🧬 biology

An Acinetobacter baumannii acyltransferase represses pilin production to maintain energy homeostasis and overcome nutritional immunity

本研究は、アセトバクター・バウマニ(*Acinetobacter baumannii*)のアシル転移酵素であるAimSが、調節因子CsuRを介してピリ形成およびバイオフィルム形成を抑制することにより、宿主の栄養免疫を克服する極めて重要な因子であり、それによって細胞内のATPを節約してエネルギー恒常性を維持し、呼吸器感染時における細菌の適応度を確保していることを明らかにしている。

Eric Skaar, Dillon Kunkle, Owen Burroughs, Christopher Corcoran2026-06-30
🧬 biology

A Network-Control Approach to Seizure Intervention via Adjoint Optimal Control

本論文は、60の脳領域をホップ振動子とするネットワークベースのモデルを利用し、予測検知器と2段階の制御戦略(線形二次レギュレータおよび随伴最適制御)を組み合わせることで、シミュレーションにおいて100%の割合でてんかん様分岐を事前に阻止することに成功した、クローズドループ型脳深部刺激システムを提案するものである。

Aadi Deosthaler, Samarth Muralidhara, Yashas Anil2026-06-30
🧬 biology

Aging reprograms the functional, epigenetic, and metabolic landscape of macrophages

この研究は、加齢が単なる機能低下を引き起こすのではなく、エピジェネティクス、代謝、および機能の協調的な変化(サイトカイン応答性の低下、脂質代謝の変化、および表現型特異的な変化を特徴とする)を通じてマクロファージを能動的に再プログラミングすることを明らかにしており、それによって炎症性老化(inflammaging)および加齢に伴う疾患を理解するための新たな枠組みを提示している。

Manasa Suresh, Francisco Tapia Belmonte, Bryan T. Weselman, Xintang Li, Marie Durr, Isabella Duchovny, Yanitza Gutierrez (…)2026-06-30
🧬 biology

Multi-state modeling associates proliferation genes with early estrogen receptor-positive breast cancer recurrence and survival

本研究は、マルチステートモデルを用いることで、高リスクのエストロゲン受容体陽性乳がんにおいて、増殖関連遺伝子の高いベースライン発現が早期再発およびその後の死亡と有意に関連している一方で、晩期再発は異なるシグナル伝達経路に関連していることを示している。

Yongzhe Wang, Christine Quinones, Irene Kang, Hope Rugo, Ernest Martinez, Victoria Seewaldt, Joanne Mortimer, Aritro Nat (…)2026-06-30
🧬 biology

Single-Cell Foundation Models in Biotechnology: A Scoping Review and Bibliometric Analysis of Multimodal AI for Cell-State, Perturbation, and Biomarker Prediction

1,042件の研究を対象としたこのスコーピングレビューおよびビブリオメトリック分析は、シングルセル基盤モデルがバイオテクノロジー分野において急速に拡大している一方で、当該分野が再現性の不一致、ベンチマークの厳密性の欠如、およびオープンリソースの不足に苦しんでおり、単純なベースラインが複雑なアーキテクチャに対して競争力を示すこともしばしばあることを明らかにしている。

Behin Omidi, Mohammmad Mahdi Hemati Aalm, Arshia Farmahini Farahani, Amir Reza Hassan Poor Barkadehi2026-06-30
🧬 biology

Identification of Differentially Expressed Genes Related to UFMylation Modifications in Periodontitis: Integrated Insights from Transcriptomics and Clinical Experiments

本研究は、トランスクリプトーム解析、機械学習、および臨床的検証を統合することで、歯周炎における主要なUFMylation関連診断バイオマーカーとしてC4A、GANAB、およびTUBA4Aを特定し、免疫および代謝経路におけるそれらの役割を解明し、潜在的な治療標的を提案するものである。

Changqing Mu, Juan Liu, Kaining Liu, Xiaofeng Huang2026-06-30
🧬 biology

Timing of menstrual cups to prevent transition from optimal to not optimal vaginal microbiome community state type: Results from a 6.5-year prospective observational cohort

ケニアの中等学校の女子生徒を対象とした6.5年間の前向きコホート研究において、メンストルカップの使用は、最適な*L. crispatus*優位の腟微生物叢から非最適な状態へと移行するリスクを有意に減少させており、これは性交渉を開始する前にカップを提供することが腟の健康を維持するために極めて重要であることを示唆している。

Supriya Mehta2026-06-30
🧬 biology

Ethnicity-Stratified Inflammatory Phenotyping Using GMM Clustering and XGBoost Regression: A Cross-Ethnicity Nearest-Neighbour Framework for Precision CRP Estimation in NHANES 2017–2023

本研究は、NHANES 2017–2023のデータに基づき、GMMクラスタリングとXGBoost回帰を組み合わせた2段階の機械学習フレームワークを活用することで、主要栄養素に起因するCRP反応が代謝表現型および民族によって有意に異なることを明らかにし、非ヒスパニック系黒人集団における「食物繊維レジリエンスのパラドックス」を浮き彫りにするとともに、層別化された精密栄養学のアプローチを提唱している。

Anshul Iyer, Vania Sharma2026-06-30
🧬 biology

EEG Signal Variance as a Biomarker for Ictal State Classification: Subject-Level Validation of a Random Forest Classifier using the University of Bonn Dataset

本研究は、EEG信号の分散が発作状態を判別するための堅牢なバイオマーカーであることを実証し、データ漏洩を防ぐための厳格な被験者レベルのデータ分割を用いてボン大学のデータセットで学習させたランダムフォレスト分類器が、てんかん発作検出において高い精度(96.2%)および感度(98.3%)を達成することを検証している。

Md. Ahasanul Al Hasib Ayon2026-06-30
🧬 biology

Differential Signaling in Adaptive Immunity: Deciphering the Mechanism to Identify the Physical and Evolutionary Bases of Non‑Self

本論文は、適応免疫受容体がアミノ酸解像度での物理的な力場の急激な偏差を測定することによって自己と非自己を識別することを可能にする基本変数として、微分的な機械的変位を特定するメカノフィジカルな枠組みを提案し、それによって、免疫特異性における長年のパラドックスを解決する進行的な決定カスケードを通じて、液性および細胞性認識を統一するものである。

Yasir Arafat Maassoom2026-06-30