🧬 biology
Worldwide diversity of hepatitis A and E viruses in urban wastewater
이 연구는 38개국의 62개 도시를 대상으로 하수 메타게놈 분석을 활용하여 헤파타이트 A 및 E 바이러스의 전 세계적 다양성을 지도화하였으며, 이를 통해 광범위한 인수공통적인 쥐 HEV 전파를 밝혀내고 인간 및 동물 헤파타이트 균주를 모니터링하는 데 있어 하수 감시의 가치를 입증하였다.
🧬 Category
q-bio
4404 편의 논문
🧬 biology
Multi-locus genome-wide association study reveals the genetic architecture of kernel fat content in maize
본 연구는 239개의 옥수수 근교계 계통을 대상으로 다중 유전자 좌위 전장 유전체 연관 분석을 수행하여 알곡 지방 함량의 유전적 구조를 규명하였으며, 200개의 유의미한 QTN을 식별하고 고유지 옥수수 육종을 위한 마커 보조 선발의 핵심 후보로서 엽록체 국소화 퀴논 산화환원효소 유전자인 *Zm00001d025166*을 우선순위화하였다.
🧬 biology
The first draft genome of the Amazonian manatee (Trichechus inunguis) provides insights into genome evolution and freshwater adaptation in Sirenia
본 연구는 아마존의 담수 전용 매너티(*Trichechus inunguis*)의 첫 초안 게놈을 제시하며, 해양 친척 종들보다 작은 게놈 크기를 밝혀내고, 아마존 환경에 대한 적응을 뒷받침할 가능성이 높은 G-단백질 결합 수용체 신호 전달, 이온 통로 및 산화 대사와 관련된 유전자 가족의 확장을 확인하였다.
🧬 biology
Ellagitannin corilagin targets V-ATPase B2 to restore lysosomal Ca²⁺-AMPK metabolic axis and suppress microglia-driven neuroinflammation in aging mice
코릴라진(Corilagin)은 V-ATPase B2를 직접적으로 표적하여 리소좀 Ca²⁺-AMPK 대사 축을 회복시킴으로써 미세아교세포의 과활성화를 억제하고 신경 기능을 보호하여 생쥐의 연령 관련 인지 결핍을 완화한다.
🧬 biology
On a Regulator-Centric Eligible Universe from Three Curated References, a Perturb-seq Edge Benchmark Has Too Few Evaluable Regulators to Resolve Direct-Edge Recovery from Matched Random
본 연구는 정제된 조절 참조 데이터와 측정된 유전자 간의 작은 중첩으로 인해 제약이 있는 현재의 Perturb-seq 벤치마크들이, 인과 추론 방법론이 매칭된 무작위 순위로부터 직접적인 조절 엣지를 성공적으로 복구하는지 여부를 구별할 수 있는 충분한 통계적 검정력을 결여하고 있음을 입증한다.
🧬 biology
Class-Support Mismatch Dominates Protocol-Driven Optimism in Spatial Transcriptomics, with a Larger Residual Penalty for Graph Neural Networks
본 연구는 공간 전사체학에서 무작위 교차 검증과 공간 교차 검증 사이의 성능 격차가 공간적 누출(spatial leakage)보다는 클래스 지원 불일치(class-support mismatches)에 의해 주로 발생한다는 점을 입증하며, 혼란 변수들이 엄격하게 통제되었을 때 그래프 신경망이 비그래프 분류기보다 유의미하게 더 큰 진정한 공간 외삽 페널티(genuine spatial-extrapolation penalty)를 입는다는 것을 밝혀낸다.
🧬 biology
An AI-Mechanistic Coagulation–Cardiovascular Framework for Reducing Arrhythmia Risk Under Vascular Stress
본 연구는 혈관 스트레스 상황에서 부정맥 위험을 줄이기 위한 유전자 전달 프로토콜의 안전성을 예측하기 위해 기계론적 ODE 모델과 LSTM 대리 모델을 결합한 자기 일관적이고 검증되지 않은 시뮬레이션 프레임을 제시하며, 만성적 치료 효과와 급성 전기 천공 손상을 명시적으로 구분하고 향후 실험적 검증의 필요성을 인정한다.
🧬 biology
Analysis of LRRK2 G2019S carriers in the All of Us research program database
All of Us 데이터베이스에 대한 이 연구는 파킨슨병 관련 LRRK2 G2019S 변이의 평생 침투율이 약 38%이며, 가족력이 주요 위험 인자로 확인되었고, 보호 효과가 있는 N551K-R1398H-K1423K 하플로타입과 같은 특정 유전적 조절 인자가 질병 발현에 영향을 미친다는 것을 밝혀냈다.
🧬 biology
Exploring the Interplay between Interoceptive Awareness and Social Cognition. A Network Analysis Study
건강한 성인 214명을 대상으로 한 이 네트워크 분석 연구는 신체 내부 감각 인지, 특히 그 중 조절 및 해석 차원이 인지적 공감과는 강력하고 직접적인 연결성을 보이는 반면, 마음 이론 및 얼굴 표정 인식과는 약하고 간접적인 연관성만을 보인다는 점을 밝힘으로써 사회적 인지에서 신체 내부 감각 인지가 갖는 다차원적이고 차별적인 역할을 강조한다.
🧬 biology
PanoMito: mapping mitochondrial heterogeneity from morphofunctional profiling to single-mitochondrion spatial transcriptomics
본 논문은 대규모 멀티모달 미토콘드리아 데이터셋과 딥러닝 프레임워크를 결합한 통합 툴박스인 PanoMito를 소개하며, 이를 통해 고정밀 세그멘테이션, 비지도 분류, 단일 미토콘드리아 공간 전사체 분석을 가능하게 함으로써 다양한 종에 걸쳐 미토콘드리아의 이질성과 형태-기능 관계를 체계적으로 매핑하기 위한 포괄적인 프레임워크를 구축한다.