TracePheno Enables Function-First Inference of Trace-ElementPhenotypes from Microbiome Profiles
TracePheno は、ゲノム注釈や予測された KO テーブルから、鉄や亜鉛などの 8 種類の必須微量元素に関連する微生物の表現型を、明確で生物学的に制約されたルールに基づいて推論し、解釈可能な可視化結果を提供する機能中心のフレームワークです。
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microbiology
499 件の論文
微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。
Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。
以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。
Restraint of Powassan virus replication by TRIM5α facilitates viral avoidance of antiviral immunity
本研究は、霊長類の TRIM5α がダニ媒介性フラビウイルスの複製を抑制する一方で、Powassan ウイルスの NS3 遺伝子変異が TRIM5α の阻害を回避し、結果としてウイルスが早期の自然免疫認識を逃れることを可能にしていることを明らかにしました。
Respiratory microbiota as a health biomarker in blue, fin and humpback whales: Pilot study in the Gulf of St-Lawrence (Quebec, Canada)
このパイロット研究では、カナダのセントローレンス湾でクジラ（シロナガスクジラ、ザトウクジラ、ミンククジラ）の呼気（ブロウ）から得られた微生物叢データを解析し、微生物多様性と健康状態（皮膚のコンディションや病原性細菌の存在）との関連性を示すことで、ブロウ微生物叢が非侵襲的なクジラの健康バイオマーカーとして機能しうることを初めて実証しました。
Virological investigation of elephant endotheliotropic herpesvirus 1B infection in an Australian captive herd of Asian elephants (Elephas maximus)
オーストラリアの飼育下アジアゾウ群における EEHV1B 感染の致死症例を調査した本研究は、臨床発症時の劇的なウイルス血症、保存媒体による検出効率の差異、および EEHV 亜種間の組換えを示すゲノム解析を通じて、このウイルスの病原性や診断・治療への示唆を明らかにしました。
Comparison of Galleria mellonella, Epithelial Cell Cytotoxicity, and Mouse Model of Bacteremia to Measure Pseudomonas aeruginosa Virulence
本論文は、105 株の緑膿菌臨床分離株を用いた比較研究により、マウス敗血症モデルにおける病原性と相関性が中程度に高いことが示されたワックスガの幼虫（Galleria mellonella）モデルが、大規模な集団レベルの病原性評価におけるマウスモデルの有効な代替手段となり得るが、最終的な結論はマウスでの検証が必要であることを示唆しています。
Free-Living Amoeba act as transient permissive hosts for Leptospira spp.
本研究は、自由生活性アメーバが病原性および腐生性のレプトスピラを貪食し、細胞内での増殖は伴わないものの最大 48 時間生存を可能にすることで、土壌環境におけるレプトスピラの持続と伝播に寄与する一時的な宿主として機能することを明らかにしました。
Non-canonical peptidoglycan cross-linking is essential for Mycobacterium tuberculosis acid resistance
Mycobacterium tuberculosis において、ペプチドグリカンの非標準的な架橋を担う酵素 LdtB が酸性ストレス耐性や細胞内 pH 恒常性の維持に不可欠であり、これを阻害することでβ-ラクタム系抗生物質の殺菌活性を高めることができることが示されました。
Vibrio parahaemolyticus quorum sensing controls phage VP882 transmission
本研究は、海洋細菌*Vibrio parahaemolyticus*が高密度でクオラムセンシングを介して多糖類を分泌しファgp VP882 の付着を阻害する一方、このファg が宿主の溶原化状態を問わず超感染・超溶原化を可能にし、さらにゲノム再組換えを通じて多様性を促進することで、宿主密度に応じた効率的な伝播戦略を確立していることを明らかにした。
SARS-CoV-2 virus infection of Peromyscus leucopus demonstrates that infection tolerance is not limited to agents for which deermice are reservoirs
北米のシロアシネズミ（Peromyscus leucopus）が、自然宿主ではない SARS-CoV-2 にも感染耐性を示し、ウイルスに感染しても過剰な炎症反応を起こさずに病気を抑制できることを実証した。
Blautia wexlerae Transforms Dietary Fatty Acids to Activate Enteroendocrine Signaling and Improve Metabolic Health in Mice and Humans
この論文は、腸内細菌の一種である Blautia wexlerae が食事由来の脂肪酸を代謝してアシルアミンを生成し、これが腸内分泌細胞を刺激して GLP-1 などのホルモン分泌を促進することで、マウスおよびヒトにおいて血糖コントロールの改善や食欲抑制、ひいては代謝健康の向上をもたらすメカニズムを解明したことを報告しています。