499 件の論文
微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。
Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。
以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。
本論文は、ゲノム解像度メタゲノム解析を用いて、海洋の抗生物質耐性遺伝子プールが生態学的な基盤機能と人間活動による選択的増幅を統合しており、特にバルト海のような人間の影響が強い海域では、分類学的な背景を超えて環境要因が耐性遺伝子の密度を著しく高めていることを明らかにした。
本研究では、RNA や ATP からのアデニン放出を抑制し、細胞内の遊離アデニンを補正する改良手法を開発することで、細胞形態の影響を受けずに酵母のゲノム DNA 含有量に基づく正確な定量を可能にするアデニン-HPLC 法を確立しました。
本論文は、大腸菌において細胞伸長に関わるペプチドグリカン合成の阻害を抑制する変異体を探索した結果、リン脂質合成酵素 PlsX の失活が LPS 合成を促進し、PlsX 産生物であるアシルリン酸が LPS 合成酵素 LpxC を阻害することでリン脂質と LPS の合成を協調的に制御している可能性を明らかにしたものである。
本研究では、RB-TnSeq 法を用いて植物共生細菌 Klebsiella sp. M5al の 25 種（5 科）のファージ感染に必要な宿主遺伝子を網羅的に同定し、受容体合成に関わる遺伝子の破壊が広範な耐性を、細胞内遺伝子の破壊がファージ特異的な感染戦略の違いをもたらすことを明らかにしました。
オミクロン変異株 KP.3.1.1 および LP.8.1 の受容体結合ドメインを対象とした深層変異スキャンにより、455、456、493 番などのエピスタシス・ホットスポット残基におけるアミノ酸選好性が変異株間で継続的に変化しており、ウイルスの進化軌道予測や将来の抗原進化戦略の理解に重要な知見が得られた。
この論文は、マラリア原虫が産生するヘモゾイン結晶そのものではなく、それに付随するタンパク質が脳血管内皮細胞のバリア機能を破壊する主要な因子であることを明らかにし、脳型マラリアの新たな治療戦略への道を開いたことを示しています。
本論文は、RNA シーケンシングを用いて大腸菌が銅ストレスに応答して酸化ストレス防御、ヒスチジン産生、鉄獲得遺伝子などを広範にアップレギュレーションすることを明らかにしたが、Horizon Discovery の GFP ベースの_promoter_ライブラリはノイズ比が低く大規模スクリーニングには不向きであることを示した。
本研究は、サルモネラ、yersinia、黄色ブドウ球菌の 3 種の人病原菌を対象に、10 種類の感染関連ストレス条件下でトランスクリプトームとプロテオームデータを統合解析し、ストレス応答が mRNA とタンパク質レベルの相関を低下させ、特に必須遺伝子や翻訳調節を介した適応メカニズムが病原菌の生存に重要であることを明らかにしました。
本論文は、バイオインフォマティクスと機械学習を統合したパイプラインを用いて、大腸癌や口腔癌との関連が指摘されている Fusobacterium nucleatum の病原性島を同定し、溶血素を介した鉄獲得メカニズムが酸化ストレスや Hippo 経路を介して癌を促進するという仮説を提唱したものである。
本研究は、Pseudomonas aeruginosa の高解像度時間経過データを用いて、従来の感受性指標が見過ごしている過渡的動態と接種量依存効果を定量化する新しい計算パイプラインを開発し、集団動態を記述する微分方程式モデルの特定と、異なる動態領域を分類する新規指標の提案を実現した。