🧬 生物学

Brain-inspired cascaded EEG speech decoding with conformal calibration and adaptive exit: simulation validation and five-stage real-data assessment

本論文は、統計的に厳密な不確実性定量化と堅牢なリアルタイム性能を実現するために、適合的較正(conformal calibration)を適応的脱出メカニズムおよびGibbs–Candès適応的適合推論と統合した、脳に着想を得たカスケード型EEG音声デコーディング・フレームワークを提案し、検証するものであり、同時に、被覆失敗の系統的な診断を行い、信頼性の高い神経音声トラッキングのための手法論的ベースラインを確立するものである。

daqian chen2026-09-25
🧬 生物学

External Transportability and Tissue Context of Parsimonious Breast Tumour-Normal Transcriptomic Score

本研究は、簡潔な乳癌腫瘍・正常トランスクリプトーム・スコアが、高い外部識別能を維持しつつも、単なる移植可能な悪性細胞シグネチャーではなく、主に正常な脂肪および脂質代謝プログラムの消失を捉えていることを示しており、分類器の移植性における組織コンテキストの極めて重要な役割を浮き彫りにしている。

Subhajit Ghosh, Abhirup Saha, Vetrivel Baskar2026-09-25
🧬 生物学

An Explainable XGBoost Framework for Anxiety and Depression Risk Prediction with SHAP and Counterfactual Reasoning

本研究は、クラス不均衡と評価の厳密さに対処しつつ、臨床診断に取って代わるものではない透明かつ解釈可能な洞察を提供するために、SHAPと反事実的推論を統合した、不安およびうつ病のリスクを予測するための説明可能なXGBoostフレームワークを提示するものである。

Anima Dahal, Bibash Basnet2026-09-25
🧬 生物学

A high-quality chromosome-level genome assembly and annotation of the Gansu Red Deer (Cervus elaphus kansuensis)

本研究は、固有種であり国家保護種でもあるガンスアカシカ(Cervus elaphus kansuensis)の高品質な染色体レベルのリファレンスゲノムアセンブリおよびアノテーションを提示するものであり、その遺伝的多様性、進化史、および保全に関する将来の研究を推進するための極めて重要なゲノムリソースを提供するものである。

Hai Liu, Yun Fang, Xiaochan Bai, Zuoqing Yan, Qingling Wa, Nan Sun, Guogang Li2026-09-25
🧬 生物学

HiDAC: A Hierarchical Dictionary-Aided Compression Framework for Genomic Sequences

本論文は、競争力のあるDNA圧縮率を実現しつつ、完全な展開を行うことなく圧縮されたトークン化表現に対して部分文字列頻度クエリなどのダウンストリーム解析を大幅に高速化することを可能にする、階層的辞書補助型圧縮フレームワークであるHiDACを提案している。

Manthan Shah, Rahul Semwal, Imlimaong Aier, Prabhat Tripathi, Pritish Kumar Vardwaj2026-09-25
🧬 生物学

Carbon-Convergent Co-utilization of Ethanol and CO2 Enables 3-Hydroxypropionate Biosynthesis in Komagataella phaffii

本研究は、エタノールとCO2を共消費する還元補完的な「2+1」戦略を利用することで、エンジニアリングされた*Komagataella phaffii*が3-ヒドロキシプロピオン酸の記録的なデノボ生産を達成し、未精製の化学的CO2還元ストリームを高価値な多炭素生成物へと転換することに成功したことを実証している。

Jianming Liu, Tong Liu, Hanbin Lei, Zhiqiang Chen, Yudian Zhu, yongjun mao, Jiacheng Feng, An-ping Zeng2026-09-25
🧬 生物学

LucaCell: a sequence-centric foundation model for cross-species single-cell analysis

LucaCellは、固定された遺伝子識別子の代わりに学習済みmRNA配列エンベディングを利用することで、正確な細胞型転送、微生物種の分化、およびホスト・ウイルス相互作用の予測を含む、堅牢な種間、モード間、およびコンテキスト間シングルセル解析を可能にするシーケンス中心の基盤モデルである。

Yan Sun, Yong He, Minsi Ren, Yanhui Wang, Penghao Xu, Yong Hou, Yu Kang, Tingjun Hou, Jieping Ye, Huanming Yang, Zheng W (…)2026-09-25
🧬 生物学

The meaning and interpretation of ALFF and fALFF

本論文は、ALFFが基底代謝に関連している一方で、fALFFは神経活動よりもむしろ信号対雑音比や撮像パラメータを主に反映する、限定的かつ飽和的な関数であり、その結果、異なるプロトコルを用いた研究間での比較は不可能であるということを立証している。

John Gore, Tzu-Wei Lee, Muwei Li, Warren W. Boschen, Kurt G. Schilling, Adam. W. Anderson, Zhaohua Ding, Yurui Gao2026-09-25
🧬 生物学

First de novo Transcriptome Assembly of Litylenchus crenatae, the Causal Agent of Beech Leaf Disease

本研究は、ブナ葉枯病の原因となる線虫である*Litylenchus crenatae*の初の*de novo*トランスクリプトーム・アセンブリおよびアノテーションを提示するものであり、この新興の森林病原体の分子メカニズムに関する将来の研究を促進するための基礎的なゲノムリソースを提供するものである。

Andrew Miles, Cecilia Chagas de Freitas, Christopher G. Taylor, Pierluigi Bonello2026-09-25
🧬 生物学

Integrative Re-analysis of miRNA–mRNA Regulatory Networks and Functionally Enriched Pathways in Triple-Negative Breast Cancer

本研究は、公開されているトリプルネガティブ乳がんデータセットの統合的な再解析を提示し、689個のmiRNA-mRNA相互作用からなる制御ネットワークを構築し、最終的にCCNA2、CXCL11、およびFN1といった主要な遺伝子へと収束する9つの優先経路へと知見を絞り込むことで、将来的な実験的検証のための枠組みを提供するものである。

Rahul Kota2026-09-25