微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。

Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。

以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。

Limitations of inferring antiviral efficacy of interfering particles from observational natural histories

この論文は、自然発生的な欠損 HIV ゲノムに関する最近の観察研究が治療的干渉粒子(TIPs)の有効性を否定する根拠として不適切であり、報告された基本再生産数(R0)の測定値に内部矛盾があるほか、既存のメカニズムでも同様の現象を説明可能であることを示しています。

Khetan, N., Vasen, G., Smith, D. M., Weinberger, L.2026-03-12🦠 microbiology

GM-CSF and M-CSF Driven Differentiation Differentially Regulates Chikungunya Virus Infection and Antiviral Responses in Human Monocyte-Derived Macrophages

GM-CSF による分化はマクロファージのチクングニアウイルス感染を許容するのに対し、M-CSF による分化は dsRNA 感知を介した抗ウイルス応答を誘導して感染を抑制し、マクロファージの分化様式がウイルス感受性と免疫応答の決定要因となることを示しました。

Veloz, J., Zyulina, V., Thannickal, S., Chebishev, E., Bernal-Rubio, D., Villanueva Guzman, M. D. M., Wu, C., Valencia, E., Novillo, D., Dhamapurkar, V., Espinar Barranco, L., Webb, L. G., Fenutria, R (…)2026-03-12🦠 microbiology

DropletFactory CORE - a droplet cytometry and sorting platform for fast and accessible screening in biotechnology

本論文は、酵母細胞の蛍光シグナルに基づく単一細胞スクリーニングを可能にする安価でアクセスしやすい液滴細胞計測・分選プラットフォーム「DropletFactory CORE」を開発し、バイオテクノロジー分野における高スループットスクリーニングの民主化を推進したことを報告しています。

Veere, R., Zenner, M. N., Afroz, A., Joemaa, R., Olman, T., Bartkova, S., van der Hoek, S. A., Melkic, A., Zheng, A. J. L., Laki, A. J., Laki, M., Pardy, T., Scheler, O.2026-03-12🦠 microbiology

Hydraulic modelling reveals untreated sewage, not pharmaceutical waste, drives antimicrobial resistance in a small river running through a big city

インドのハイデラバードを流れるムシ川における抗菌剤耐性(AMR)の主要な駆動要因は、製薬廃棄物ではなく、未処理の生活排水であることが、現場調査と水理モデルを用いた研究で明らかになった。

Sonkar, V., Kashyap, A., Pallares-Vega, R., Sasidharan, S. S., Modi, A., Uluseker, C., Chandrakalabai Jambu, S., Mohapatra, P. K., Larsen, J., Graham, D. W., Thatikonda, S., Kreft, J.-U., AMRflows con (…)2026-03-11✓ Author reviewed 🦠 microbiology

Genetic and pharmacological inactivation of peptidoglycan remodeling increases antibiotic susceptibility of vancomycin-resistant Enterococcus faecium

本研究は、NlpC/P60 ペプチドグリカン加水分解酵素 SagA の遺伝的および薬理学的阻害が、ペプチドグリカンのリモデリングを妨げ、バンコマイシン耐性腸球菌(VREfm)に対するバンコマイシンの感受性を高めることを示し、この酵素が VREfm 治療の新たな創薬ターゲットとなり得ることを明らかにしました。

Fam, K. T., Chodisetti, P. K., Wang, Z., Homer, J. A., Smedley, C. J., Kitamura, S., Silva, B., Xiong, Y., Hansel-Harris, A., Holcomb, M., Babarinde, S., Turner, A. M., Van Tyne, D., Wilson, I. A., Fo (…)2026-03-11🦠 microbiology

Global climate gradients structure soil Legionella diversity, relative abundance and pathogen distributions

本論文は、全球の土壌サンプルを用いた大規模解析により、レジオネラ属(特に病原性種)の分布と多様性が降水量や気温などの気候勾配および地理的分散によって強く規定されており、将来の気候変動に伴い土壌が重要な感染源となり得ることを示唆しています。

Singh, H., Yuan, M.2026-03-11🦠 microbiology

Parallelised detection of bacteria viability using an electrode array and the Exeter Multiscope

本論文は、電気刺激に対する細菌の蛍光応答を Exeter Multiscope の 2x2 並列アレイで検出する手法を提案し、2 時間の培養後に 1 分未満で抗菌薬の有効性を迅速かつスケーラブルに判定可能であることを実証したものである。

Lee, K. K., Horsell, D., Stratford, J., Karlikowska, M., Khattak, S., de-Souza-Guerreiro-Rodrigues, T., Jiang, J., Shaw, M., Pagliara, S., Corbett, A. D.2026-03-11🦠 microbiology

Introducing a gastric microbial model community

本論文は、H. pylori と他の 4 種の大腸菌・乳酸菌などからなる人工胃内微生物モデル群を構築し、H. pylori の増殖が他の菌種(L. kalixensis を除く)によって阻害されるメカニズムを解明することで、胃内微生物叢の相互作用と H. pylori の病原性に関する非侵襲的な研究モデルを提供することを目的としている。

Dannborg, M., Linden, S., Thorell, K., Bengtsson-Palme, J.2026-03-11🦠 microbiology

Multi-continental detection of Streptococcus pyogenes M1UK: Impact of ssrA SNP on SpeA expression in ancestral and M1UK isolates

Streptococcus pyogenes M1UK 系統の拡大に寄与する SpeA 毒素発現は ssrA 遺伝子の変異によって調節されるが、CovRS などの複雑な制御ネットワークも関与しており、単一の変異だけで発現が決定されるわけではないことが示されました。

Vieira, A., Li, H. K., Zhi, X., Reeves, L., Huse, K. K., Mok, K. Y., Cowen, O., Jauneikaite, E., Coelho, J., Sriskandan, S., Soo, V. W.2026-03-10🦠 microbiology