Uncovering Functional Distant Mutations by Ultra-High-Throughput Screening of Dehalogenases
이 논문은 초고처리량 유세포 분석 (FADS) 을 통해 탈할로겐화 효소 LinB 의 활성 부위에서 멀리 떨어진 돌연변이를 발굴하여, 효소의 구조적 유연성과 기질 접근성을 조절하는 역동적 적응 메커니즘을 규명했음을 보여줍니다.
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biochemistry
376 편의 논문
Chiral methionine oxidation reagents reveal stereospecific proteome modifications
이 연구는 키랄 산화제인 엔안티오머 옥사지리딘을 개발하여 메티오닌 산화 부위의 입체 특이성을 규명하고, 특정 입체구조의 메티오닌 산화가 단백질 기능 조절 및 산화 스트레스 반응에 미치는 영향을 입증했습니다.
Integrative Structural Modeling of Intrinsically Disordered Regions in a Human HDAC2 Chromatin Remodeling Complex
이 논문은 실험적 교차결합 데이터와 계산 모델링 기법을 통합하여 알파폴드 단독 분석으로는 규명되지 않은 HDAC2, MIER1, MHAP1 복합체의 본질적 무질서 영역 (IDR) 기반 3 차원 구조를 성공적으로 규명했습니다.
Structural, biophysical, and virological mechanistic characterization of HIV-1 capsid-targeting antivirals
이 연구는 HIV-1 캡시드를 표적으로 하는 항바이러스제인 PF74 의 특정 부위를 화학적으로 변형하여 항바이러스 효능, 캡시드 안정성 및 결합 친화력을 향상시킨 새로운 유도체를 개발하고, 이를 통해 임상 적용 가능한 차세대 캡시드 표적 항바이러스제 설계에 대한 통찰을 제공했습니다.
A comparative investigation of the mannose binding interface in DC-SIGN and MRC1 carbohydrate recognition domains with all-atom molecular dynamics simulations
이 논문은 분자 동역학 시뮬레이션을 통해 DC-SIGN 과 MRC1 수용체의 만노스 결합 인터페이스를 비교 분석하여, MRC1 에서만 접근 가능한 특정 결합 상태가 더 높은 친화력을 결정하며, 이를 통해 망막모세포종 치료에 적합한 선택적 만노스 기반 리간드 설계의 기초를 제공함을 보여줍니다.
Multi-Objective Engineering of Fibrin-Selective Thrombolytic Proteases with Enhanced Biocatalytic Efficiency and Inhibition Resistance
이 논문은 컴퓨터 설계, 진화적 재구성 및 문헌 기반 변이 선정을 결합한 다목적 엔지니어링 전략을 통해 알테플라제 및 텐네크테플라제와 같은 기존 약물의 한계를 극복하고, 섬유소 선택성, 억제제 저항성 및 생체 내 효능이 동시에 향상된 차세대 혈전 용해 효소 '브노트플라제 (Brnoteplase)'를 개발하여 출혈성 합병증을 줄이면서 혈전 용해 및 재관류를 효과적으로 증진시켰음을 보고합니다.
Discovery of a FANCD2-interacting protein motif (DIP-box) linking DNA Damage Response processes
이 논문은 FANCD2 가 보존된 산성 영역을 통해 DNA 수리 단백질, 히스톤 변형 및 RNA 처리 인자와 상호작용하는 새로운 모티프 (DIP-box) 를 발견함으로써 DNA 가교 결합 수리에서 FANCD2 의 핵심적인 허브 역할을 구조적으로 규명했다고 요약할 수 있습니다.
Strand-independent degradation of uncoupled forks by EXO1 activates ATR and restrains synthesis
이 연구는 Xenopus 달걀 추출물을 이용해 복제 포크의 분리 시 EXO1 이 5 말단 (지연 가닥) 을 선택적으로 분해하여 ATR 체크포인트를 활성화하고 복제 속도를 억제하는 반면 3 말단 (주도 가닥) 은 안정적으로 유지됨을 규명했습니다.
Structural and cellular insights into the inhibition of the drug efflux activity of the HEDGEHOG receptor PATCHED1
이 연구는 크라이오 전자현미경을 이용해 PAH 가 PTCH1 의 콜레스테롤 결합 부위에 결합하여 약물 배출 기능을 억제하는 분자적 기전을 규명함으로써, 항암제 내성 극복을 위한 차세대 억제제 개발의 구조적 기반을 마련했습니다.
Structural dynamics between Argonaute-2 and CK1α promote target RNA release in microRNA-mediated silencing
이 논문은 miRNA 매개 침묵 과정에서 CK1α에 의한 Ago2 의 인산화가 표적 RNA 의 방출과 RISC 의 재순환을 촉진하는 구조적 역학 기작을 규명했습니다.
c-di-AMP inactivates a K+/H+ antiporter in Bacillus subtilis
이 연구는 Bacillus subtilis 의 K+/H+ 역수송체인 CpaA 가 c-di-AMP 에 의해 불활성화됨을 구조 및 기능 분석을 통해 규명함으로써, 세균의 삼투압 조절을 위한 K+ 기작의 c-di-AMP 의존적 조절이 기존에 알려진 것보다 더 복잡함을 보여주었습니다.
Highly Stable Mn(V)-Nitrido and Nitrogen-Atom Transfer Reactivity within a De Novo Protein
이 논문은 새로 설계된 단백질 스캐폴드 내에서 고가 Mn(V)-니트라이드 착물의 형성을 최초로 보고하고, 이 불안정한 중간체가 단백질 환경에 의해 안정화되어 비대칭 아지리딘화 반응에 촉매적으로 활용될 수 있음을 입증함으로써 질소 원자 전달 화학의 새로운 지평을 열었습니다.
Enhanced RNA Formation Under Amine-Rich Local Atmospheres from 2',3'- Cyclic Nucleotides
이 연구는 암모늄 및 알킬암모늄 이온이 존재하는 건조한 환경에서 2',3'-고리형 뉴클레오타이드로부터 RNA 가 중합되어 초기 생명 진화에 중요한 역할을 했을 가능성을 제시합니다.
Hydration and hydrolysis define antibiotic resistance conferred by macrolide esterases
이 연구는 4 가지 Est 형 마크로라이드 에스테라아제의 구조와 기능을 분석하여, 물 분자 케이지에 의한 비특이적 결합과 부정확한 기질 배치가 항생제 내성 기전의 핵심임을 규명함으로써 차세대 항생제 개발에 기여할 통찰을 제공했습니다.
Plasmin-mediated cleavage of GPIbα contributes to breakdown of platelet-von Willebrand factor complexes
이 연구는 플라스민이 VWF 를 직접 분해하는 것이 아니라 GPIbα를 절단하여 혈소판-VWF 복합체의 해체를 유도함을 보여주지만, 생체 내에서의 기여도는 제한적일 수 있음을 규명했습니다.
Structure of human aldehyde oxidase under tris(2-carboxyethyl)phosphine-reducing conditions
이 논문은 DTT 가 효소를 비가역적으로 불활성화시키는 반면 TCEP 는 활성을 유지하며 2.3Å 이상의 고해상도 결정을 생성하므로, hAOX1 의 구조 연구 및 시간 분해 결정학 적용을 위해 TCEP 를 DTT 의 대체 환원제로 사용해야 함을 보여줍니다.
Quaternary structure and activity of glutamate dehydrogenase are regulated by reversible S-palmitoylation and mitochondrial acyl-protein thioesterases.
이 연구는 글루타메이트 탈수소효소 (GDH) 가 가역적인 S-팔미토일화를 통해 헥사머 구조가 해체되고 효소 활성이 억제되며, 미토콘드리아 아실 - 단백질 티오에스테라아제 (APT1 및 ABHD10) 에 의해 이 과정이 역전되어 구조와 기능이 회복됨을 규명함으로써 미토콘드리아 지질 대사가 핵심 대사 효소의 조절에 관여함을 보여줍니다.
A human cell-free translation screen identifies the NT-2 mycotoxin as a ribosomal inhibitor that binds the peptidyl transferase center
이 연구는 인간 세포 무추출물 기반 고처리량 스크리닝을 통해 NT-2 곰팡이 독소가 펩티딜 전이 중심에 결합하여 진핵생물의 단백질 합성을 억제하는 새로운 리보솜 억제제임을 규명했습니다.
A crucial role for PIH1D1 in modulating p53 stability via the R2TP complex
이 논문은 R2TP 복합체의 구성 요소인 PIH1D1 이 p53 의 C 말단 도메인을 변경하지 않고 그 안정성을 조절함으로써 세포 주기를 통제하고 암 치료의 새로운 표적이 될 수 있음을 규명했습니다.
FoTO1 orchestrates Taxol biosynthesis through catalytic and non-catalytic mechanisms
본 논문은 Taxol 생합성 경로에서 FoTO1 이 촉매 작용과 비촉매적 기작 (P450 효소들의 조직화) 을 모두 통해 초기 단계의 수율을 획기적으로 향상시킴을 규명하고, 이것이 다양한 식물의 디테르펜 대사 경로에서 plastid 과 ER 간의 대사 매개체로서 보편적인 역할을 할 수 있음을 시사합니다.