibitor JQ1, combined with Nef ablation, facilitates immune-mediated elimination of latently HIV-1-infected T-cells
本論文は、IAP 拮抗薬 AZD5582 と BET 阻害薬 JQ1 の併用による潜伏 HIV-1 の再活性化と表面 Env 発現の向上に加え、Nef 遺伝子の欠損を組み合わせることで、潜伏感染 T 細胞の免疫介在性排除を最大化し、HIV 根治への有望なアプローチを提示したことを報告しています。