微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。

Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。

以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。

Taxonomy-agnostic hyperspectral-morphological phenotyping of fungal pathogen chemical-stress responses using machine learning

この論文は、機械学習とハイパースペクトルイメージングを統合した手法により、真菌の系統分類に依存せず、作物由来の隔離株ごとの化学的ストレス応答パターンを高精度に識別し、環境に優しい殺菌剤の迅速なスクリーニングを可能にする新たなワークフローを提案しています。

Baek, I., Lim, S., Lovelace, A., Oh, S., Kazem-Rostami, M., Ngo, H., Kim, M., Meinhardt, L., Kandpal, L., Cha, M., Hwang, C., Ashby, R., Ahn, E.2026-02-17🦠 microbiology

Diversity and stability of the gut microbiome of naked mole-rat (Heterocephalus glaber), the longest-lived rodent

本研究は、16S rRNA 遺伝子シーケンシングとメタゲノム解析を用いて、長寿命のネズミであるモグラネズミの腸内微生物叢が年齢を超えて安定しており、植物細胞壁の分解やメタン生成に関与する独特な微生物群と酵素を有していることを明らかにし、これがその低代謝と驚異的な長寿と関連している可能性を示唆した。

Rakhimov, A., Yasuda-Yoshihara, N., Arita, M., Okumura, K., Kawamura, Y., Oka, K., Mori, H., Wakabayashi, Y., Baba, Y., Baba, H., Miura, K.2026-02-17🦠 microbiology

A Python module for programmatic access to TrypTag genome-wide subcellular protein localisation data in Trypanosoma brucei

この論文は、トリパノソーマ・ブルセーのゲノム規模のタンパク質局在データセット「TrypTag」をプログラム的に検索・解析するための Python モジュールを開発し、細胞分裂時の細胞小器官の非対称性を明らかにするなどの応用例を示したものである。

Dobramysl, U., Wheeler, R. J.2026-02-17🦠 microbiology

Characterisation of naturally occurring MERS-CoV Spike mutations and their impact on entry and neutralisation.

本研究は、MERS-CoV のスパイクタンパク質に自然発生する変異がウイルスの細胞侵入効率や中和抵抗性に与える影響を評価し、公衆衛生リスクの把握と医療対策の開発に貢献する偽ウイルスシステムを確立したことを報告しています。

Dempsey, R., Goldswain, H., Newman, J., Thakur, N., MacGill, T., Myers, T., Orr, R., Bailey, D., Stuart, J. P., Aljabr, W., Hiscox, J. A.2026-02-17🦠 microbiology

Aurora vent field is a hotspot for microbial hydrogen oxidation in the Arctic Ocean

本研究は、北極海のオーロラ噴気孔におけるメタゲノム解析を通じて、水素酸化能が専ら専性水素酸化菌に限られず、多様で代謝的に柔軟な微生物群(Zetaproteobacteria や Aquificota など)に広く存在し、深海化学合成生態系のエネルギー流と炭素循環に重要な役割を果たしていることを初めて明らかにしました。

Olesin Denny, E., Hribovsek, P., Pereira, S. I., Argentino, C., Panieri, G., Mall, A., Vulcano, F., Stokke, R., Reeves, E. P., Steen, I. H., Dahle, H.2026-02-17🦠 microbiology

In vitro exposure to non-antipseudomonal antibiotics (NAPA) induces Pseudomonas aeruginosa resistance to antipseudomonal antibiotics (APA)

本論文は、抗緑膿菌活性を持たない抗生物質への低濃度曝露が、緑膿菌において抗緑膿菌薬への耐性を誘発し、そのメカニズムが排出ポンプやβ-ラクタマーゼ発現を制御する調節遺伝子の変異による収束進化であることを示している。

Lasry, D., Harrison, L. B., Bamba, R., Corsini, R., Yansouni, C. P., Cheng, M., Lee, T. C., Lawandi, A. L.2026-02-16🦠 microbiology

Phenotypic diversity of yeasts curated in the 5th edition of The Yeasts: A data-driven visualization approach

本論文は、『The Yeasts(第 5 版)』に記録された約 1,300 種の酵母の表現型データを統合・可視化し、従来のモデル生物中心の枠組みを超えて、酵母が代謝的多様性と生態的適応に富む群であることを再評価するデータ駆動型の分析アプローチを提示しています。

Seike, T., Ide, M., Yamamoto, M., Yurimoto, H., Shiraishi, K.2026-02-16🦠 microbiology

Environmental filtering drives cryptic diversity and shifting interaction networks across lake, ephemeral pond, and desiccated microbial mat communities in the Untersee Oasis, East Antarctica

この研究は、南極のウンターゼーオアシスにおける湖、一時的水池、乾燥した微生物マットの環境において、細菌と真核生物が分散パターンや相互作用ネットワーク(乾燥ストレス下で促進から競争へ転換)において根本的に異なる生態戦略を採り、環境フィルターが隠れた多様性と生態系の回復力を形作っていることを明らかにした。

Vimercati, L., Chakrabarti, I., Lindley, A., Greco, C., Andersen, D. T., Jungblut, A. D.2026-02-16🦠 microbiology