🧬 biology
Biodiversity-forest structural diversity relationships differ among taxa
米国およびプエルトリコの航空レーザー（LiDAR）と現地調査データを用いた本研究は、森林の構造的多様性が鳥類、哺乳類、および甲虫類の分類学的多様性の重要な要因である一方で、植物において観察される弱い関連性とは異なり、これらの関係性は分類群ごとに特異的であり、その強さと方向性が異なることを明らかにしている。
🧬 Category
q-bio
1754 件の論文
🧬 biology
Codon Usage Bias Shapes CpG Architecture in Millet Coding Sequences
6種のキビおよび関連するC₄型イネ科植物を用いたこのゲノムワイドな解析は、同義置換によるコドン使用バイアスがコーディング配列におけるCpGジヌクレオチドの構造を能動的に形成していることを明らかにしており、これはコドンの選択と配置が遺伝子本体のメチル化のための構造的基質をあらかじめ構成していることを示唆するとともに、コドンバイアスの機能的役割を翻訳効率を超えてエピジェネティックな次元にまで拡張するものである。
🧬 biology
Shared genetic mechanisms link type 2 diabetes to CMR-derived cardiac remodeling
この研究は、2型糖尿病と心臓磁気共鳴画像法（CMR）から得られる心臓リモデリングが重要な遺伝的構造を共有していることを明らかにし、156の共通する遺伝子座を特定するとともに、糖尿病に関連する心臓の構造変化を駆動する可能性のある6つの核心的な免疫調節遺伝子を含む18個の候補遺伝子を優先順位付けした。
🧬 biology
Dysbiotic shifts in intestinal Streptococcus, Veillonella, and butyrate-producing bacteria are associated with disease severity in hepatitis E
本研究は、ショットガンメタゲノムプロファイリングを利用して、StreptococcusおよびVeillonella関連種（sCAG5およびsCAG4）と酪酸産生菌（sCAG10）の比率の上昇を特徴とするディスバイオーシスへのシフトが、E型肝炎の重症度を示す新たな腸内微生物指標となることを実証している。
🧬 biology
Mining and Analysis of Key Genes in the Biosynthetic Pathway of Kinsenoside in Anoectochilus roxburghii
本研究は、最適なジャスモン酸メチル誘導条件を特定し、RNA-seqとWGCNAを組み合わせて用いることで、二倍体および四倍体のキサントフィル配糖体であるキンセノシドの生合成に関与する、有意に発現上昇しているUGT88F3および他の15個の候補遺伝体を含む主要な遺伝子を特定した。
🧬 biology
Low GROa/CXCL1 expression predicts poor outcome and promotes tumour progression in vivo and in vitro, revealing a context-dependent tumour-suppressive role in triple-negative breast cancer
本研究は、低発現のGROα/CXCL1がトリプルネガティブ乳がんにおける生存率の低下を予測し、腫瘍の進行を促進することを実証しており、予後バイオマーカーおよび治療標的としてさらなる調査に値する、文脈依存的な腫瘍抑制的役割を明らかにしている。
🧬 biology
Assembly and characterization of the mitochondrial genome of Camellia pitardii Coh.-St
本研究は、Camellia pitardiiのミトコンドリアゲノムに関する初の包括的なアセンブリと特性評価を提示し、その構造的特徴、遺伝子内容、および進化動態を明らかにするとともに、ミトコンドリアと葉緑体の系統樹におけるトポロジー的な不一致を浮き彫りにすることで、Camellia属における将来の比較ゲノミクスおよび生殖質利用のための基礎的なリソースを提供するものである。
🧬 biology
Genome-wide identification, structural characterization and gene expression analysis of CYP450 family under different light-conditions in Coptis chinensis
本研究は、オウバク（*Coptis chinensis*）における283個のCYP450遺伝子を包括的に同定および特性評価し、それらの染色体上の不均一な分布、組織特異的な発現、および低光量および長日条件下での有意な発現上昇を明らかにしており、これは光応答性およびMeJAエレメントを介したアルカロイド蓄積における調節的役割を示唆している。
🧬 biology
Brain-region-aware genetic prioritization separates Alzheimer disease risk from APOE-sensitive β-amyloid burden in public genetic and expression quantitative trait locus resources
公開されている遺伝学および発現リソースを統合することにより、本研究はアルツハイマー病のリスクとβアミロイド負荷が異なる生物学的プロセスであることを示し、BIN1を広範なリスクのアンカーとして特定すると同時に、これまで関与が示唆されてきたZNF227のシグナルが、独立したアミロイド病理ではなく主にAPOE領域の変異によって駆動されていることを明らかにしている。
🧬 biology
Identification of Maize Fusarium Ear Rot Resistance Genes via Integrated BSA-Seq and RNA-Seq Analysis
本研究は、BSA-Seq、RNA-Seq、およびWGCNA解析を統合することで、トウモロコシの*Fusarium graminearum*に対する抵抗性の分子メカニズムを解明し、抵抗性系統K0743と感受性系統K0742を区別する、酸化ストレス、ホルモンシグナル伝達、および細胞壁修飾に関与する8つの抵抗性関連遺伝子座と6つの高信頼性候補遺伝子を特定した。