🧬 biology

Genetic diversity, phylogeny, and population structure of Leishmania isolates from cutaneous leishmaniasis patients in Ethiopia

本研究は、エチオピアにおける皮膚リーシュマニア症が、最近の人口動態的拡大の兆候を示す遺伝的多様性に富んだ*Leishmania aethiopica*を主体とし、さらに*L. donovani*複合体および*L. tropica*の分離株が相当数の少数派として存在する、複雑で多種的な病因によって引き起こされていることを明らかにしており、臨床管理を導くための分子学的サーベイランスの強化の必要性を強調している。

Girma Shumie, Jose Carlos Solana, Nigatu Negash, Arantxa Marco, Eshetu Molla, Galana Mamo Ayana, Adisu Asefa, Amanuel Al (…)2026-08-31
🧬 biology

Splicing-derived dual-class MHC neoantigens as candidate biomarkers in melanoma anti-PD-1 response: a pre-registered three-cohort analysis

この事前登録された3コホート解析は、MHCクラスIおよびII分子の両方に結合可能なスプライシング由来ネオアンチゲンが、抗PD-1療法を受けたメラノーマ患者における生存転帰を予測する、TMBとは直交する独立したバイオマーカー軸を構成していることを示しており、前向きな検証を要するものである。

Zulkarnain Sajid2026-08-31
🧬 biology

Global genomic analysis reveals structured redundancy and complementarity in ex situ barley conservation

14の遺伝資源保存施設にわたる36,000件以上のオオムギアクセッションのゲノムデータを統合することにより、本研究は、世界の域外保存が、広範かつ構造化された冗長性と施設間の低い分化性を特徴とする相互連結したシステムを形成していることを明らかにしており、これは類似した遺伝子型をさらに追加的にサンプリングすることによる収穫逓減を示唆している。

Martin Mascher, Max Haupt, Paulina Bolc, Matilda Ciucă, Daniel Cristina, Gouripriya Davuluri, Anne Fiebig, Mika Hamaoka (…)2026-08-31
🧬 biology

Downregulation of Acetyl-CoA Synthetase gene Triggers an Energy Crisis in Monascus fuliginosus M1: Impaired Hyphal Growth Coupled with Adaptive Sporulation Surge via Oxidative Phosphorylation Suppression

*Monascus fuliginosus*におけるアセチルCoA合成酵素(ACS)遺伝子のダウンレギュレーションは、酸化リン酸化を抑制することでエネルギー危機を引き起こし、それが菌糸の成長を阻害すると同時に、適応的な生存戦略として胞子形成を促進する。

Lin Lin, Na Zhang, Yuxuan Tian, Lingyu Zhao, Jie Bai2026-08-31
🧬 biology

A Hybrid Computer Vision and AI Framework for Wildlife Hospital Patient Identification Systems: Kangaroo Facial Recognition as a Case Study

本研究は、野生動物病院における東部グレーカンガルーの識別を自動化するために、コンピュータビジョンと深層距離学習を統合したAI駆動型フレームワークを提案・評価し、現行の手動識別法の限界を克服するスケーラブルで非侵襲的なソリューションを提供するものである。

Xin Yiing Loo, Xiaodan Dong, Steve Garlick2026-08-31
🧬 biology

PRRI: Plasmid Resistance Risk Index Prioritizing Clinically Relevant Plasmid-Associated Antimicrobial Resistant Genes in the Human Gut

本研究は、ヒトの腸内マイクロバイオームにおける臨床的に重要なプラスミド関連抗生物質耐性遺伝子を、その深刻度と希少性に基づいてスコア化することで優先順位付けを行う枠組みである「プラスミド耐性リスク指数(PRRI)」を導入しており、少数の高インパクトかつ希少な遺伝子が、全体の存在量は低いものの重大な伝播リスクをもたらしていることを明らかにしている。

Ankish Arya, Sankalp Patil, Prabhat Tripathi, Nidhi Dubey, Pritish Kumar Varadwaj2026-08-31
🧬 biology

Phenotypic and Molecular Characterization of a Novel blaKPC-202 Variant, Capable of Reverting to blaKPC-2 In Vitro in a Clinical Klebsiella pneumoniae Isolate

本研究は、セフタジジム–アビバクタム耐性とメロペネムのヘテロ耐性を付与する、*bla*KPC-20型の変異を保有する新規の*Klebsiella pneumoniae*分離株を特徴づけており、この変異は*in vitro*において*bla*KPC-2型へと自発的に逆転し得る特異な30塩基のタンデム挿入を伴うものであり、KPC酵素の進化的な可塑性と監視強化の必要性を強調している。

Qing Chen, Kang Xu, Linlin Xu, Lianyan Xie, Shuzhen Xiao, Jingyong Sun2026-08-31
🧬 biology

Do Pathology Foundation Models Learn Biology? Uncertainty-Based Evaluation on AML Cytomorphology

本研究は、汎用的なビジョンモデルが標準的なクラスタリング指標において病理特化型の基盤モデルを凌駕する場合がある一方で、後者の生物学的に意味のある構造を捉える能力は、急性骨髄性白血病における細胞成熟状態を区別する安定した不確実性のパターンを通じてより明確に示されることを実証している。

Aadil Bhat, Sajad Kawa, Mohammad Munzir2026-08-31
🧬 biology

Chromosome-scale genome assembly and population genomic analysis of Phomopsis asparagi pathogen reveal genetic diversity among geographical populations

本研究は、アスパラガス病原菌である*Phomopsis asparagi*の高精度な染色体スケールゲノムアセンブリと中国分離株の包括的な集団ゲノム解析を提示し、顕著な遺伝的多様性を明らかにし、将来の病害管理戦略を支援するための表現型変異に関連する候補遺伝子を特定した。

Yu Shi, Chun-Xia Yang, Hao-Han Ning, Yi-Ran Wang, Yuan Wang, Guo-Bing Cui, Wu-Jun Gao, Shu-Fen Li2026-08-31
🧬 biology

White Noise and Postural Control in Healthy Adults: Differential Effects in Virtual and Non- Virtual Environments

この研究は、定常的なホワイトノイズが健康な成人における姿勢制御に与える全体的な影響は最小限である一方で、その個別の効果は非VR環境とVR環境の間で大きく異なり、非VR設定では安定化、VR設定では不安定化へと向かう傾向があることを明らかにしている。

Jule Kuechler, Neha Mehta, Elizabeth Coker, Marilyn Moffat, Anat V. Lubetzky2026-08-31