🦠 微生物学
BertMS-enabled molecular networking for unknown compounds dereplication
本論文は、大規模な MS/MS データからフラグメントイオンの文脈表現を学習するトランスフォーマーベースのフレームワーク「BertMS」を提案し、既存手法よりも優れたスペクトル類似度評価を実現することで、代謝物網の構築や未知化合物の同定を高度化することを示しています。
🦠 Category
microbiology
729 件の論文
微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。
Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。
以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。
🦠 微生物学
HAC1 contributes to stress adaptation and virulence in the emerging fungal pathogen Candida auris
本論文は、Candida auris における小胞体ストレス応答調節因子 HAC1 が、非定型スプライシングを介してストレス適応性を獲得し、宿主環境での生存と病原性に不可欠な役割を果たしていることを明らかにしたものである。
🦠 微生物学
Carbon and nitrogen availability affect biofilm growth and morphology of the extremotolerant fungus Knufia petricola
極限環境に生息する真菌 Knufia petricola は、栄養制限下でバイオマス形成を抑制しつつ基盤への浸透を促進する探索的成長へシフトし、炭素と窒素の利用可能性がその成長や形態を決定づけることが示されました。
🦠 微生物学
Cost and benefits of gene amplification-mediated antibiotic resistance
この論文は、Enterobacter cloacae における遺伝子増幅（GDA）が抗生物質濃度や曝露時間に応じて耐性レベルと生理的コストのトレードオフを形成し、特に高濃度環境では逆説的に殺菌感受性を高めるという、文脈依存的な適応メカニズムを明らかにしたものである。
🦠 微生物学
Biodegradation of components from an oxidized polyethylene by a Rhodococcus strain isolated from the gut of Atlantic Salmon
大西洋サーモンの腸から単離された Rhodococcus 株 ASF-10 が、酸化ポリエチレンの低分子量モデル基質を分解する能力を持ち、そのメカニズムにモノオキシゲナーゼやバイオフィルム形成タンパク質などが関与していることが示されました。
🦠 微生物学
Efficient plasmid-based rescue of T7 RNA polymerase-driven calicivirus reverse genetics systems in mammalian cells using vaccinia virus RNA capping enzymes
本研究は、ワクシニアウイルスのRNA キャッピング酵素（D1R および D12L）と T7 RNA ポリメラーゼを発現するプラスミドを併用することで、マウスノロウイルスの逆遺伝学システムにおけるウイルス titres を大幅に向上させ、高スループットな変異体評価を可能にする新規手法を確立したものである。
🦠 微生物学
High specificity meets genomic flexibility in the Siphamia-Photobacterium symbiosis
本論文は、熱帯から温帯にかけてのシフナギ属魚類が特定の発光細菌（Photobacterium mandapamensis）と厳密な共生関係を維持しつつ、その共生細菌が宿主特異的な系統分化や可動遺伝子要素の拡大など、ゲノムおよび表現型の高い柔軟性を示していることを明らかにした。
🦠 微生物学
MATRIX: Rapid Quantification of Total and Active Microbial Cells with Single Cell Phenotypes for Environmental Microbiomes
この論文は、環境微生物群集における総細胞数と活性細胞数を迅速かつ定量的に評価し、単一細胞レベルの表現型データを提供する新規ワークフロー「MATRIX」を開発し、その再現性と汎用性を培養菌および土壌群集を用いて実証したことを報告しています。
🦠 微生物学
Infauna selectively enhance DNA virus diversity and activity in marine sediments
この研究は、海底堆積物に生息する底生動物（Infauna）が、宿主の存在量だけでは説明できない細菌活性を介して DNA ウイルスの多様性と活性を特異的に増大させることを明らかにし、底生生態系におけるウイルス動態の新たな調節因子を確立しました。
🦠 微生物学
Validation of shoe sole dust as a microbial sampler reveals distinct fungal and bacterial responses to nearby vegetation
本論文は、靴底の塵を微生物サンプリングに用いる手法の有効性を検証し、細菌と真菌が緑化の空間スケールに対して異なる反応を示すことを明らかにした。