🧬 biology

Integrative GC–MS Metabolite Profiling and Structure-Based Molecular Docking for Identification of Antibacterial Leads from Calotropis gigantea and Nyctanthes arbor-tristis

本研究は、GC-MSプロファイリング、in vitroアッセイ、ADMET予測、および分子ドッキングを通じて、α-トコフェロール-β-D-マンノシドを有望なリード候補として浮き彫りにし、多剤耐性病原体に対する抗菌性フィトケミカルの優れた供給源として*Nyctanthes arbor-tristis*を特定した。

Suparna C Chakraborty, Rohini Kulkarni2026-09-01
🧬 biology

50µm ex vivo MRI reveals distant layer-specific hippocampal atrophy in early Alzheimer's disease

50µmの超高解像度ex vivo MRIを用いた本研究は、初期アルツハイマー病(BraakステージII)が、局所的なタウ負荷ではなく、上流の嗅内皮質におけるタウ病理によって強く駆動される、前方のCA1およびサブクリカム領域における遠隔かつ層特異的な萎縮を特徴とすることを明らかにしている。

Yasmine Salman, Sandra O. Tomé, Nicolas Joudiou, Amanda Annettesdotter, Pulkit Khandelwal, Tevi M. Lawson, Catherine Beh (…)2026-09-01
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Deciphering the Multi-Target Anti-Diabetic Mechanisms of Chrysin Using Integrated Network Pharmacology, Molecular Docking, and Molecular Dynamics Simulations

本研究は、ネットワーク薬理学、分子ドッキング、および分子動力学を統合したアプローチを用いることで、クリシンがGSK3βのような主要なタンパク質を標的とすると同時に、PI3K/AktおよびNF-κBといった重要な経路を調節することにより、糖代謝、炎症、および酸化ストレスを制御することで抗糖尿病効果を発揮することを解明するものである。

Ghanshyam Mapare, Sateesh Belemkar2026-09-01
🧬 biology

A permutation-null artifact drives a conservation–divergence spectrum's signature trend, and phylogeny dominates a protein language model's per-position coupling signal

本論文は、保存性ー分岐スペクトルにおける顕著な負の傾向が、その置換帰無モデルによるアーティファクトであることを示し、タンパク質言語モデルの各ポジションにおける結合信号が機能的メカニズムではなく主に系統発生によって駆動されていることを実証しており、ブラックボックスモデルを独立した進化学的証拠に対して精査するための厳密な枠組みを確立するものである。

Huazhang Shen2026-09-01
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An Auditable Complexity Ladder for Mechanism-Level Experiments in Artificial Life

本論文は、事前の凍結基準、失敗の保持、バイトセーフな乱数生成器(RNG)の隔離、および明示的なエビデンス・グレーディングを通じて厳格かつ再現可能な主張を保証する、人工生命メカニズム実験のための監査可能な11段階の複雑性ラダー・プロトコルを導入し、これを手法的な限界と過去の分析エラーを透明に開示した最小細胞モデルを通じて実証するものである。

Huazhang Shen2026-09-01
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Basal expression predicts context-specific drug responses only where they are reproducible: a leakage-safe 47-line LOCO benchmark on Tahoe-100M

この事前登録されたリーケージ防止ベンチマークは、基礎的なトランスクリプトーム発現がコンテキスト特異的な薬物応答を予測する能力は、標的信号の再現性の低さによって根本的に制限されており、残差応答が十分に信頼できる少数の薬物のサブセットにおいてのみ意味のある予測が現れることを示している。

Huazhang Shen2026-09-01
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HADIA-KB: Evidence-Preserving Digital Knowledge Infrastructure for Jharkhand’s Traditional Rice Beer

HADIA-KBは、ジャールカンド州の伝統的な米醸造酒に関する断片的な科学的・文化的データを、単一の物語へと集約するのではなく、ドキュメンテーションの欠落や地域的な差異を明示的に浮き彫りにしながら、再現可能で出典が証明されたグラフへと集約・マッピングする、エビデンス保存型のデジタル知識インフラストラクチャである。

Mohammad Amir Khusru Amir2026-09-01✓ Author reviewed
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GRP: A Representation-Aware Effective Geometry of Protein State Space

本論文は、タンパク質の状態空間を座標認識型の幾何学的多様体としてモデル化することで、AIの表現と生物学的制約を結びつける安定した不変量を特定する、一般相対性理論に着想を得たフレームワークであるGRPを導入し、少数の支配的なモードがコンフォメーションの分散の大部分を捉えること、および構造化された生物学的経路がヌルモデルと比較して明確に異なる輸送特性を示すことを実証する。

Chuanyang Liu2026-09-01