🧬 biology
BARCODE: A Chromosome Karyotype Analysis Model Based on a Banding Code Framework
BARCODE는 비정상 샘플에 대한 학습 없이도 제로샷 구조적 이상 탐지와 정밀한 밴드 수준 국소화를 가능하게 하기 위해, 염색체 G-밴딩 패턴을 ISCN에 정렬된 기호 시퀀스로 변환하는 해석 가능하고 데이터 효율적인 이미지 투 시퀀스(image-to-sequence) 모델이다.
🧬 Category
q-bio
4194 편의 논문
🧬 biology
Identification of Macrophage Polarization-Related Genes as Biomarkers for Tendinopathy Based on Bioinformatics Analysis
본 연구는 세 가지 대식세포 분화 관련 유전자(PTCHD1, NEURL1, ST8SIA5)를 건병증의 강력한 진단 바이오마커로 식별 및 검증하였으며, 이들의 발현 저하, 면역 침윤과의 연관성, 주요 신호 전달 경로에 대한 관여, 그리고 잠재적 치료 표적으로서의 가능성을 밝혀냈다.
🧬 biology
Longitudinal multi-omic profiling of a pig-to-human lung xenograft reveals phased immune and tissue-remodeling responses
본 연구는 6개 유전자가 편집된 돼지-인간 폐 이종 이식편의 9일간의 단계적 면역 및 조직 재구성 반응을 규명하기 위해 종단적 멀티오믹스 프로파일링을 활용하며, 이를 통해 향후 공여체 공학 및 면역 억제 전략에 정보를 제공하는 보체 활성화, 골수세포 재구성, 상피 회복의 뚜렷한 분자적 특징을 밝혀냈다.
🧬 biology
Integrated Computational Design and Molecular Dynamics Evaluation of Novel siRNAs Targeting the Hemagglutinin Gene of Measles Virus
본 연구는 잠재적인 항바이러스 치료제 개발을 위해 홍역 바이러스의 보존된 헤마글루티닌 유전자를 표적으로 하는 세 가지 유망한 siRNA 후보 물질(S3, S4, S7)을 식별하고 검증하고자 분자 동역학 시뮬레이션과 도킹을 포함한 통합 계산 파이프라인을 활용하였다.
🧬 biology
Chromatin regulator perturbation causes heme pathway imbalance in yeast and human cells
이 연구는 특정 염색질 조절 인자를 교란하는 것이 헤무 생합성 경로의 전사적 균형을 무너뜨리며—특히 철에 의해 조절되는 말단 효소는 보존하면서 중간 단계 효소들에 특히 영향을 미침으로써—효모에서 독성 포르피린 축적을 유발하고 인간 암에서 헤무 불균형에 기여한다는 사실을 밝혀냈다.
🧬 biology
Developmental multi-omics reveals provenance-dependent regulatory and metabolic trajectories underlying geo-authenticity in Dendrobium officinale
본 연구는 발달 단계별 멀티오믹스(multi-omics)를 활용하여 산지 특이적 조절 네트워크와 대사 궤적이 어떻게 협력하여 천금란(*Dendrobium officinale*)의 지리적 진본성과 약효 품질을 확립하는지 규명함으로써, 해당 약재의 평가 및 활용을 위한 프레임워크를 제공한다.
🧬 biology
A new endemic species of Spermacoce L. 1753 (Equisetopsida: Gentianale: Rubiaceae) from Tamil Nadu, India: Spermacoce Venkatesalui
이 논문은 상세한 형태학적 분석을 통해 인도의 타밀나두주 벨리말라이 성스러운 숲(Vellimalai sacred grove)에 서식하는 새로운 심각한 멸종 위기 고유종인 *Spermacoce venkatesalui*를 기술하고, 이를 인접 종인 *S. hispida*와 구별하며 종합적인 분류학적 설명을 제공한다.
🧬 biology
Athletes exhibit distinct gut microbial signatures and predicted metabolic functions compared with sedentary adults
본 연구는 아시아인 경쟁 운동선수의 장기적인 운동 훈련이 더 높은 다양성, 유익한 분류군 농축, 그리고 향상된 대사 기능으로 특징짓는 더 건강한 장내 미생물군과 관련이 있음을 입증하며, 이는 운동 적응을 위한 잠재적 바이오마커를 식별하기 위해 머신러러닝 모델을 사용하여 비활동적인 개인과 정확하게 구별될 수 있다.
🧬 biology
A structurally and evolutionarily validated catalog of taxonomically restricted and de novo genes in the Anopheles gambiae species complex
본 연구는 교차 종 핵심 패밀리 프레임워크를 통해 조립 아티팩트와 상동성 탐지 실패를 극복함으로써, 아노펠레스 감비에(Anopheles gambiae) 종 복합체 내의 분류학적 제한 및 데 노보(de novo) 유전자에 대한 엄격하게 검증된 목록을 제시하며, 이러한 계통 특이적 혁신이 전사되고 제약되며 데 노보 유전자 탄생 모델과 일치하는 구조적 무질서 구배를 나타낸다는 점을 밝힌다.
🧬 biology
Single-cell analysis of pre-rRNA in Escherichia coli indicates distinct pathways of action for YbeX and YbeY proteins in ribosome biogenesis
단일 세포 분석 결과, YbeX와 YbeY 모두 리보솜 생합성에 관여하지만, 마그네슘 제한 조건에서 YbeX 결실은 개별 세포에 걸쳐 17S 전구-rRNA의 이질적인 축적을 일으켜 지연기를 유발하는 반면, YbeY 결실은 지수 성장기 동안 보다 균일한 전구-rRNA 축적을 초래하여 이들 단백질의 구별되는 작용 기전을 나타낸다는 것이 밝혀졌다.