微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。

Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。

以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。

Female-enriched Eggerthella lenta drives neuroinflammation and IFN-γ via host receptor TLR2

この論文は、女性に多い腸内細菌「Eggerthella lenta」が宿主の TLR2 受容体を介して IFN-γ産生を誘導し、神経炎症や多発性硬化症の発症を促進することで、自己免疫疾患の性差に寄与するメカニズムを解明したことを報告しています。

Rock, R. R., Alexander, M., Noecker, C., Trepka, K., Upadhyay, V., Ortega, E., Ramirez, L., Siewart, L., Olson, C., Halsey, T., Probstel, A.-K., Baranzini, S., Turnbaugh, P. J.2026-03-19🦠 microbiology

Selective effects of cyclin dependent kinase inhibitors in gammaherpesvirus reactivation from latency

本論文は、CDK 阻害剤がガンマヘルペスウイルスの再活性化に及ぼす影響をマウスモデルと EB ウイルスで検討し、広域 CDK 阻害剤は再活性化を抑制する一方、CDK4/6 阻害剤の効果は投与タイミングに依存することを明らかにし、これらが関連がんの治療に応用可能であることを示唆しています。

Gibson, J. E., van Dyk, L. F.2026-03-19🦠 microbiology

BertMS-enabled molecular networking for unknown compounds dereplication

本論文は、大規模な MS/MS データからフラグメントイオンの文脈表現を学習するトランスフォーマーベースのフレームワーク「BertMS」を提案し、既存手法よりも優れたスペクトル類似度評価を実現することで、代謝物網の構築や未知化合物の同定を高度化することを示しています。

Luning, Z., Shuang, W., Jixing, P., Xiaofei, H., Wenxue, W., Dehai, L.2026-03-19🦠 microbiology

HAC1 contributes to stress adaptation and virulence in the emerging fungal pathogen Candida auris

本論文は、Candida auris における小胞体ストレス応答調節因子 HAC1 が、非定型スプライシングを介してストレス適応性を獲得し、宿主環境での生存と病原性に不可欠な役割を果たしていることを明らかにしたものである。

Oiki, S., Abe, M., Hirasawa, A., Koizumi, A., Otani, A., Shinohara, T., Miyazaki, Y.2026-03-19🦠 microbiology

Carbon and nitrogen availability affect biofilm growth and morphology of the extremotolerant fungus Knufia petricola

極限環境に生息する真菌 Knufia petricola は、栄養制限下でバイオマス形成を抑制しつつ基盤への浸透を促進する探索的成長へシフトし、炭素と窒素の利用可能性がその成長や形態を決定づけることが示されました。

Dehkohneh, A., Schumacher, J., Cockx, B. J. R., Keil, K., Camenzind, T., Kreft, J.-U., Gorbushina, A. A., Gerrits, R.2026-03-19🦠 microbiology

Cost and benefits of gene amplification-mediated antibiotic resistance

この論文は、Enterobacter cloacae における遺伝子増幅(GDA)が抗生物質濃度や曝露時間に応じて耐性レベルと生理的コストのトレードオフを形成し、特に高濃度環境では逆説的に殺菌感受性を高めるという、文脈依存的な適応メカニズムを明らかにしたものである。

Fang, Y., Kupke, J., Steiner, U., Tedin, K., Fulde, M.2026-03-19🦠 microbiology

Biodegradation of components from an oxidized polyethylene by a Rhodococcus strain isolated from the gut of Atlantic Salmon

大西洋サーモンの腸から単離された Rhodococcus 株 ASF-10 が、酸化ポリエチレンの低分子量モデル基質を分解する能力を持ち、そのメカニズムにモノオキシゲナーゼやバイオフィルム形成タンパク質などが関与していることが示されました。

Sandholm, R., Rojas Calderon, D., Hansen, M. T., Chowreddy, R. R., Vaaje-Kolstad, G., La Rosa, S. L.2026-03-19🦠 microbiology

Efficient plasmid-based rescue of T7 RNA polymerase-driven calicivirus reverse genetics systems in mammalian cells using vaccinia virus RNA capping enzymes

本研究は、ワクシニアウイルスのRNA キャッピング酵素(D1R および D12L)と T7 RNA ポリメラーゼを発現するプラスミドを併用することで、マウスノロウイルスの逆遺伝学システムにおけるウイルス titres を大幅に向上させ、高スループットな変異体評価を可能にする新規手法を確立したものである。

Buchanan, F. J. T., Loi, M., Chim, C., Zhou, S., Penrice-Randal, R., Neves, L. X., Erdmann, M., Emmott, E.2026-03-19🦠 microbiology

High specificity meets genomic flexibility in the Siphamia-Photobacterium symbiosis

本論文は、熱帯から温帯にかけてのシフナギ属魚類が特定の発光細菌(Photobacterium mandapamensis)と厳密な共生関係を維持しつつ、その共生細菌が宿主特異的な系統分化や可動遺伝子要素の拡大など、ゲノムおよび表現型の高い柔軟性を示していることを明らかにした。

Osland, H. K., Neff, E., Gaisiner, A., Hays, D., Gould, A. L.2026-03-19🦠 microbiology

MATRIX: Rapid Quantification of Total and Active Microbial Cells with Single Cell Phenotypes for Environmental Microbiomes

この論文は、環境微生物群集における総細胞数と活性細胞数を迅速かつ定量的に評価し、単一細胞レベルの表現型データを提供する新規ワークフロー「MATRIX」を開発し、その再現性と汎用性を培養菌および土壌群集を用いて実証したことを報告しています。

Gonzalo, M., Liu, X., Dufour, Y. S., Shade, A.2026-03-18🦠 microbiology