🧬 biology
Empirical Length-at-Maturity for Northeast Atlantic Marine Fishes
本研究は、個体群、性別、および時期にわたる成熟スケジュールの高解像度な分析を可能にするため、21の漁業非依存調査における約160万件の個体記録から導出された、北大西洋の海洋魚類48種に関する3,607件の成熟時体長（L50）推定値の標準化されたデータセットを提示するものである。
🧬 Category
q-bio
3882 件の論文
🧬 biology
Neuroblastoma outcomes diverge along a shared regulatory axis
本研究は、神経芽細胞腫の患者を従来の臨床変数でマッチングさせた後、良好な転帰と不良な転帰が、非構造的な不均一性によってではなく、細胞周期プログラムを炎症および間葉系状態から分離する転写因子活性における強固で共通の双方向的調節軸によって区別されることを示しており、これは治療介入のための潜在的な標的を示唆している。
🧬 biology
Information arrival sets the minimum acquisition time in calcium imaging
本研究は、カルシウムイメージングにおける取得時間が、特定のタスクに必要な最小時間を決定するための逆設計問題として最適化可能であることを示しており、異なるインジケーターや条件下に合わせて調整されたプロトコルが特定の持続時間においてピーク性能に達し、それ以上の長時間取得は実際には推論精度を低下させることを明らかにしている。
🧬 biology
A Software Model of Chromatic Aberration Visual Feedback in the Eye: Exploring the Role of Near Work in Myopia Development
本研究は、長軸方向の色収差に基づくソフトウェアモデルを用いて、近接作業の継続がいかに視覚フィードバック機構を通じて近視を誘発するかを実証するとともに、レンズ補正に関する既存の理論を検証し、近視の発症および進行を抑制するための、デジタル画面上の青色光をわずかにぼかすという新たな戦略を提案するものである。
🧬 biology
Endothelial RANK signaling triggers bone marrow inflammaging through IL-1β expression
本研究は、血管内皮細胞におけるRANKシグナルが、IL-1βの発現を誘導することで骨髄のインフラメイジングング（炎症性老化）の決定的な要因となり、それが老化細胞の蓄積、造血幹細胞の機能不全、および骨髄系への偏った造血をもたらすことを特定しており、それによって加齢に伴う疾患に対する潜在的な治療標的を提示している。
🧬 biology
Parkinson's disease-associated LRRK2 G2019S enhances intestinal neutrophil extracellular trap formation through RAB10–myeloperoxidase signaling and promotes enteric α-synuclein accumulation
本研究は、パーキンソン病に関連するLRRK2 G2019S変異が、キナーゼ依存的なRAB10–ミエロペルオキシダーゼ・シグナル伝達軸を介した過剰な好中球細胞外トラップ形成を誘導することにより、腸管炎症および腸管内α-シヌクレインの蓄積を悪化させることを実証している。
🧬 biology
MitoSeqGen: a constrained generative transformer for mammalian mitochondrial mRNA codon optimization
MitoSeqGenは、大規模な脊椎動物のミトコンドリア・データセットで学習された新しい制約付き生成トランスフォーマーであり、独自のミトコンドリア遺伝暗号下でのタンパク質の正確性を100%保証しつつ、天然のコドン配列に対する優れた類似性を達成することで、既存のコドン最適化モデルを凌駕しています。
🧬 biology
Machine learning implementation for host-based infectious disease diagnostics
21件の研究（2020年〜2025年）を対象としたこの系統的レビューは、宿主ベースの感染症診断における54の機械学習モデルを評価しており、ランダムフォレストやニューラルネットワークが最も一般的なアルゴリズムである一方で、単一のモデルが普遍的に最適であることはなく、将来的な臨床応用には標準化された報告、外部妥当性の検証、および文脈に応じたアルゴリズムの選択が必要であることを明らかにしている。
🧬 biology
DeepCNet: A multimodal deep learning model for predicting cell type-specific gene expression and promoter-enhancer interactions from single-cell multiome data
DeepCNetは、シングルセルマルチオームデータを活用して細胞型特異的な遺伝子発現を正確に予測し、プロモーター・エンハンサー間の調節相互作用を推論することで、転写因子遺伝子制御ネットワークの構築およびアルツハイマー病のような疾患における条件特異的な調節変化の特定を可能にする、新しいマルチモーダル深層学習フレームワークである。
🧬 biology
Language development and pro-inflammatory IL-6/IL-10 imbalance in SARS-CoV-2-exposed pregnancies
スペインにおけるパンデミック期に生まれた子供を対象としたこの研究では、胎児期のSARS-CoV-2への曝露自体は18か月時点での言語遅滞を一様に予測するものではないものの、曝露された妊娠期における炎症促進的なIL-6/IL-10の不均衡が、特に女子において、困難な動詞や発声といった特定の言語領域におけるパフォーマンスの低下と関連していることが示されている。