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Establishing Lethal and Growth Reduction Doses of Fast Neutron Irradiated Cowpea [Vigna Unguiculata (L.) Walp.]

本研究は、2種類のサンプア(SAMPEA)品種に対する高速中性子照射の半数致死量(LD₅₀)および成長抑制量(GR₅₀)を決定し、SAMPEA 21がSAMPEA 20Tよりも放射線感受性が高いことを明らかにし、突然変異育種プロトコルを最適化するための不可欠な遺伝子型特異的ベンチマークを提供した。

Ibrahim Ashiru, Umar U. Uwais, Ibrahim Halima, Almustapha Zakari, Abdullahi A. Dabo, Aminu Isyaku2026-07-24
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Do Single-Cell Models Learn Real Biology? An Empirical Analysis of Physical Interaction Signal in Pretrained scGPT Gene Embeddings

この実証的研究は、scGPTモデルの事前学習済み遺伝子トークン埋め込みが、複数のデータベースにおける非相互作用の対照群と比較して、相互作用する遺伝子ペア間のコサイン類似性が有意に高いことによって示されるように、物理的なタンパク質間相互作用構造を本質的にエンコードしていることを実証している。

Liu Chen2026-07-24
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Mechanistic Interpretability of Biological Foundation Models: An Empirical Analysis of scGPT Gene-Embedding Geometry

本論文は、scGPT基盤モデルの静的な遺伝子トークン埋め込み空間が、相互作用する遺伝子ペアが非相互作用の対照群と比較して有意に高いコサイン類似度および相互作用予測指標を示すことによって証明されるように、既知の物理的なタンパク質間相互作用に関する検出可能ではあるものの中程度の情報をエンコードしていることを経験的に示している。

Liu Chen2026-07-24
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What Knowledge Can Be Extracted from Single-Cell Data? An Empirical Analysis of Donor-Robust Cell-Type Annotation

ヒト膵臓の単一細胞RNAシーケンシングデータの経験的解析は、豊富に存在する標準的な細胞型については、細胞型アノテーションモデルが、ランダム分割と比較して性能の低下がわずかである「ドナーを一つ除いた評価(leave-one-donor-out)」においてもドナー間で堅牢に汎化することを示しており、これは、単一細胞データから抽出された知見を主張する際に、対象となる集団および技術的範囲を明示することの必要性を強調している。

Liu Chen2026-07-24
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When Do Single-Cell Foundation Models Beat PCA? A Simulation-Based Empirical Analysis of Label Scarcity and Perturbation Generalization

このシミュレーションに基づく研究は、シングルセル基盤モデルが、ラベルが乏しいアノテーションタスク(クラスあたり1〜5個のラベル付き細胞)において古典的なPCAパイプラインを大幅に上回る一方で、十分なラベルが利用可能な場合や新規の摂動に対する応答を予測する場合には、単純な線形ベースラインに対してほとんど、あるいは全く優位性を持たないことを示している。

Liu Chen2026-07-24
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Rank or Value? An Empirical Analysis of Single-Cell Transformer Tokenization under Sequencing-Depth Loss

この実証的研究は、シングルセルRNAシーケンシングにおいて、シーケンシング深度の損失下での細胞分類において、固定発現値ビニングがコーパス中央値ランクエンコーディングよりも優れていることを示しており、ライブラリサイズの乗法に対する不変性が、確率的な分子消失に対する堅牢性を保証するものではないことを明らかにしている。

Liu Chen2026-07-24
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Does Candidate-Space Restriction Destabilize Cross-Tissue Gene Regulatory Network Benchmark Rankings? An Empirical Analysis of Analytic Flexibility in Computational Biology

この実証的分析は、遺伝子制御ネットワークのベンチマークにおいて候補空間を制限することが、組織間における手法のランキングを著しく不安定化させることを示しており、これは候補の定義の選択が比較上の結論を変え得るものであり、結果に付随して報告されるべきであって中立的なものとして扱うべきではないことを示唆している。

Liu Chen2026-07-24
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Bacteria getting wired: The porin-cytochrome complex Om(abc)B kickstarts extracellular electron transfer and nanowire formation

この研究は、*Geobacter sulfurreducens*が、ポリン・シトクロム複合体であるOm(abc)Bがまずエネルギー集約的なOmcSナノワイヤーの合成を可能にし、それによって細胞がワイヤレスモードからワイヤードモードへと切り替わることで複製のためのFe(III)へのアクセスを劇的に拡大させるという、連続的な二段階の細胞外電子伝達戦略を利用していることを明らかにしている。

Nikhil Malvankar, Joseph Erwin, Kejue Jia, Cong Shen, Vanessa Saldivar, Aldo Salazar Morales, Vasilije Pentalic, Fadel S (…)2026-07-24
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Efficiency of timber harvesting with a harvester in fir stands with designated and undesignated thinning

この研究によれば、非指定間伐を伴うモミ林の収穫は、機械の移動や伐採計画の延長により、指定間伐を行う場合よりも約12%長い時間を要するものの、オペレーターの精神的負荷および集中力のレベルは両方のシナリオで同程度であることが判明した。

Grzegorz Szewczyk, Paweł Tylek, Rafał Dyjach, Damian Najman, Tomasz Repak2026-07-24
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WITHDRAWN: Milk Quality and Associated Safety Risk Factors along the Fresh Milk Value Chain in Pastoral Communities of Yabello Town, Borana Zone, Southern Ethiopia

エチオピアのヤベロ町における牧畜コミュニティの牛乳の品質および安全性に関するリスクを当初調査した本論文は、所属機関のプレプリントに関する規定を遵守するために著者によって取り下げられたため、引用してはなりません。

Hailu Lemma, Tadicha Bute, Lechisa Asefa, Israel Melaku, Assefa Asnakew, Girma Berhanu, Degefa Dhengesu, Habtamu Roba2026-07-24