🧬 biology

Frequency-Stratified Benchmarking Reveals Strong Long-Tail Limitations of Large Language Models in Diagnosis of Monogenic Diseases

本論文は、大規模言語モデルが単一遺伝子疾患の診断において顕著な性能バイアスを示すことを実証するために、頻度層別化された5,000症例からなるベンチマークであるMendelianBench-5Kを導入するものであり、研究が進んでいる遺伝子については高い精度を達成する一方で、希少で最近特徴付けられた遺伝子については苦戦することを示している。

Jihao Cai, Jianle Yang, Maimaitiyibubaji Abudukadier, Aoxiang Luo, Lina Zhao, Guozhuang Li, Kexin Xu, Zhihong Wu, Terry (…)2026-06-29
🧬 biology

Multi-predictor pathogenicity filtering and membrane-specific stability analysis identify and characterize candidate destabilizing missense variants of the GIP receptor (GIPR)

本研究では、マルチ予測器による病原性フィルタリングと膜特異的な安定性解析を統合することにより、機能に影響を及ぼす可能性が高く、将来のファーマコジェネティクス研究の基礎となる、GIP受容体(GIPR)における14個の希少で構造的に不安定化させるミスセンス変異を特定し、その特性を明らかにしている。

Sabbir Ahmad Antor, Mahjabin, Nurnabi Azad Jewel2026-06-29
🧬 biology

Artificial Intelligence-Driven Insights into the Antioxidant and Anticancer Properties of Onion (Allium cepa) and Tomato (Solanum lycopersicum) in Prostate Cancer Prevention and Management: A Contemporary Review

この現代的なレビューは、前立腺がん予防におけるタマネギおよびトマトのフィトケミカルの抗酸化および抗腫瘍特性に関する証拠を統合し、分子ドッキングや機械学習といった人工知能主導のアプローチが、既存の臨床的な曖昧さにもかかわらず、バイオアクティブ化合物を系統的に優先順位付けし、その分子メカニズムを解明することによって、現在のトランスレーショナルな障壁をどのように克服できるかを強調している。

Alli Ayobami O.2026-06-29
🧬 biology

Curvana: an R package and Shiny Web app for analyzing AFM force curves

本論文では、原子間力顕微鏡(AFM)のフォース・ディスタンス曲線のエンドツーエンドの解析を自動化および効率化するために設計された、オープンソースのRパッケージおよびShinyウェブアプリケーションであるCurvanaを紹介しており、プログラミングの専門知識や複雑なローカル環境の構築を必要とせずに、生のデータを意味のある相互作用指標へと変換するためのユーザーフレンドリーなソリューションを提供する。

Yue Zhang, Zhaoyang Wang, Xitong Liu2026-06-29
🧬 biology

Hierarchically supervised computational pathology stratifies HER2 categories and ERBB2 amplification risk from routine H&E slides in breast cancer

本論文は、臨床検査のロジックをそのアーキテクチャに組み込むことで、従来のモデルの限界を克服し、リソース集約的な確認試験の必要性を低減する、日常的なH&Eスライドを利用してHER2カテゴリーを正確に層別化しERBB2増幅リスクを予測する階層的教師あり計算病理学フレームワークであるCHERISHを導入するものである。

Xiaohua Zeng, Yansong Ba, Long Wang, Xiaomin Xiong, Xin Zhou, Qingming Jiang, Sihao Liu, Shanqi Li, Zhigang Pei, Tao Zha (…)2026-06-29
🧬 biology

Causal Responsibility Based Explainable AI for Vibrational Spectroscopy Applied to Cancer Diagnostics

本論文は、がん診断における振動分光法のための因果的責任に基づく説明可能なAI手法であるSpec-ReXを紹介し、透明性の高い臨床的意思決定に対する極めて重要なニーズに対処するため、in silico、in vitro、およびex vivoのデータセットにわたる他のXAI技術に対するその性能を厳密に検証するものである。

Nathan Blake, David Kelly, Sarah Kapllani-Mucaj, Rong Wang, Geraint Thomas, Hana Chockler2026-06-29
🧬 biology

Cohesin-mediated replication fork tethering enables fork slowing and reversal

本研究は、コヒーシンによるループ押し出しが、PRIMPOLを阻害することによって隣接する複製フォークを繋ぎ止め、複製ストレス下におけるそれらの減速と逆行を促進し、それによってゲノム構成とDNA損傷耐性を統合してゲノムの安定性を保護することを明らかにしている。

Massimo Lopes, Daniel González Acosta, Daniel Giménez-Llorente, Melani Rodrigues, Moses Aouami, Orhi Barroso-Gomila, Jav (…)2026-06-29
🧬 biology

The Artemis I mission reshaped seed amino acid composition and post-flight plant growth in a genotype-dependent manner

アルテミスIミッションは、シロイヌナズナにおける種子の種のアミノ酸プロファイルおよび飛行後の成長に遺伝子型依存的な変化を誘発し、分岐鎖アミノ酸代謝が深宇宙曝露に対する植物の応答に影響を与える重要な要因であることを明らかにした。

Joanne E Thomson, Evan Angelos, Ramona Gaza, Dinah Dimapilis, Ye Zhang, Kamber Scott, James O’Keefe, Federica Brandizzi2026-06-29
🧬 biology

Genetic dissection of dynamic leaf area index variation in maize using UAV-based phenotyping and time-series genome-wide association studies

本研究は、UAVを用いたマルチスペクトル表現型解析と時系列ゲノムワイド関連解析を統合した強固な枠組みを確立し、トウモロコシの葉面積指数を制御する動的な遺伝子座および候補遺伝子である*Zm00001d048615*を特定することで、キャノピー構造および収量の向上に向けた価値ある標的を提示するものである。

Xuyang Wang, Jiaojiao Ren, Penghao Wu2026-06-29
🧬 biology

Sustained transcription and permissive chromatin in murine spermiogenesis

本研究は、精子形成過程においてゲノム全体が転写抑制されるという長年の見解に対し、半数体のゲノムがこの段階を通じて転写活性を維持し、動的に構成されていることを示すことで、後期精細胞の分化を、転写の停止ではなく転写の特異化の期間として再定義する必要性を提示している。

Bing Li, Yimin Lao, Jingdong Xue, Yixuan Pan, Mengyuan Peng, Qi Zhang, Ming Yu, Lijuan He, Meiyang Liu, Mingqian Hu, Yuq (…)2026-06-29