🧬 biology

Hierarchically supervised computational pathology stratifies HER2 categories and ERBB2 amplification risk from routine H&E slides in breast cancer

本論文は、臨床検査のロジックをそのアーキテクチャに組み込むことで、従来のモデルの限界を克服し、リソース集約的な確認試験の必要性を低減する、日常的なH&Eスライドを利用してHER2カテゴリーを正確に層別化しERBB2増幅リスクを予測する階層的教師あり計算病理学フレームワークであるCHERISHを導入するものである。

Xiaohua Zeng, Yansong Ba, Long Wang, Xiaomin Xiong, Xin Zhou, Qingming Jiang, Sihao Liu, Shanqi Li, Zhigang Pei, Tao Zha (…)2026-06-29
🧬 biology

Causal Responsibility Based Explainable AI for Vibrational Spectroscopy Applied to Cancer Diagnostics

本論文は、がん診断における振動分光法のための因果的責任に基づく説明可能なAI手法であるSpec-ReXを紹介し、透明性の高い臨床的意思決定に対する極めて重要なニーズに対処するため、in silico、in vitro、およびex vivoのデータセットにわたる他のXAI技術に対するその性能を厳密に検証するものである。

Nathan Blake, David Kelly, Sarah Kapllani-Mucaj, Rong Wang, Geraint Thomas, Hana Chockler2026-06-29
🧬 biology

Cohesin-mediated replication fork tethering enables fork slowing and reversal

本研究は、コヒーシンによるループ押し出しが、PRIMPOLを阻害することによって隣接する複製フォークを繋ぎ止め、複製ストレス下におけるそれらの減速と逆行を促進し、それによってゲノム構成とDNA損傷耐性を統合してゲノムの安定性を保護することを明らかにしている。

Massimo Lopes, Daniel González Acosta, Daniel Giménez-Llorente, Melani Rodrigues, Moses Aouami, Orhi Barroso-Gomila, Jav (…)2026-06-29
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The Artemis I mission reshaped seed amino acid composition and post-flight plant growth in a genotype-dependent manner

アルテミスIミッションは、シロイヌナズナにおける種子の種のアミノ酸プロファイルおよび飛行後の成長に遺伝子型依存的な変化を誘発し、分岐鎖アミノ酸代謝が深宇宙曝露に対する植物の応答に影響を与える重要な要因であることを明らかにした。

Joanne E Thomson, Evan Angelos, Ramona Gaza, Dinah Dimapilis, Ye Zhang, Kamber Scott, James O’Keefe, Federica Brandizzi2026-06-29
🧬 biology

Genetic dissection of dynamic leaf area index variation in maize using UAV-based phenotyping and time-series genome-wide association studies

本研究は、UAVを用いたマルチスペクトル表現型解析と時系列ゲノムワイド関連解析を統合した強固な枠組みを確立し、トウモロコシの葉面積指数を制御する動的な遺伝子座および候補遺伝子である*Zm00001d048615*を特定することで、キャノピー構造および収量の向上に向けた価値ある標的を提示するものである。

Xuyang Wang, Jiaojiao Ren, Penghao Wu2026-06-29
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Sustained transcription and permissive chromatin in murine spermiogenesis

本研究は、精子形成過程においてゲノム全体が転写抑制されるという長年の見解に対し、半数体のゲノムがこの段階を通じて転写活性を維持し、動的に構成されていることを示すことで、後期精細胞の分化を、転写の停止ではなく転写の特異化の期間として再定義する必要性を提示している。

Bing Li, Yimin Lao, Jingdong Xue, Yixuan Pan, Mengyuan Peng, Qi Zhang, Ming Yu, Lijuan He, Meiyang Liu, Mingqian Hu, Yuq (…)2026-06-29
🧬 biology

Daily symptom reports enable four-phase menstrual cycle tracking without wearables: Implications for equitable digital health

本研究は、ウェアラブルセンサーを用いず、日々の自己申告による症状の変動を活用したハイブリッド機械学習モデルが、月経周期の4つのフェーズを正確に分類できることを実証しており、世界の生殖健康モニタリングにおける拡張可能かつ公平なソリューションを提供するものである。

Bernhard Specht, Mohammad EL-Khozondar, Samaher Garbaya, Reinhard Schneider, Djamel Khadraoui, Zied Tayeb2026-06-29
🧬 biology

Efficient exploration of conformational ensembles via protein interaction-informed deep learning

本論文は、タンパク質複合体の相互作用に基づいて学習された生成ディープラーニングフレームワークであるDynoMを紹介するものであり、これは複合体データに内在する長距離の物理的制約を活用することで、正確なコンフォメーションアンサンブルの予測および構造的ハルシネーションの抑制において、既存のモノマーのみのモデルを大幅に上回る性能を発揮する。

Zilin Ren, Duo Liu, Qianyi Jia, Qiantong Jin, Yubin Liu, Chan Liu, Zhixiang Sui, Luyao Han, Yixiang Zhang, Xin Yang, Pin (…)2026-06-29
🧬 biology

Delayed downstream detection and persistence of fish eDNA in a low-flow stream: a field observation

本研究は、低流量の河川において、魚類のeDNAシグナルが下流への出現に遅延を示し、かつ供給源となる生物が除去された後もしばらくの間持続するというフィールド証拠を提供しており、流動的な生態系におけるeDNAデータの解釈において、輸送力学と時間的持続性を考慮する必要性を強調している。

KeonHee Kim, KyuJin Kim, JongWook Kim, JaeGoo Kim, Ji-Woong Choi, Min-Ho Jang2026-06-29