584 件の論文
微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。
Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。
以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。
2,940個の緑膿菌（*Pseudomonas aeruginosa*）ゲノムからなるグローバルなデータセットを解析することにより、本研究は、細菌の防御システムがアクセサリーゲノム間の相互作用の主要な原動力であり、細菌ゲノムの進化と可塑性を著しく形成する、明確な生態学的分布および複雑な共生または競争関係を呈していることを明らかにしている。
本研究は、紅海の海綿動物において、宿主の濾過生理（HMA対LMA表現型）によって駆動される生態学的フィルタリングが、宿主と微生物の共多様化よりもマイクロバイオームのアセンブリルギーを予測する強力な要因であることを示しており、スポンジ・ホロバイオントを厳密に共進化した単位とみなす見解に異を唱えるものである。
本研究は、インフルエンザDウイルスが自然免疫の感知を回避することでヒト気道組織内で効率的に複製できることを実証しており、これは強化された監視とさらなる調査を必要とする、重大かつ過小評価されている人獣共通感染症としての潜在的可能性を示唆している。
本研究は、最適化されたBID-seq法を用いて5種の細菌におけるシュードウリジン修飾の初のトランスクリプトームワイドな定量的マッピングを提示し、成長相依存的なダイナミクス、進化的な保存性、およびRNAの安定性と翻訳への機能的影響を明らかにするとともに、修飾部位を予測するためのディープラーニングフレームワーク（pseU_NN）を確立するものである。
Orion Microbiome Databaseは、標準化された再現可能なプラットフォームを提供することで、公開されているマイクロバイオームデータの断片化と不整合に対処し、全ゲノムショットガンデータセットを精査されたメタデータおよびインタラクティブなツールと統合することで、研究と教育を加速させます。
バングラデシュ北東部におけるこの横断的研究は、伴侶動物である犬や猫、特に野良動物において、人獣共通感染症である消化管寄生虫の有病率が高い（45.9%）ことを明らかにしており、ヒトへの感染リスクを軽減するためのワンヘルスに基づいた監視体制の強化および駆虫戦略の拡充という緊急の必要性を強調している。
本研究は、*Yersinia pseudotuberculosis*が分泌されるCNFファミリー毒素を利用して宿主のCdc42-PLC1-IP3シグナル伝達カスケードおよびSNARE介在性エキソサイトーシス機構を乗っ取り、腸管上皮細胞からの稀な非溶解的な脱出を可能にすることで、バリアの完全性を維持しつつ全身への細菌拡散を促進することを明らかにしている。
本研究は、再構成された歴史的な治療薬である「Bald's eyesalve」が、膜の破壊、毒性の抑制、および遺伝子の発現低下を伴う多角的なメカニズムを通じて、グラム陽性菌およびグラム陰性菌の両方に抗するものであり、それによって単一分子の抗生物質と比較して薬剤耐性の進化を著しく遅延させることを実証している。
本研究は、バチルス・サブティリス（*Bacillus subtilis*）の胞子被膜ハブタンパク質であるSafAFLおよびC30が、まずその固有の天然変性領域がジスルフィド結合によって自己集合し、それが足場を形成した後に、トランスグルタミナーゼTglによる架橋と固定化を受けるという、階層的かつ二相性の集合プロセスを経ることを明らかにしている。
本研究は、多様な植物プランクトン株からのデータを統合することで、混合栄養が分類群や生息地を問わず遍在的な栄養戦略であることを実証するが、その具体的な発現様式は概して予測困難であり、生物の起源や局所的な溶存有機物への適応能に影響されている可能性がある。