Bacterial Stress Responses Lower mRNA-Protein Level Correlations
本研究は、サルモネラ、yersinia、黄色ブドウ球菌の 3 種の人病原菌を対象に、10 種類の感染関連ストレス条件下でトランスクリプトームとプロテオームデータを統合解析し、ストレス応答が mRNA とタンパク質レベルの相関を低下させ、特に必須遺伝子や翻訳調節を介した適応メカニズムが病原菌の生存に重要であることを明らかにしました。
734 件の論文
微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。
Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。
以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。
本研究は、サルモネラ、yersinia、黄色ブドウ球菌の 3 種の人病原菌を対象に、10 種類の感染関連ストレス条件下でトランスクリプトームとプロテオームデータを統合解析し、ストレス応答が mRNA とタンパク質レベルの相関を低下させ、特に必須遺伝子や翻訳調節を介した適応メカニズムが病原菌の生存に重要であることを明らかにしました。
本論文は、バイオインフォマティクスと機械学習を統合したパイプラインを用いて、大腸癌や口腔癌との関連が指摘されている Fusobacterium nucleatum の病原性島を同定し、溶血素を介した鉄獲得メカニズムが酸化ストレスや Hippo 経路を介して癌を促進するという仮説を提唱したものである。
本研究は、Pseudomonas aeruginosa の高解像度時間経過データを用いて、従来の感受性指標が見過ごしている過渡的動態と接種量依存効果を定量化する新しい計算パイプラインを開発し、集団動態を記述する微分方程式モデルの特定と、異なる動態領域を分類する新規指標の提案を実現した。
この論文は、自然発生的な欠損 HIV ゲノムに関する最近の観察研究が治療的干渉粒子(TIPs)の有効性を否定する根拠として不適切であり、報告された基本再生産数(R0)の測定値に内部矛盾があるほか、既存のメカニズムでも同様の現象を説明可能であることを示しています。
GM-CSF による分化はマクロファージのチクングニアウイルス感染を許容するのに対し、M-CSF による分化は dsRNA 感知を介した抗ウイルス応答を誘導して感染を抑制し、マクロファージの分化様式がウイルス感受性と免疫応答の決定要因となることを示しました。
本論文は、酵母細胞の蛍光シグナルに基づく単一細胞スクリーニングを可能にする安価でアクセスしやすい液滴細胞計測・分選プラットフォーム「DropletFactory CORE」を開発し、バイオテクノロジー分野における高スループットスクリーニングの民主化を推進したことを報告しています。
インドのハイデラバードを流れるムシ川における抗菌剤耐性(AMR)の主要な駆動要因は、製薬廃棄物ではなく、未処理の生活排水であることが、現場調査と水理モデルを用いた研究で明らかになった。
本研究は、NlpC/P60 ペプチドグリカン加水分解酵素 SagA の遺伝的および薬理学的阻害が、ペプチドグリカンのリモデリングを妨げ、バンコマイシン耐性腸球菌(VREfm)に対するバンコマイシンの感受性を高めることを示し、この酵素が VREfm 治療の新たな創薬ターゲットとなり得ることを明らかにしました。
本論文は、全球の土壌サンプルを用いた大規模解析により、レジオネラ属(特に病原性種)の分布と多様性が降水量や気温などの気候勾配および地理的分散によって強く規定されており、将来の気候変動に伴い土壌が重要な感染源となり得ることを示唆しています。
本論文は、電気刺激に対する細菌の蛍光応答を Exeter Multiscope の 2x2 並列アレイで検出する手法を提案し、2 時間の培養後に 1 分未満で抗菌薬の有効性を迅速かつスケーラブルに判定可能であることを実証したものである。