Disentangling Loss Design and Ontology-Aware Architecture in GNN-Based Protein Function Prediction A Controlled Ablation Study
この制御されたアブレーション研究は、GNNベースのタンパク質機能予測において、提案された情報集積(Information Accretion)を考慮した損失関数は逆効果である一方で、GCNアーキテクチャとクロスオントロジー・アテンションおよび標準的なバイナリクロスエントロピー損失を組み合わせることによって最適な性能が達成されることを明らかにしている。