🧬 生物学

Intratumor Heterogeneity Through the Lens of Gene Regulatory Networks

複数の癌種および治療コホートにわたるscRNA-seqデータを解析することにより、本研究は、腫瘍クローンが適応度に関連する異なる調節アーキテクチャを示すことを実証するためにクローン特異的な遺伝子制御ネットワークを推論し、治療によって誘発される再構築が構造的な分岐と機能的な収束を駆動する一方で、最終的に患者の生存に関連する保存された、あるいは可変的なレギュロンを明らかにしている。

Narein Rao, Nicolae Sapoval, Luay Nakhleh, Hamim Zafar2026-10-23
🧬 生物学

Deriving and Transferring the SPEARpesticide Bioindicator to a New Region: an Ecotoxicity-Based, Indigenous-Fauna Sensitivity Index Field-Validated in the Seomjin River, South Korea

本研究は、在来種20種の毒性データを統合することにより、韓国の蟾池江(ソムジンガン)における農薬特異的なバイオインジケーターの適応およびフィールド検証に成功し、有機汚染の勾配を制御することで、標準的な多様性指標では検出できない、指数と農薬曝露との間の強固な相関関係が明らかになることを示した。

Jong-Hyeon Lee, Jang-Yeon Park, Su-Hyun Kim, Seung-Been Heo2026-10-23
🧬 生物学

Scaffold Geometry Governs Mechanobiological Responses to Combined Biophysical Stimulation in Human Bone Tissue-Like Models

本研究は、スキャフォールドの幾何学的形状がヒト骨髄由来間葉系幹細胞の特定の生物物理学的刺激に対する感受性を決定づけることを示しているが、間欠的静水圧とパルス電磁界刺激を組み合わせることで、これらの幾何学的制限を克服し、相補的な分子経路を通じて初期の骨形成を相乗的に促進できることを示している。

Lia Rimondini, Farah Daou, Stefano Gabetti, Shahd Alahmad, Beatrice Masante, Elisa Scatena, Carlotta Achille, Cristina B (…)2026-10-23
🧬 生物学

Distinguishing insulators from enhancers by their ability to block long-range contacts using HiCAggR

本研究は、Hi-Cデータの高解像度集約を利用して、無秩序な長距離エンハンサー・プロモーター間接触を阻止する能力を定量化することでインスレーターとエンハンサーを区別するBioconductorパッケージであるHiCAggRを紹介し、インスレーターの枯渇が異常な接触と広範な遺伝子制御不全を引き起こすことを明らかにしている。

Naomi Schickele, Olivier Fosseprez, Robel Tesfaye, Charlène Perrois, Nicolas Chanard, Anne-Laure Finoux, Eldon Emberly (…)2026-10-23
🧬 生物学

ac4C Info: A database to parse N4-acetylocytidine(ac4C) epitranscriptome in multiple species

本論文は、ac4C修飾部位および疾患関連SNPのデータベースと、予測および変異の影響評価のための解析ツールを統合し、多種にわたるN4-アセチルシチジン・エピトランスクリプトームの研究を促進する包括的なウェブプラットフォームであるac4C Infoを紹介するものである。

Kang Zhang, Da Sun, Zimu Li, Jihong Xing, Jingao Dong2026-10-23
🧬 生物学

Normal mucosal fibroblast remodeling during carcinogenesis promotes initial submucosal invasion of early-stage colorectal carcinoma

本研究は、正常な粘膜線維芽細胞が、大腸がんの初期浸潤過程において、空間的に組織化された異なるがん関連線維芽細胞の状態へとリモデリングされること、そして平坦な腫瘍ほど、粘膜下層への早期浸潤を促進する腫瘍促進的線維芽細胞の状態への進行がより広範に起こっていることを明らかにしている。

Shuichi Tsukamoto, Takaaki Nakanishi, Takayuki Kodama, Manabu Shigeoka, Yu-ichiro Koma, Shingo Sakashita, Genichiro Ishi (…)2026-10-23
🧬 生物学

When past actions complicate new choices: A computational perspective on adaptive behavior

12の多様なデータセットにドリフト拡散モデルを適用することで、本研究は、過去の行動が、初期決定状態を要求される応答から遠ざけ、コミットメントのための証拠閾値を低下させることにより、過去と現在の要求が重複する場合に適応的な行動を損なう形で、一貫して後続の決定にバイアスをかけることを明らかにしている。

Nicolas Münster, Christian Frings, Christian Beste, Astrid Prochnow2026-10-23
🧬 生物学

The reassembly of plant-pollinator interactions along tropical forest succession

熱帯林の回復過程において、送粉者の個体数とネットワーク構造は回復力を維持し、農業景観における花粉流動を促進し続けるものの、特化した植物と送粉者の相互作用や原生林レベルのネットワークの複雑性の完全な復元は著しく遅れ、その再構築には数十年を要する。

Ugo Diniz, Alexander Keller, Gunnar Brehm, Claus Rasmussen, Katharina Veltman, Santiago Erazo, Santiago Burneo, Marco Ts (…)2026-10-23
🧬 生物学

Multiscale modeling: A mathematical-based tool for bioprocess design, control and scale up/down

本論文は、環境勾配と細胞応答の間の動的な双方向相互作用をシミュレートするために、マクロスケールのコンパートメントベースのバイオリアクター流体力学とマイクロスケールの速度論的代謝モデルを結合させたマルチスケール数学モデリングツールを提示し、それによってバイオプロセスの設計、制御、およびスケールアップを向上させるものである。

Moreno-Otalvaro Sebastian, Restrepo-Carmona Juan Esteban, Suarez-Mendez Camilo Alberto2026-10-23